MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM300

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010010	CAA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
2	NC_010010	ACA	3	9	242	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
3	NC_010010	TGA	2	6	355	360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376720
4	NC_010010	AGA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
5	NC_010010	ACA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
6	NC_010010	ACA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
7	NC_010010	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
8	NC_010010	TTA	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376720
9	NC_010010	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376720
10	NC_010010	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376720
11	NC_010010	TAC	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
12	NC_010010	CTA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
13	NC_010010	AGA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
14	NC_010010	CAG	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376720
15	NC_010010	ATC	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
16	NC_010010	CAG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376720
17	NC_010010	AAT	2	6	1205	1210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376720
18	NC_010010	GAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
19	NC_010010	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
20	NC_010010	GAA	3	9	1663	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376721
21	NC_010010	AGA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376721
22	NC_010010	TGA	2	6	1737	1742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376721
23	NC_010010	TGA	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376721
24	NC_010010	GGA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161376721
25	NC_010010	GGA	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161376721
26	NC_010010	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
27	NC_010010	TAC	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376722
28	NC_010010	TAG	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376722
29	NC_010010	CCG	2	6	3823	3828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376722
30	NC_010010	ATA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376722
31	NC_010010	AGA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376722
32	NC_010010	ATT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
33	NC_010010	TTA	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
34	NC_010010	GAT	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376722
35	NC_010010	AGC	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672681
36	NC_010010	TAA	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672681
37	NC_010010	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672681
38	NC_010010	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
39	NC_010010	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
40	NC_010010	GAA	2	6	5155	5160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
41	NC_010010	TAT	2	6	5213	5218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
42	NC_010010	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
43	NC_010010	TAT	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
44	NC_010010	TTA	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
45	NC_010010	TAT	2	6	5478	5483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
46	NC_010010	ATG	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672681
47	NC_010010	ATT	2	6	5702	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
48	NC_010010	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
49	NC_010010	CAT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672681
50	NC_010010	AGC	2	6	5904	5909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672681
51	NC_010010	TCC	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161376725
52	NC_010010	ATT	2	6	6910	6915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376725
53	NC_010010	TCT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376725
54	NC_010010	TAA	3	9	6940	6948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376725
55	NC_010010	TGG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376725
56	NC_010010	ACG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376725
57	NC_010010	TGA	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376725
58	NC_010010	CGA	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376725
59	NC_010010	GTT	2	6	7218	7223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376725
60	NC_010010	AAC	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672682
61	NC_010010	ACT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672682
62	NC_010010	TTG	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672683
63	NC_010010	TCT	2	6	8506	8511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672683
64	NC_010010	TAA	2	6	8554	8559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672683
65	NC_010010	TTG	2	6	9061	9066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672684
66	NC_010010	TTG	3	9	9076	9084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672684
67	NC_010010	CCA	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672684
68	NC_010010	CCT	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294672684
69	NC_010010	CAG	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
70	NC_010010	CAG	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
71	NC_010010	CAG	2	6	9684	9689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
72	NC_010010	CAG	2	6	9693	9698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
73	NC_010010	CAG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
74	NC_010010	CAG	2	6	9864	9869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
75	NC_010010	TGG	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672685
76	NC_010010	TAT	2	6	10158	10163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672685
77	NC_010010	AGT	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672685
78	NC_010010	CGT	2	6	10303	10308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672685
79	NC_010010	GGA	2	6	10376	10381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672685
80	NC_010010	AAC	2	6	10989	10994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672686
81	NC_010010	GTT	2	6	11013	11018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672686
82	NC_010010	TCA	2	6	11215	11220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672688
83	NC_010010	GTT	2	6	11244	11249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672688
84	NC_010010	CTT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672688
85	NC_010010	CAA	2	6	11718	11723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672689
86	NC_010010	TCT	2	6	11888	11893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
87	NC_010010	CTT	2	6	11996	12001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
88	NC_010010	ATC	2	6	12117	12122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376728
89	NC_010010	GCC	2	6	12385	12390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376728
90	NC_010010	TGC	2	6	12397	12402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
91	NC_010010	CTT	2	6	12440	12445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
92	NC_010010	GCC	2	6	12478	12483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376728
93	NC_010010	GTG	2	6	12545	12550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376728
94	NC_010010	GTT	2	6	12611	12616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376728
95	NC_010010	TGC	2	6	12673	12678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
96	NC_010010	ATC	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376728
97	NC_010010	TGC	2	6	12912	12917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
98	NC_010010	GCT	2	6	12932	12937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376728
99	NC_010010	CAT	2	6	13004	13009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376728
100	NC_010010	TCT	2	6	13043	13048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
101	NC_010010	TTC	2	6	13053	13058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376728
102	NC_010010	CTT	2	6	13935	13940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376729
103	NC_010010	CTA	2	6	14016	14021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376729
104	NC_010010	AGC	2	6	14173	14178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376729
105	NC_010010	GGT	2	6	14747	14752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672690
106	NC_010010	TGA	2	6	14770	14775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672690
107	NC_010010	GAA	2	6	14822	14827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672690
108	NC_010010	CAA	2	6	14996	15001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672690
109	NC_010010	TCT	2	6	15289	15294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376731
110	NC_010010	TAT	2	6	15298	15303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376731
111	NC_010010	ATA	2	6	15324	15329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376731
112	NC_010010	TTA	2	6	15369	15374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376731
113	NC_010010	CTT	2	6	15397	15402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376731
114	NC_010010	TAG	2	6	15466	15471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376731
115	NC_010010	TTC	2	6	15480	15485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376731
116	NC_010010	ACT	2	6	15944	15949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672691
117	NC_010010	GTG	2	6	15950	15955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672691
118	NC_010010	AGT	2	6	15969	15974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672691
119	NC_010010	ATG	2	6	16036	16041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672692
120	NC_010010	GCT	2	6	16373	16378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672693
121	NC_010010	TGT	2	6	16388	16393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672693
122	NC_010010	TGC	2	6	16394	16399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672693
123	NC_010010	CAT	2	6	16426	16431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672693
124	NC_010010	ATT	2	6	16601	16606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672693
125	NC_010010	AAC	2	6	16610	16615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672693
126	NC_010010	TTG	2	6	16630	16635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672693
127	NC_010010	TTC	2	6	16723	16728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672693
128	NC_010010	CAA	2	6	16785	16790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672693
129	NC_010010	TAG	2	6	16877	16882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672693
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.