MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM200

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010009	TTA	2	6	118	123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672656
2	NC_010009	ACT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672656
3	NC_010009	AGT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672656
4	NC_010009	GGC	2	6	688	693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672657
5	NC_010009	AAC	2	6	714	719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672657
6	NC_010009	CGG	2	6	951	956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
7	NC_010009	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
8	NC_010009	ATT	2	6	991	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376709
9	NC_010009	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376709
10	NC_010009	CGG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
11	NC_010009	TGG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376709
12	NC_010009	CGA	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
13	NC_010009	GCA	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
14	NC_010009	CAA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376710
15	NC_010009	ACG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
16	NC_010009	CGG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
17	NC_010009	CAT	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672658
18	NC_010009	CCA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672658
19	NC_010009	TGA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
20	NC_010009	AGA	2	6	2580	2585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
21	NC_010009	CGG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
22	NC_010009	CAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
23	NC_010009	CAG	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
24	NC_010009	ACA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
25	NC_010009	CAG	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
26	NC_010009	GAT	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
27	NC_010009	GAT	3	9	3016	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
28	NC_010009	GCA	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
29	NC_010009	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
30	NC_010009	CAA	3	9	3274	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
31	NC_010009	ATA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672659
32	NC_010009	TCA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672660
33	NC_010009	GAA	2	6	3828	3833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
34	NC_010009	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
35	NC_010009	TTG	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
36	NC_010009	ATT	2	6	3979	3984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
37	NC_010009	AAC	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672660
38	NC_010009	TTA	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
39	NC_010009	AGA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
40	NC_010009	TAA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
41	NC_010009	TGT	2	6	4091	4096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
42	NC_010009	GAT	3	9	4098	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672660
43	NC_010009	GCA	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672660
44	NC_010009	CTT	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672660
45	NC_010009	TTA	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
46	NC_010009	TAT	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
47	NC_010009	ATT	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
48	NC_010009	AAT	2	6	4423	4428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
49	NC_010009	CCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672661
50	NC_010009	TAG	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
51	NC_010009	TGT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
52	NC_010009	GTT	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
53	NC_010009	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
54	NC_010009	ATC	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672661
55	NC_010009	TTC	2	6	5226	5231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
56	NC_010009	ATA	2	6	5241	5246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672661
57	NC_010009	AGT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
58	NC_010009	ATC	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672662
59	NC_010009	TCA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672662
60	NC_010009	CTT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672662
61	NC_010009	GAA	2	6	6604	6609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672662
62	NC_010009	ACC	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672662
63	NC_010009	GAG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
64	NC_010009	TGA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672662
65	NC_010009	TTG	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672662
66	NC_010009	TGG	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672662
67	NC_010009	GGA	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
68	NC_010009	GGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
69	NC_010009	GCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672662
70	NC_010009	TTA	2	6	6822	6827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672662
71	NC_010009	TTG	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672662
72	NC_010009	GTT	2	6	7029	7034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376717
73	NC_010009	TAA	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672663
74	NC_010009	TTA	2	6	7281	7286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672663
75	NC_010009	TAT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672663
76	NC_010009	ATA	2	6	7351	7356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672663
77	NC_010009	AGT	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672664
78	NC_010009	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
79	NC_010009	CTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
80	NC_010009	TGT	2	6	7783	7788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672664
81	NC_010009	TTC	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
82	NC_010009	AAC	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672664
83	NC_010009	AGA	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672664
84	NC_010009	TCT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
85	NC_010009	TTC	2	6	7991	7996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
86	NC_010009	CAT	3	9	8023	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672664
87	NC_010009	TCT	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672665
88	NC_010009	GTT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672665
89	NC_010009	TAT	2	6	8413	8418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.