MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM300

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010010	ACAT	2	8	1060	1067	50 %	25 %	0 %	25 %	161376720
2	NC_010010	TTTA	2	8	1443	1450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010010	CCCT	2	8	1499	1506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_010010	TTTC	2	8	1770	1777	0 %	75 %	0 %	25 %	161376721
5	NC_010010	TCCG	2	8	1988	1995	0 %	25 %	25 %	50 %	161376721
6	NC_010010	ATTA	2	8	2031	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	161376721
7	NC_010010	ACCG	2	8	2092	2099	25 %	0 %	25 %	50 %	161376721
8	NC_010010	ACTT	2	8	2121	2128	25 %	50 %	0 %	25 %	161376721
9	NC_010010	AATT	2	8	2434	2441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010010	GAAT	2	8	2465	2472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010010	GAAG	2	8	2623	2630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010010	TTTA	2	8	2943	2950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010010	TAAA	2	8	2962	2969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010010	TAAG	2	8	3978	3985	50 %	25 %	25 %	0 %	161376722
15	NC_010010	TAGT	2	8	4181	4188	25 %	50 %	25 %	0 %	161376722
16	NC_010010	AAAT	2	8	4749	4756	75 %	25 %	0 %	0 %	294672681
17	NC_010010	AAAC	2	8	4788	4795	75 %	0 %	0 %	25 %	294672681
18	NC_010010	TGGA	2	8	5306	5313	25 %	25 %	50 %	0 %	294672681
19	NC_010010	AATT	2	8	5549	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	294672681
20	NC_010010	CCTT	2	8	5662	5669	0 %	50 %	0 %	50 %	294672681
21	NC_010010	ACCT	2	8	5823	5830	25 %	25 %	0 %	50 %	294672681
22	NC_010010	GATA	2	8	6116	6123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010010	ATTT	2	8	6641	6648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010010	TTTG	2	8	7366	7373	0 %	75 %	25 %	0 %	161376725
25	NC_010010	TTTG	2	8	7411	7418	0 %	75 %	25 %	0 %	161376725
26	NC_010010	AATA	2	8	8595	8602	75 %	25 %	0 %	0 %	294672683
27	NC_010010	AATT	2	8	8626	8633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010010	AATT	2	8	8820	8827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010010	AAAT	2	8	10531	10538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010010	ATAA	2	8	10574	10581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010010	ATGT	2	8	10628	10635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010010	TAAA	2	8	11724	11731	75 %	25 %	0 %	0 %	294672689
33	NC_010010	TTGC	2	8	11841	11848	0 %	50 %	25 %	25 %	161376728
34	NC_010010	TTCC	2	8	11925	11932	0 %	50 %	0 %	50 %	161376728
35	NC_010010	TTTA	2	8	12057	12064	25 %	75 %	0 %	0 %	161376728
36	NC_010010	GCTC	2	8	12680	12687	0 %	25 %	25 %	50 %	161376728
37	NC_010010	GCAT	2	8	12952	12959	25 %	25 %	25 %	25 %	161376728
38	NC_010010	CAAA	2	8	13531	13538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010010	TTTG	2	8	13543	13550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010010	ATTC	2	8	13642	13649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010010	TTGG	2	8	13658	13665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010010	GATA	2	8	13668	13675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010010	AATC	2	8	13910	13917	50 %	25 %	0 %	25 %	161376729
44	NC_010010	ATTT	2	8	13972	13979	25 %	75 %	0 %	0 %	161376729
45	NC_010010	TTCT	2	8	14130	14137	0 %	75 %	0 %	25 %	161376729
46	NC_010010	TCAT	2	8	14321	14328	25 %	50 %	0 %	25 %	161376729
47	NC_010010	CCTT	2	8	15145	15152	0 %	50 %	0 %	50 %	161376731
48	NC_010010	CATT	2	8	15156	15163	25 %	50 %	0 %	25 %	161376731
49	NC_010010	TCTG	2	8	15602	15609	0 %	50 %	25 %	25 %	161376731
50	NC_010010	CATT	2	8	15792	15799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010010	AGTT	2	8	16046	16053	25 %	50 %	25 %	0 %	294672692
52	NC_010010	TTGC	2	8	16507	16514	0 %	50 %	25 %	25 %	294672693
53	NC_010010	AAAG	2	8	16811	16818	75 %	0 %	25 %	0 %	294672693
54	NC_010010	CTTT	2	8	17109	17116	0 %	75 %	0 %	25 %	294672694
55	NC_010010	TTCT	2	8	17654	17661	0 %	75 %	0 %	25 %	161376733
56	NC_010010	CGAG	2	8	17676	17683	25 %	0 %	50 %	25 %	161376733
57	NC_010010	ATAA	2	8	17794	17801	75 %	25 %	0 %	0 %	161376733
58	NC_010010	AAGA	2	8	18134	18141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010010	TAAA	2	8	18922	18929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010010	TTCA	2	8	18930	18937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010010	TGAA	2	8	18954	18961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010010	TTTA	2	8	18962	18969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010010	AAGA	2	8	19291	19298	75 %	0 %	25 %	0 %	294672697
64	NC_010010	GGGA	2	8	19315	19322	25 %	0 %	75 %	0 %	294672697
65	NC_010010	TAAA	2	8	19416	19423	75 %	25 %	0 %	0 %	294672697
66	NC_010010	ACTT	2	8	19601	19608	25 %	50 %	0 %	25 %	294672698
67	NC_010010	AATA	2	8	20938	20945	75 %	25 %	0 %	0 %	294672701
68	NC_010010	CTTT	2	8	21138	21145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010010	TATT	2	8	21689	21696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010010	AAAG	2	8	22275	22282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010010	TTCT	2	8	23818	23825	0 %	75 %	0 %	25 %	294672706
72	NC_010010	TCTT	2	8	24119	24126	0 %	75 %	0 %	25 %	294672706
73	NC_010010	CTTT	2	8	24215	24222	0 %	75 %	0 %	25 %	294672706
74	NC_010010	TCAT	2	8	24440	24447	25 %	50 %	0 %	25 %	294672706
75	NC_010010	AGAA	2	8	25862	25869	75 %	0 %	25 %	0 %	161376739
76	NC_010010	AAGT	2	8	26225	26232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010010	AATT	2	8	26318	26325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.