MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM100

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010008	TCA	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161353807
2	NC_010008	ATA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353807
3	NC_010008	GCT	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672671
4	NC_010008	ATT	2	6	549	554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672671
5	NC_010008	ACA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
6	NC_010008	TCT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672671
7	NC_010008	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
8	NC_010008	ACA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
9	NC_010008	TAG	3	9	841	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
10	NC_010008	TGA	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
11	NC_010008	ATA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
12	NC_010008	CGA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672671
13	NC_010008	GTA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
14	NC_010008	ATG	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
15	NC_010008	AGA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672671
16	NC_010008	AAT	2	6	1109	1114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
17	NC_010008	TAA	2	6	1190	1195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
18	NC_010008	GAA	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353809
19	NC_010008	AAC	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353809
20	NC_010008	GGA	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353809
21	NC_010008	GCT	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161353809
22	NC_010008	TGG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161353809
23	NC_010008	TAA	2	6	2399	2404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353810
24	NC_010008	TCT	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353810
25	NC_010008	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
26	NC_010008	ATC	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
27	NC_010008	CTT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
28	NC_010008	CTT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
29	NC_010008	GAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672672
30	NC_010008	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
31	NC_010008	TGT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672672
32	NC_010008	GAA	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
33	NC_010008	GGT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672672
34	NC_010008	CTA	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
35	NC_010008	CAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672673
36	NC_010008	GTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672673
37	NC_010008	TTC	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672673
38	NC_010008	GAG	3	9	4471	4479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353813
39	NC_010008	AAG	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
40	NC_010008	CAA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
41	NC_010008	AAG	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
42	NC_010008	CAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
43	NC_010008	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
44	NC_010008	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
45	NC_010008	ATT	3	9	5025	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672674
46	NC_010008	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
47	NC_010008	CAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672674
48	NC_010008	ACA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672674
49	NC_010008	ATG	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
50	NC_010008	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.