MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010063	AT	3	6	1906	1911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010063	GA	3	6	2060	2065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010063	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010063	AT	3	6	3647	3652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010063	AT	3	6	3683	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010063	TA	3	6	5523	5528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010063	TC	3	6	5598	5603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010063	AG	3	6	5620	5625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010063	TA	3	6	5824	5829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010063	AT	3	6	6037	6042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010063	AT	3	6	6115	6120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010063	AG	3	6	6955	6960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010063	TA	3	6	7459	7464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010063	AT	3	6	7628	7633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010063	TA	3	6	7752	7757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010063	AT	3	6	11075	11080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010063	TA	3	6	11239	11244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010063	TA	3	6	11880	11885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010063	TA	3	6	12267	12272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010063	CT	3	6	15623	15628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010063	AT	3	6	15867	15872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010063	AT	3	6	16365	16370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010063	CG	3	6	19006	19011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010063	AT	3	6	19173	19178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010063	CA	3	6	19323	19328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010063	AT	3	6	19857	19862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010063	GT	4	8	20174	20181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010063	AT	3	6	20374	20379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010063	TA	3	6	21196	21201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010063	AT	3	6	21218	21223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010063	AC	3	6	21362	21367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010063	TA	3	6	24218	24223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010063	TC	3	6	25129	25134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010063	TA	3	6	25219	25224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010063	AT	3	6	25255	25260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010063	AG	3	6	25896	25901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010063	CT	3	6	25914	25919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010063	TA	3	6	26053	26058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.