MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	TTTA	2	8	87	94	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010063	TAAA	2	8	156	163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010063	TAAA	2	8	172	179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010063	TGTA	2	8	1591	1598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010063	TTTG	2	8	1888	1895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010063	TAAG	2	8	3116	3123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010063	ATTT	2	8	3141	3148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010063	TTTC	2	8	3802	3809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010063	TATT	2	8	3818	3825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010063	TTTC	2	8	3826	3833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010063	TTAT	2	8	4145	4152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010063	TAAT	2	8	5729	5736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010063	CATT	2	8	6015	6022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010063	AATT	2	8	6083	6090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010063	ATTC	2	8	6440	6447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010063	TAAC	2	8	6800	6807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010063	AAAT	2	8	7790	7797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010063	TATT	2	8	7893	7900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010063	TAAG	2	8	11143	11150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010063	AGCT	2	8	13973	13980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010063	TTCC	2	8	14998	15005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010063	ATCC	2	8	15823	15830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010063	AAAT	2	8	17260	17267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010063	ACTT	2	8	19133	19140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010063	TTTG	2	8	19437	19444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010063	AATT	2	8	19487	19494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010063	ATGT	2	8	19521	19528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010063	AAAC	2	8	19828	19835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010063	GATT	2	8	19943	19950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010063	AATC	2	8	21163	21170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010063	AATT	2	8	21334	21341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010063	ATAA	2	8	24186	24193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010063	TACC	2	8	24241	24248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010063	TATT	2	8	24360	24367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010063	TATT	2	8	24470	24477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010063	ATTG	2	8	25105	25112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010063	CATT	2	8	25878	25885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010063	AACG	2	8	25955	25962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010063	CATC	2	8	26941	26948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.