MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	TA	3	6	2182	2187	50 %	50 %	0 %	0 %	161510926
2	NC_010063	AT	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	161510927
3	NC_010063	AT	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	161510928
4	NC_010063	AG	3	6	4779	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	161510930
5	NC_010063	TA	3	6	5045	5050	50 %	50 %	0 %	0 %	161510930
6	NC_010063	TG	3	6	5304	5309	0 %	50 %	50 %	0 %	161510931
7	NC_010063	TA	3	6	5373	5378	50 %	50 %	0 %	0 %	161510931
8	NC_010063	AG	3	6	5447	5452	50 %	0 %	50 %	0 %	161510931
9	NC_010063	AT	3	6	9397	9402	50 %	50 %	0 %	0 %	161510934
10	NC_010063	AT	3	6	9454	9459	50 %	50 %	0 %	0 %	161510934
11	NC_010063	AT	3	6	9699	9704	50 %	50 %	0 %	0 %	161510934
12	NC_010063	TA	3	6	10768	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	161510935
13	NC_010063	AG	3	6	12191	12196	50 %	0 %	50 %	0 %	161510937
14	NC_010063	AT	3	6	12594	12599	50 %	50 %	0 %	0 %	161510938
15	NC_010063	TA	3	6	13101	13106	50 %	50 %	0 %	0 %	161510938
16	NC_010063	CG	3	6	14483	14488	0 %	0 %	50 %	50 %	161510939
17	NC_010063	TA	3	6	14894	14899	50 %	50 %	0 %	0 %	161510939
18	NC_010063	AT	3	6	15253	15258	50 %	50 %	0 %	0 %	161510940
19	NC_010063	GC	3	6	15265	15270	0 %	0 %	50 %	50 %	161510940
20	NC_010063	AT	3	6	15389	15394	50 %	50 %	0 %	0 %	161510940
21	NC_010063	AT	3	6	15414	15419	50 %	50 %	0 %	0 %	161510940
22	NC_010063	TA	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	161510941
23	NC_010063	AT	3	6	16967	16972	50 %	50 %	0 %	0 %	161510941
24	NC_010063	AT	3	6	17541	17546	50 %	50 %	0 %	0 %	161510942
25	NC_010063	AT	3	6	17794	17799	50 %	50 %	0 %	0 %	161510942
26	NC_010063	AT	3	6	17995	18000	50 %	50 %	0 %	0 %	161510942
27	NC_010063	AT	3	6	18381	18386	50 %	50 %	0 %	0 %	161510943
28	NC_010063	TA	3	6	20469	20474	50 %	50 %	0 %	0 %	161510944
29	NC_010063	AT	3	6	20976	20981	50 %	50 %	0 %	0 %	161510944
30	NC_010063	AC	3	6	22096	22101	50 %	0 %	0 %	50 %	161510945
31	NC_010063	TA	3	6	22158	22163	50 %	50 %	0 %	0 %	161510945
32	NC_010063	AG	3	6	24861	24866	50 %	0 %	50 %	0 %	161510947
33	NC_010063	TA	3	6	24923	24928	50 %	50 %	0 %	0 %	161510947
34	NC_010063	AT	3	6	26255	26260	50 %	50 %	0 %	0 %	161510950
35	NC_010063	CT	3	6	26443	26448	0 %	50 %	0 %	50 %	161510950

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.