MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 3357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	AATAA	2	10	381	390	80 %	20 %	0 %	0 %	160878163
2	NC_010001	ATTAA	2	10	1972	1981	60 %	40 %	0 %	0 %	160878164
3	NC_010001	TGCAA	2	10	5765	5774	40 %	20 %	20 %	20 %	160878167
4	NC_010001	GTTAA	2	10	9305	9314	40 %	40 %	20 %	0 %	160878168
5	NC_010001	AAAAT	2	10	12879	12888	80 %	20 %	0 %	0 %	160878172
6	NC_010001	GAACA	2	10	13578	13587	60 %	0 %	20 %	20 %	160878172
7	NC_010001	AGCTA	2	10	22606	22615	40 %	20 %	20 %	20 %	160878174
8	NC_010001	AAATG	2	10	24314	24323	60 %	20 %	20 %	0 %	160878176
9	NC_010001	ATGGT	2	10	25441	25450	20 %	40 %	40 %	0 %	160878176
10	NC_010001	AGCAA	2	10	25948	25957	60 %	0 %	20 %	20 %	160878176
11	NC_010001	TTAAA	2	10	26938	26947	60 %	40 %	0 %	0 %	160878177
12	NC_010001	CAAAC	2	10	30266	30275	60 %	0 %	0 %	40 %	160878179
13	NC_010001	GGAAT	2	10	33809	33818	40 %	20 %	40 %	0 %	160878182
14	NC_010001	TGATT	2	10	34076	34085	20 %	60 %	20 %	0 %	160878182
15	NC_010001	AATCA	2	10	36490	36499	60 %	20 %	0 %	20 %	160878184
16	NC_010001	TATGA	2	10	37526	37535	40 %	40 %	20 %	0 %	160878185
17	NC_010001	TGTTC	2	10	44492	44501	0 %	60 %	20 %	20 %	160878190
18	NC_010001	TGTAT	2	10	49063	49072	20 %	60 %	20 %	0 %	160878194
19	NC_010001	TAACG	2	10	50122	50131	40 %	20 %	20 %	20 %	160878195
20	NC_010001	TCTTA	2	10	50714	50723	20 %	60 %	0 %	20 %	160878195
21	NC_010001	TTATG	2	10	54100	54109	20 %	60 %	20 %	0 %	160878198
22	NC_010001	TGGAC	2	10	55671	55680	20 %	20 %	40 %	20 %	160878200
23	NC_010001	AGAGG	3	15	56393	56407	40 %	0 %	60 %	0 %	160878201
24	NC_010001	AAAAG	2	10	57220	57229	80 %	0 %	20 %	0 %	160878201
25	NC_010001	GAAAT	2	10	59724	59733	60 %	20 %	20 %	0 %	160878202
26	NC_010001	CGGAG	2	10	63456	63465	20 %	0 %	60 %	20 %	160878206
27	NC_010001	ATCAA	2	10	63884	63893	60 %	20 %	0 %	20 %	160878207
28	NC_010001	AACGA	2	10	64344	64353	60 %	0 %	20 %	20 %	160878207
29	NC_010001	ATCAA	2	10	64809	64818	60 %	20 %	0 %	20 %	160878207
30	NC_010001	ATTAA	2	10	66574	66583	60 %	40 %	0 %	0 %	160878209
31	NC_010001	TTATT	2	10	67391	67400	20 %	80 %	0 %	0 %	160878210
32	NC_010001	TGAAT	2	10	67689	67698	40 %	40 %	20 %	0 %	160878210
33	NC_010001	ATCTT	2	10	67896	67905	20 %	60 %	0 %	20 %	160878210
34	NC_010001	ATATT	2	10	69598	69607	40 %	60 %	0 %	0 %	160878212
35	NC_010001	TATGA	2	10	71032	71041	40 %	40 %	20 %	0 %	160878213
36	NC_010001	AATCA	2	10	71551	71560	60 %	20 %	0 %	20 %	160878213
37	NC_010001	AGTAC	2	10	72187	72196	40 %	20 %	20 %	20 %	160878214
38	NC_010001	GTACT	2	10	72837	72846	20 %	40 %	20 %	20 %	160878215
39	NC_010001	GTTTT	2	10	74223	74232	0 %	80 %	20 %	0 %	160878216
40	NC_010001	TATTG	2	10	74909	74918	20 %	60 %	20 %	0 %	160878216
41	NC_010001	GTATA	2	10	74992	75001	40 %	40 %	20 %	0 %	160878216
42	NC_010001	TAAAT	2	10	82603	82612	60 %	40 %	0 %	0 %	160878218
43	NC_010001	AAGAG	2	10	84355	84364	60 %	0 %	40 %	0 %	160878219
44	NC_010001	TAGAA	2	10	84538	84547	60 %	20 %	20 %	0 %	160878219
45	NC_010001	CTGTA	2	10	86823	86832	20 %	40 %	20 %	20 %	160878221
