MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	T	6	6	222	227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010063	A	6	6	462	467	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
3	NC_010063	A	7	7	485	491	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
4	NC_010063	A	7	7	968	974	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
5	NC_010063	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
6	NC_010063	A	7	7	1292	1298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010063	A	7	7	1457	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010063	T	7	7	1538	1544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010063	A	6	6	1558	1563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010063	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010063	T	6	6	2200	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	161510926
12	NC_010063	A	6	6	2240	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010063	T	6	6	2647	2652	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
14	NC_010063	T	7	7	2671	2677	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
15	NC_010063	T	6	6	2722	2727	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
16	NC_010063	T	7	7	2827	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
17	NC_010063	T	6	6	2843	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
18	NC_010063	T	6	6	2986	2991	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
19	NC_010063	T	6	6	3270	3275	0 %	100 %	0 %	0 %	161510928
20	NC_010063	T	7	7	3307	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	161510928
21	NC_010063	T	7	7	3462	3468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010063	A	6	6	3764	3769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010063	A	6	6	3858	3863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010063	A	7	7	3977	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	161510929
25	NC_010063	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010063	T	6	6	4574	4579	0 %	100 %	0 %	0 %	161510930
27	NC_010063	A	6	6	4787	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	161510930
28	NC_010063	T	6	6	5200	5205	0 %	100 %	0 %	0 %	161510931
29	NC_010063	A	6	6	5244	5249	100 %	0 %	0 %	0 %	161510931
30	NC_010063	A	6	6	5511	5516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010063	A	6	6	5761	5766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010063	T	6	6	6245	6250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010063	T	7	7	6299	6305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010063	A	6	6	7402	7407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010063	A	6	6	7591	7596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010063	A	6	6	7660	7665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010063	T	6	6	7745	7750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010063	T	8	8	8180	8187	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
39	NC_010063	T	6	6	8254	8259	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
40	NC_010063	T	6	6	8347	8352	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
41	NC_010063	T	6	6	8506	8511	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
42	NC_010063	T	8	8	8662	8669	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
43	NC_010063	T	6	6	8927	8932	0 %	100 %	0 %	0 %	161510934
44	NC_010063	A	7	7	9291	9297	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
45	NC_010063	A	8	8	9332	9339	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
46	NC_010063	A	6	6	9725	9730	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
47	NC_010063	T	7	7	9820	9826	0 %	100 %	0 %	0 %	161510934
48	NC_010063	A	6	6	10373	10378	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
49	NC_010063	A	6	6	10584	10589	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
50	NC_010063	A	6	6	10677	10682	100 %	0 %	0 %	0 %	161510935
51	NC_010063	A	6	6	10773	10778	100 %	0 %	0 %	0 %	161510935
52	NC_010063	T	6	6	11130	11135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010063	A	6	6	11184	11189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010063	A	6	6	11999	12004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010063	T	6	6	12023	12028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010063	A	6	6	12303	12308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010063	A	6	6	12704	12709	100 %	0 %	0 %	0 %	161510938
58	NC_010063	T	7	7	13217	13223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010063	T	7	7	13578	13584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010063	T	7	7	13867	13873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010063	A	6	6	14265	14270	100 %	0 %	0 %	0 %	161510939
62	NC_010063	A	6	6	14467	14472	100 %	0 %	0 %	0 %	161510939
63	NC_010063	T	6	6	14955	14960	0 %	100 %	0 %	0 %	161510939
64	NC_010063	T	6	6	15339	15344	0 %	100 %	0 %	0 %	161510940
65	NC_010063	T	6	6	15679	15684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010063	A	6	6	16344	16349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010063	T	6	6	16857	16862	0 %	100 %	0 %	0 %	161510941
68	NC_010063	T	7	7	17321	17327	0 %	100 %	0 %	0 %	161510942
69	NC_010063	A	6	6	17740	17745	100 %	0 %	0 %	0 %	161510942
70	NC_010063	T	6	6	17776	17781	0 %	100 %	0 %	0 %	161510942
71	NC_010063	T	9	9	18290	18298	0 %	100 %	0 %	0 %	161510943
72	NC_010063	T	6	6	18725	18730	0 %	100 %	0 %	0 %	161510943
73	NC_010063	A	6	6	18851	18856	100 %	0 %	0 %	0 %	161510943
74	NC_010063	A	6	6	19686	19691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010063	T	6	6	19787	19792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010063	A	6	6	20353	20358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010063	T	6	6	20866	20871	0 %	100 %	0 %	0 %	161510944
78	NC_010063	A	7	7	21227	21233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010063	T	6	6	21388	21393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010063	T	7	7	21498	21504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010063	A	6	6	21637	21642	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
82	NC_010063	A	6	6	21700	21705	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
83	NC_010063	A	7	7	22243	22249	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
84	NC_010063	A	6	6	22336	22341	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
85	NC_010063	T	6	6	22856	22861	0 %	100 %	0 %	0 %	161510945
86	NC_010063	A	6	6	22965	22970	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
87	NC_010063	A	6	6	23059	23064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010063	A	6	6	23566	23571	100 %	0 %	0 %	0 %	161510946
89	NC_010063	A	6	6	24350	24355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010063	A	6	6	25192	25197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010063	T	6	6	25378	25383	0 %	100 %	0 %	0 %	161510948
92	NC_010063	A	6	6	25437	25442	100 %	0 %	0 %	0 %	161510948
93	NC_010063	A	7	7	25662	25668	100 %	0 %	0 %	0 %	161510948
94	NC_010063	T	7	7	26208	26214	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950
95	NC_010063	T	6	6	26333	26338	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950
96	NC_010063	T	8	8	26637	26644	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950
97	NC_010063	T	6	6	26708	26713	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.