MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM200

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010009	AGT	2	6	10	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010009	TTA	2	6	118	123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672656
3	NC_010009	ACT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672656
4	NC_010009	AGT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672656
5	NC_010009	ATG	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010009	AAT	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010009	TAA	2	6	586	591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010009	GGC	2	6	688	693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672657
9	NC_010009	AAC	2	6	714	719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672657
10	NC_010009	AAT	2	6	788	793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010009	ACA	2	6	815	820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010009	TAT	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010009	CGG	2	6	951	956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
14	NC_010009	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
15	NC_010009	ATT	2	6	991	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376709
16	NC_010009	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376709
17	NC_010009	CGG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
18	NC_010009	TGG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376709
19	NC_010009	AAG	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010009	TAT	2	6	1737	1742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010009	CAC	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010009	AGG	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010009	CGA	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
24	NC_010009	GCA	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
25	NC_010009	CAA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376710
26	NC_010009	ACG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
27	NC_010009	CGG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
28	NC_010009	CAT	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672658
29	NC_010009	CCA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672658
30	NC_010009	TGA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
31	NC_010009	AGA	2	6	2580	2585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
32	NC_010009	CGG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
33	NC_010009	CAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
34	NC_010009	CAG	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
35	NC_010009	ACA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
36	NC_010009	CAG	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
37	NC_010009	GAT	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
38	NC_010009	GAT	3	9	3016	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
39	NC_010009	GCA	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
40	NC_010009	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
41	NC_010009	CAA	3	9	3274	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
42	NC_010009	ATA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672659
43	NC_010009	ATT	2	6	3562	3567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010009	GTA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010009	ACA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010009	ATA	2	6	3742	3747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010009	TCA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672660
48	NC_010009	GAA	2	6	3828	3833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
49	NC_010009	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
50	NC_010009	TTG	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
51	NC_010009	ATT	2	6	3979	3984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
52	NC_010009	AAC	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672660
53	NC_010009	TTA	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
54	NC_010009	AGA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
55	NC_010009	TAA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
56	NC_010009	TGT	2	6	4091	4096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
57	NC_010009	GAT	3	9	4098	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672660
58	NC_010009	GCA	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672660
59	NC_010009	CTT	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672660
60	NC_010009	TTA	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
61	NC_010009	TAT	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
62	NC_010009	ATT	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
63	NC_010009	AAT	2	6	4423	4428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
64	NC_010009	TAT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010009	TAT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010009	TTA	2	6	4615	4620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010009	AGT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010009	CCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672661
69	NC_010009	TAG	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
70	NC_010009	TGT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
71	NC_010009	GTT	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
72	NC_010009	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
73	NC_010009	ATC	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672661
74	NC_010009	TTC	2	6	5226	5231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
75	NC_010009	ATA	2	6	5241	5246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672661
76	NC_010009	AGT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
77	NC_010009	TAA	2	6	5451	5456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010009	AAT	2	6	5519	5524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010009	ATT	3	9	5579	5587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010009	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010009	TTC	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010009	CTT	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010009	GAT	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010009	ATT	2	6	5886	5891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010009	CGG	2	6	6048	6053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010009	AGA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010009	CAT	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010009	ATT	2	6	6236	6241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010009	TTA	2	6	6248	6253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010009	GCT	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010009	TAA	2	6	6346	6351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010009	ATC	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672662
93	NC_010009	TCA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672662
94	NC_010009	CTT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672662
95	NC_010009	GAA	2	6	6604	6609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672662
96	NC_010009	ACC	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672662
97	NC_010009	GAG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
98	NC_010009	TGA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672662
99	NC_010009	TTG	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672662
100	NC_010009	TGG	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672662
101	NC_010009	GGA	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
102	NC_010009	GGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
103	NC_010009	GCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672662
104	NC_010009	TTA	2	6	6822	6827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672662
105	NC_010009	TTG	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672662
106	NC_010009	GTT	2	6	7029	7034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376717
107	NC_010009	CTT	2	6	7234	7239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010009	TAA	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672663
109	NC_010009	TTA	2	6	7281	7286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672663
110	NC_010009	TAT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672663
111	NC_010009	ATA	2	6	7351	7356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672663
112	NC_010009	AGT	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010009	AGT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010009	AGT	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672664
115	NC_010009	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
116	NC_010009	CTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
117	NC_010009	TGT	2	6	7783	7788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672664
118	NC_010009	TTC	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
119	NC_010009	AAC	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672664
120	NC_010009	AGA	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672664
121	NC_010009	TCT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
122	NC_010009	TTC	2	6	7991	7996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
123	NC_010009	CAT	3	9	8023	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672664
124	NC_010009	TAT	2	6	8127	8132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010009	TAT	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010009	TAA	2	6	8263	8268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010009	TGT	2	6	8317	8322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010009	TCT	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672665
129	NC_010009	GTT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672665
130	NC_010009	TAT	2	6	8413	8418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672665
131	NC_010009	AGT	2	6	8546	8551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010009	GAA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010009	CCT	2	6	8675	8680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010009	TCT	2	6	8714	8719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010009	AGT	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010009	ATT	2	6	8802	8807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010009	TAT	2	6	8812	8817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010009	GCA	2	6	8845	8850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010009	CTT	2	6	8940	8945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010009	TAG	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010009	AGG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010009	CTA	2	6	9061	9066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.