46	NC_010001	TACTT	2	10	90550	90559	20 %	60 %	0 %	20 %	160878225
47	NC_010001	CAAAC	2	10	91383	91392	60 %	0 %	0 %	40 %	160878226
48	NC_010001	TAAAG	2	10	93376	93385	60 %	20 %	20 %	0 %	160878227
49	NC_010001	GTAAA	2	10	95084	95093	60 %	20 %	20 %	0 %	160878228
50	NC_010001	GGAAT	2	10	97300	97309	40 %	20 %	40 %	0 %	160878229
51	NC_010001	ACAAA	2	10	97345	97354	80 %	0 %	0 %	20 %	160878229
52	NC_010001	AGCAA	2	10	98030	98039	60 %	0 %	20 %	20 %	160878229
53	NC_010001	ATTAT	2	10	98149	98158	40 %	60 %	0 %	0 %	160878229
54	NC_010001	TAGAG	2	10	98562	98571	40 %	20 %	40 %	0 %	160878230
55	NC_010001	ACGGT	2	10	98709	98718	20 %	20 %	40 %	20 %	160878230
56	NC_010001	GTAAG	2	10	99313	99322	40 %	20 %	40 %	0 %	160878231
57	NC_010001	GCGCA	2	10	99430	99439	20 %	0 %	40 %	40 %	160878231
58	NC_010001	ACAGG	2	10	100479	100488	40 %	0 %	40 %	20 %	160878231
59	NC_010001	ATTAC	2	10	102389	102398	40 %	40 %	0 %	20 %	160878233
60	NC_010001	AAGAT	2	10	102482	102491	60 %	20 %	20 %	0 %	160878233
61	NC_010001	GCAAA	2	10	103249	103258	60 %	0 %	20 %	20 %	160878233
62	NC_010001	GGATT	2	10	108169	108178	20 %	40 %	40 %	0 %	160878239
63	NC_010001	TGTAT	2	10	108432	108441	20 %	60 %	20 %	0 %	160878239
64	NC_010001	TCGTT	2	10	116029	116038	0 %	60 %	20 %	20 %	160878248
65	NC_010001	GTATC	2	10	122787	122796	20 %	40 %	20 %	20 %	160878253
66	NC_010001	GTTTT	2	10	123378	123387	0 %	80 %	20 %	0 %	160878253
67	NC_010001	AATTA	2	10	124117	124126	60 %	40 %	0 %	0 %	160878253
68	NC_010001	ACTTT	2	10	124624	124633	20 %	60 %	0 %	20 %	160878254
69	NC_010001	AAAAG	2	10	126663	126672	80 %	0 %	20 %	0 %	160878256
70	NC_010001	ATTCC	2	10	127691	127700	20 %	40 %	0 %	40 %	160878256
71	NC_010001	CAGGG	2	10	129507	129516	20 %	0 %	60 %	20 %	160878258
72	NC_010001	TATTT	2	10	129807	129816	20 %	80 %	0 %	0 %	160878258
73	NC_010001	GTTAT	2	10	131416	131425	20 %	60 %	20 %	0 %	160878260
74	NC_010001	CATGG	2	10	131528	131537	20 %	20 %	40 %	20 %	160878260
75	NC_010001	TTATA	2	10	133333	133342	40 %	60 %	0 %	0 %	160878261
76	NC_010001	TATCA	2	10	133525	133534	40 %	40 %	0 %	20 %	160878261
77	NC_010001	GAAGA	2	10	135948	135957	60 %	0 %	40 %	0 %	160878262
78	NC_010001	AAAGG	2	10	137538	137547	60 %	0 %	40 %	0 %	160878263
79	NC_010001	AGAAA	2	10	138089	138098	80 %	0 %	20 %	0 %	160878264
80	NC_010001	GCATT	2	10	138649	138658	20 %	40 %	20 %	20 %	160878264
81	NC_010001	AATGA	2	10	139050	139059	60 %	20 %	20 %	0 %	160878264
82	NC_010001	CGTTT	2	10	142036	142045	0 %	60 %	20 %	20 %	160878266
83	NC_010001	CACTT	2	10	143003	143012	20 %	40 %	0 %	40 %	160878267
84	NC_010001	TTCTC	2	10	144064	144073	0 %	60 %	0 %	40 %	160878268
85	NC_010001	AGGAT	2	10	144198	144207	40 %	20 %	40 %	0 %	160878268
86	NC_010001	GGGAA	2	10	148966	148975	40 %	0 %	60 %	0 %	160878271
87	NC_010001	AAATG	2	10	152563	152572	60 %	20 %	20 %	0 %	160878272
88	NC_010001	AAGTT	2	10	154123	154132	40 %	40 %	20 %	0 %	160878273
89	NC_010001	TAACA	2	10	158016	158025	60 %	20 %	0 %	20 %	160878278
90	NC_010001	ATATT	2	10	158465	158474	40 %	60 %	0 %	0 %	160878278
