MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM100

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010008	TCA	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161353807
2	NC_010008	ATA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353807
3	NC_010008	TTG	2	6	214	219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010008	TAT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010008	CAA	2	6	263	268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010008	GGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010008	AAC	2	6	322	327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010008	GGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010008	GCT	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672671
10	NC_010008	ATT	2	6	549	554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672671
11	NC_010008	ACA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
12	NC_010008	TCT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672671
13	NC_010008	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
14	NC_010008	ACA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
15	NC_010008	TAG	3	9	841	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
16	NC_010008	TGA	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
17	NC_010008	ATA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
18	NC_010008	CGA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672671
19	NC_010008	GTA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
20	NC_010008	ATG	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
21	NC_010008	AGA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672671
22	NC_010008	AAT	2	6	1109	1114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
23	NC_010008	TAA	2	6	1190	1195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
24	NC_010008	GAA	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353809
25	NC_010008	AAC	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353809
26	NC_010008	GGA	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353809
27	NC_010008	GCT	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161353809
28	NC_010008	TGG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161353809
29	NC_010008	TAT	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010008	CAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010008	ATA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010008	AGA	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010008	ATA	2	6	1908	1913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010008	TAT	2	6	2032	2037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010008	GCT	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010008	ATG	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010008	CGG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010008	TTG	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010008	TTA	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010008	TAA	2	6	2399	2404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353810
41	NC_010008	TCT	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353810
42	NC_010008	ATC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010008	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
44	NC_010008	ATC	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
45	NC_010008	CTT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
46	NC_010008	CTT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
47	NC_010008	GAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672672
48	NC_010008	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
49	NC_010008	TGT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672672
50	NC_010008	GAA	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
51	NC_010008	GGT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672672
52	NC_010008	CTA	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
53	NC_010008	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010008	ATA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010008	GTT	2	6	3526	3531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010008	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010008	CTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010008	GTG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010008	ATG	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010008	GAA	2	6	3806	3811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010008	GAT	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010008	CAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672673
63	NC_010008	GTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672673
64	NC_010008	TTC	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672673
65	NC_010008	CCT	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010008	GAG	3	9	4471	4479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353813
67	NC_010008	AAG	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
68	NC_010008	CAA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
69	NC_010008	AAG	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
70	NC_010008	CAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
71	NC_010008	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
72	NC_010008	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
73	NC_010008	CAG	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010008	GAA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010008	ATT	3	9	5025	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672674
76	NC_010008	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
77	NC_010008	CAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672674
78	NC_010008	ACA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672674
79	NC_010008	ATG	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
80	NC_010008	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
81	NC_010008	TCT	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.