MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM300

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010010	CAA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
2	NC_010010	ACA	3	9	242	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
3	NC_010010	TGA	2	6	355	360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376720
4	NC_010010	AGA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
5	NC_010010	ACA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
6	NC_010010	ACA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
7	NC_010010	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
8	NC_010010	TTA	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376720
9	NC_010010	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376720
10	NC_010010	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376720
11	NC_010010	TAC	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
12	NC_010010	CTA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
13	NC_010010	AGA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
14	NC_010010	CAG	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376720
15	NC_010010	ATC	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
16	NC_010010	CAG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376720
17	NC_010010	AAT	2	6	1205	1210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376720
18	NC_010010	GAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
19	NC_010010	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
20	NC_010010	ATA	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010010	GAA	3	9	1663	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376721
22	NC_010010	AGA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376721
23	NC_010010	TGA	2	6	1737	1742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376721
24	NC_010010	TGA	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376721
25	NC_010010	GGA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161376721
26	NC_010010	GGA	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161376721
27	NC_010010	TTA	2	6	2227	2232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010010	ATT	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010010	TCT	2	6	2615	2620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010010	ATA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010010	CAT	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010010	ATT	2	6	2847	2852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010010	AGA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010010	GAG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010010	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
36	NC_010010	TAC	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376722
37	NC_010010	TAG	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376722
38	NC_010010	CCG	2	6	3823	3828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376722
39	NC_010010	ATA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376722
40	NC_010010	AGA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376722
41	NC_010010	ATT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
42	NC_010010	TTA	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
43	NC_010010	GAT	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376722
44	NC_010010	TGA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010010	ATG	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010010	AGC	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672681
47	NC_010010	TAA	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672681
48	NC_010010	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672681
49	NC_010010	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
50	NC_010010	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
51	NC_010010	GAA	2	6	5155	5160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
52	NC_010010	TAT	2	6	5213	5218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
53	NC_010010	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
54	NC_010010	TAT	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
55	NC_010010	TTA	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
56	NC_010010	TAT	2	6	5478	5483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
57	NC_010010	ATG	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672681
58	NC_010010	ATT	2	6	5702	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
59	NC_010010	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
60	NC_010010	CAT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672681
61	NC_010010	AGC	2	6	5904	5909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672681
62	NC_010010	AAC	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010010	ATA	2	6	6043	6048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010010	CAA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010010	ATT	2	6	6363	6368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010010	TTA	2	6	6388	6393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010010	GAA	2	6	6414	6419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010010	TAA	2	6	6474	6479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010010	CTT	2	6	6538	6543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010010	TCC	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161376725
71	NC_010010	ATT	2	6	6910	6915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376725
72	NC_010010	TCT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376725
73	NC_010010	TAA	3	9	6940	6948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376725
74	NC_010010	TGG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376725
75	NC_010010	ACG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376725
76	NC_010010	TGA	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376725
77	NC_010010	CGA	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376725
78	NC_010010	GTT	2	6	7218	7223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376725
79	NC_010010	AAC	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672682
80	NC_010010	ACT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672682
81	NC_010010	CCT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010010	TTA	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010010	ATA	3	9	7814	7822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010010	AGG	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010010	TTA	2	6	7855	7860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010010	ATT	2	6	7935	7940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010010	CTT	2	6	8023	8028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010010	GTT	2	6	8056	8061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010010	TTC	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010010	GCA	2	6	8213	8218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010010	TTG	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672683
92	NC_010010	TCT	2	6	8506	8511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672683
93	NC_010010	TAA	2	6	8554	8559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672683
94	NC_010010	TAA	2	6	8653	8658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010010	ACT	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010010	TCA	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010010	TAG	2	6	8848	8853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010010	ATT	2	6	8912	8917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010010	TAG	2	6	8946	8951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010010	CTT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010010	AAG	2	6	9007	9012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010010	TTG	2	6	9061	9066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672684
103	NC_010010	TTG	3	9	9076	9084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672684
104	NC_010010	CCA	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672684
105	NC_010010	CCT	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294672684
106	NC_010010	CAG	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
107	NC_010010	CAG	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
108	NC_010010	CAG	2	6	9684	9689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
109	NC_010010	CAG	2	6	9693	9698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
110	NC_010010	CAG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
111	NC_010010	CAG	2	6	9864	9869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
112	NC_010010	TGG	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672685
113	NC_010010	TAT	2	6	10158	10163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672685
114	NC_010010	AGT	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672685
115	NC_010010	CGT	2	6	10303	10308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672685
116	NC_010010	GGA	2	6	10376	10381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672685
117	NC_010010	GAT	3	9	10509	10517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010010	AAT	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010010	ACT	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010010	AAG	2	6	10609	10614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010010	AAC	2	6	10989	10994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672686
122	NC_010010	GTT	2	6	11013	11018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672686
123	NC_010010	TCA	2	6	11215	11220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672688
124	NC_010010	GTT	2	6	11244	11249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672688
125	NC_010010	CTT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672688
126	NC_010010	CAA	2	6	11718	11723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672689
127	NC_010010	TCT	2	6	11888	11893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
128	NC_010010	CTT	2	6	11996	12001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
129	NC_010010	ATC	2	6	12117	12122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376728
130	NC_010010	GCC	2	6	12385	12390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376728
131	NC_010010	TGC	2	6	12397	12402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
132	NC_010010	CTT	2	6	12440	12445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
133	NC_010010	GCC	2	6	12478	12483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376728
134	NC_010010	GTG	2	6	12545	12550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376728
135	NC_010010	GTT	2	6	12611	12616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376728
136	NC_010010	TGC	2	6	12673	12678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
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138	NC_010010	TGC	2	6	12912	12917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
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144	NC_010010	CAT	2	6	13263	13268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010010	TAC	2	6	13295	13300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_010010	TCC	2	6	13789	13794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_010010	CAA	2	6	13810	13815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_010010	CCA	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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262	NC_010010	AGA	2	6	22091	22096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010010	AGT	2	6	22108	22113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010010	ACA	2	6	22126	22131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_010010	TCC	2	6	22162	22167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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267	NC_010010	ACA	2	6	22219	22224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_010010	TTA	2	6	22228	22233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_010010	TTA	2	6	22293	22298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_010010	AAG	2	6	23278	23283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_010010	CTT	2	6	23306	23311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_010010	TAG	2	6	23323	23328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010010	AAC	2	6	23337	23342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_010010	GTT	2	6	23348	23353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010010	TTG	2	6	23464	23469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672706
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.