91	NC_010001	AGATA	2	10	158610	158619	60 %	20 %	20 %	0 %	160878278
92	NC_010001	AGAAA	2	10	160100	160109	80 %	0 %	20 %	0 %	160878279
93	NC_010001	TCAAA	2	10	160147	160156	60 %	20 %	0 %	20 %	160878279
94	NC_010001	CTATG	2	10	160511	160520	20 %	40 %	20 %	20 %	160878279
95	NC_010001	GAGAT	2	10	162774	162783	40 %	20 %	40 %	0 %	160878281
96	NC_010001	TGATT	2	10	165498	165507	20 %	60 %	20 %	0 %	160878284
97	NC_010001	TTTGA	3	15	167088	167102	20 %	60 %	20 %	0 %	160878285
98	NC_010001	TAATG	2	10	168222	168231	40 %	40 %	20 %	0 %	160878285
99	NC_010001	ACTTT	2	10	171279	171288	20 %	60 %	0 %	20 %	160878288
100	NC_010001	TGCAT	2	10	172600	172609	20 %	40 %	20 %	20 %	160878289
101	NC_010001	ATCTT	2	10	174855	174864	20 %	60 %	0 %	20 %	160878291
102	NC_010001	TAGCA	2	10	174934	174943	40 %	20 %	20 %	20 %	160878291
103	NC_010001	TAAGT	2	10	174991	175000	40 %	40 %	20 %	0 %	160878291
104	NC_010001	GGGAT	2	10	175212	175221	20 %	20 %	60 %	0 %	160878291
105	NC_010001	ATGGA	2	10	175659	175668	40 %	20 %	40 %	0 %	160878291
106	NC_010001	CTGAA	2	10	178518	178527	40 %	20 %	20 %	20 %	160878295
107	NC_010001	GTACA	2	10	178806	178815	40 %	20 %	20 %	20 %	160878296
108	NC_010001	TAAAA	2	10	178962	178971	80 %	20 %	0 %	0 %	160878296
109	NC_010001	AAGAA	2	10	179219	179228	80 %	0 %	20 %	0 %	160878296
110	NC_010001	TTTTC	2	10	181377	181386	0 %	80 %	0 %	20 %	160878298
111	NC_010001	GAAGC	2	10	181441	181450	40 %	0 %	40 %	20 %	160878298
112	NC_010001	AATAA	2	10	182785	182794	80 %	20 %	0 %	0 %	160878299
113	NC_010001	CACAT	2	10	182848	182857	40 %	20 %	0 %	40 %	160878299
114	NC_010001	ATGAT	2	10	183188	183197	40 %	40 %	20 %	0 %	160878299
115	NC_010001	AGATG	2	10	185644	185653	40 %	20 %	40 %	0 %	160878301
116	NC_010001	AAGAG	2	10	186037	186046	60 %	0 %	40 %	0 %	160878301
117	NC_010001	TATGG	2	10	186452	186461	20 %	40 %	40 %	0 %	160878302
118	NC_010001	TATGT	2	10	186599	186608	20 %	60 %	20 %	0 %	160878302
119	NC_010001	TTATG	2	10	186755	186764	20 %	60 %	20 %	0 %	160878302
120	NC_010001	CGAAT	2	10	188216	188225	40 %	20 %	20 %	20 %	160878303
121	NC_010001	AAGTT	2	10	188363	188372	40 %	40 %	20 %	0 %	160878303
122	NC_010001	CATTT	2	10	188978	188987	20 %	60 %	0 %	20 %	160878303
123	NC_010001	ATTTC	2	10	192052	192061	20 %	60 %	0 %	20 %	160878307
124	NC_010001	ATTCC	2	10	193375	193384	20 %	40 %	0 %	40 %	160878308
125	NC_010001	TGAAA	2	10	194635	194644	60 %	20 %	20 %	0 %	160878310
126	NC_010001	AAGGA	2	10	195227	195236	60 %	0 %	40 %	0 %	160878310
127	NC_010001	GGAAA	2	10	196895	196904	60 %	0 %	40 %	0 %	160878312
128	NC_010001	GTTAA	2	10	198223	198232	40 %	40 %	20 %	0 %	160878313
129	NC_010001	CTTCT	2	10	198705	198714	0 %	60 %	0 %	40 %	160878313
130	NC_010001	TCTAG	2	10	199399	199408	20 %	40 %	20 %	20 %	160878313
131	NC_010001	TAATT	2	10	200091	200100	40 %	60 %	0 %	0 %	160878314
132	NC_010001	TGAAG	2	10	200643	200652	40 %	20 %	40 %	0 %	160878314
133	NC_010001	TTAAA	2	10	202963	202972	60 %	40 %	0 %	0 %	160878316
134	NC_010001	CAAAT	2	10	207170	207179	60 %	20 %	0 %	20 %	160878319
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