MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	A	6	6	462	467	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
2	NC_010063	A	7	7	485	491	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
3	NC_010063	A	7	7	968	974	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
4	NC_010063	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	161510925
5	NC_010063	T	6	6	2200	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	161510926
6	NC_010063	T	6	6	2647	2652	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
7	NC_010063	T	7	7	2671	2677	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
8	NC_010063	T	6	6	2722	2727	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
9	NC_010063	T	7	7	2827	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
10	NC_010063	T	6	6	2843	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
11	NC_010063	T	6	6	2986	2991	0 %	100 %	0 %	0 %	161510927
12	NC_010063	T	6	6	3270	3275	0 %	100 %	0 %	0 %	161510928
13	NC_010063	T	7	7	3307	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	161510928
14	NC_010063	A	7	7	3977	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	161510929
15	NC_010063	T	6	6	4574	4579	0 %	100 %	0 %	0 %	161510930
16	NC_010063	A	6	6	4787	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	161510930
17	NC_010063	T	6	6	5200	5205	0 %	100 %	0 %	0 %	161510931
18	NC_010063	A	6	6	5244	5249	100 %	0 %	0 %	0 %	161510931
19	NC_010063	T	8	8	8180	8187	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
20	NC_010063	T	6	6	8254	8259	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
21	NC_010063	T	6	6	8347	8352	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
22	NC_010063	T	6	6	8506	8511	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
23	NC_010063	T	8	8	8662	8669	0 %	100 %	0 %	0 %	161510933
24	NC_010063	T	6	6	8927	8932	0 %	100 %	0 %	0 %	161510934
25	NC_010063	A	7	7	9291	9297	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
26	NC_010063	A	8	8	9332	9339	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
27	NC_010063	A	6	6	9725	9730	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
28	NC_010063	T	7	7	9820	9826	0 %	100 %	0 %	0 %	161510934
29	NC_010063	A	6	6	10373	10378	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
30	NC_010063	A	6	6	10584	10589	100 %	0 %	0 %	0 %	161510934
31	NC_010063	A	6	6	10677	10682	100 %	0 %	0 %	0 %	161510935
32	NC_010063	A	6	6	10773	10778	100 %	0 %	0 %	0 %	161510935
33	NC_010063	A	6	6	12704	12709	100 %	0 %	0 %	0 %	161510938
34	NC_010063	A	6	6	14265	14270	100 %	0 %	0 %	0 %	161510939
35	NC_010063	A	6	6	14467	14472	100 %	0 %	0 %	0 %	161510939
36	NC_010063	T	6	6	14955	14960	0 %	100 %	0 %	0 %	161510939
37	NC_010063	T	6	6	15339	15344	0 %	100 %	0 %	0 %	161510940
38	NC_010063	T	6	6	16857	16862	0 %	100 %	0 %	0 %	161510941
39	NC_010063	T	7	7	17321	17327	0 %	100 %	0 %	0 %	161510942
40	NC_010063	A	6	6	17740	17745	100 %	0 %	0 %	0 %	161510942
41	NC_010063	T	6	6	17776	17781	0 %	100 %	0 %	0 %	161510942
42	NC_010063	T	9	9	18290	18298	0 %	100 %	0 %	0 %	161510943
43	NC_010063	T	6	6	18725	18730	0 %	100 %	0 %	0 %	161510943
44	NC_010063	A	6	6	18851	18856	100 %	0 %	0 %	0 %	161510943
45	NC_010063	T	6	6	20866	20871	0 %	100 %	0 %	0 %	161510944
46	NC_010063	A	6	6	21637	21642	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
47	NC_010063	A	6	6	21700	21705	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
48	NC_010063	A	7	7	22243	22249	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
49	NC_010063	A	6	6	22336	22341	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
50	NC_010063	T	6	6	22856	22861	0 %	100 %	0 %	0 %	161510945
51	NC_010063	A	6	6	22965	22970	100 %	0 %	0 %	0 %	161510945
52	NC_010063	A	6	6	23566	23571	100 %	0 %	0 %	0 %	161510946
53	NC_010063	T	6	6	25378	25383	0 %	100 %	0 %	0 %	161510948
54	NC_010063	A	6	6	25437	25442	100 %	0 %	0 %	0 %	161510948
55	NC_010063	A	7	7	25662	25668	100 %	0 %	0 %	0 %	161510948
56	NC_010063	T	7	7	26208	26214	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950
57	NC_010063	T	6	6	26333	26338	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950
58	NC_010063	T	8	8	26637	26644	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950
59	NC_010063	T	6	6	26708	26713	0 %	100 %	0 %	0 %	161510950

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.