MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 14979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	AATA	2	8	261	268	75 %	25 %	0 %	0 %	160878163
2	NC_010001	CTTA	2	8	406	413	25 %	50 %	0 %	25 %	160878163
3	NC_010001	TATT	2	8	520	527	25 %	75 %	0 %	0 %	160878163
4	NC_010001	AGAA	2	8	752	759	75 %	0 %	25 %	0 %	160878163
5	NC_010001	TCCT	2	8	1379	1386	0 %	50 %	0 %	50 %	160878163
6	NC_010001	ATTA	2	8	1406	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	160878163
7	NC_010001	TCTT	2	8	1439	1446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010001	TTCT	2	8	1718	1725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010001	ATTA	2	8	1802	1809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010001	GAAT	2	8	1869	1876	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
11	NC_010001	GAAG	2	8	2217	2224	50 %	0 %	50 %	0 %	160878164
12	NC_010001	TAGA	2	8	2648	2655	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
13	NC_010001	TTAA	2	8	2665	2672	50 %	50 %	0 %	0 %	160878164
14	NC_010001	TATG	2	8	3367	3374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010001	AAAT	2	8	3548	3555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010001	ATTT	2	8	3632	3639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010001	TGTT	2	8	3656	3663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010001	TAAG	2	8	4297	4304	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
19	NC_010001	AATT	2	8	4420	4427	50 %	50 %	0 %	0 %	160878166
20	NC_010001	ATGA	2	8	4476	4483	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
21	NC_010001	TAGA	2	8	4804	4811	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
22	NC_010001	AAAC	2	8	5224	5231	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
23	NC_010001	TAAA	2	8	5689	5696	75 %	25 %	0 %	0 %	160878167
24	NC_010001	ACAA	2	8	6005	6012	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
25	NC_010001	AATT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	160878167
26	NC_010001	AGCA	2	8	6618	6625	50 %	0 %	25 %	25 %	160878167
27	NC_010001	GATG	2	8	6791	6798	25 %	25 %	50 %	0 %	160878167
28	NC_010001	GGTA	2	8	7459	7466	25 %	25 %	50 %	0 %	160878168
29	NC_010001	TAAA	2	8	7746	7753	75 %	25 %	0 %	0 %	160878168
30	NC_010001	TGCT	2	8	7944	7951	0 %	50 %	25 %	25 %	160878168
31	NC_010001	AAAG	2	8	8063	8070	75 %	0 %	25 %	0 %	160878168
32	NC_010001	GCAA	2	8	8206	8213	50 %	0 %	25 %	25 %	160878168
33	NC_010001	AATT	2	8	8883	8890	50 %	50 %	0 %	0 %	160878168
34	NC_010001	CAAC	2	8	8901	8908	50 %	0 %	0 %	50 %	160878168
35	NC_010001	TTAC	2	8	9071	9078	25 %	50 %	0 %	25 %	160878168
36	NC_010001	AACT	2	8	9102	9109	50 %	25 %	0 %	25 %	160878168
37	NC_010001	AAAG	2	8	9365	9372	75 %	0 %	25 %	0 %	160878168
38	NC_010001	AAAG	2	8	10006	10013	75 %	0 %	25 %	0 %	160878169
39	NC_010001	ATTT	2	8	10132	10139	25 %	75 %	0 %	0 %	160878169
40	NC_010001	AGGA	2	8	10215	10222	50 %	0 %	50 %	0 %	160878169
41	NC_010001	ATGC	2	8	10452	10459	25 %	25 %	25 %	25 %	160878169
42	NC_010001	TTAT	2	8	10979	10986	25 %	75 %	0 %	0 %	160878170
43	NC_010001	GAAG	2	8	11683	11690	50 %	0 %	50 %	0 %	160878171
44	NC_010001	CAGA	2	8	11962	11969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010001	ACAT	2	8	12104	12111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010001	TGAG	2	8	12345	12352	25 %	25 %	50 %	0 %	160878172
47	NC_010001	CTAT	2	8	12438	12445	25 %	50 %	0 %	25 %	160878172
48	NC_010001	TATT	2	8	12807	12814	25 %	75 %	0 %	0 %	160878172
49	NC_010001	TAAA	2	8	13278	13285	75 %	25 %	0 %	0 %	160878172
50	NC_010001	AAAG	2	8	13322	13329	75 %	0 %	25 %	0 %	160878172
51	NC_010001	AACT	2	8	14762	14769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010001	AGTT	2	8	14799	14806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010001	AGTT	2	8	14814	14821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010001	TAAA	2	8	15312	15319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010001	GTGA	2	8	16163	16170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010001	CTTC	2	8	16758	16765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010001	AAGC	2	8	16990	16997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010001	ATTA	2	8	17366	17373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010001	AAAC	2	8	17828	17835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010001	AGAA	2	8	18128	18135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010001	AGCC	2	8	18251	18258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010001	TCAG	2	8	18613	18620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010001	GTTT	2	8	20830	20837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010001	TCAA	2	8	20893	20900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010001	ATGG	2	8	21269	21276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010001	TCCA	2	8	21345	21352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010001	AACA	2	8	21803	21810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010001	GAAA	2	8	21914	21921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010001	ATAG	2	8	22655	22662	50 %	25 %	25 %	0 %	160878174
70	NC_010001	TAAT	2	8	22977	22984	50 %	50 %	0 %	0 %	160878174
71	NC_010001	AAAT	2	8	23122	23129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010001	ATTT	2	8	24415	24422	25 %	75 %	0 %	0 %	160878176
73	NC_010001	CTTT	2	8	25039	25046	0 %	75 %	0 %	25 %	160878176
74	NC_010001	GAAG	2	8	25157	25164	50 %	0 %	50 %	0 %	160878176
75	NC_010001	AATT	2	8	25201	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	160878176
76	NC_010001	TAAA	2	8	25276	25283	75 %	25 %	0 %	0 %	160878176
77	NC_010001	TTTG	2	8	25551	25558	0 %	75 %	25 %	0 %	160878176
78	NC_010001	TAGT	2	8	25915	25922	25 %	50 %	25 %	0 %	160878176
79	NC_010001	AAAG	2	8	25965	25972	75 %	0 %	25 %	0 %	160878176
80	NC_010001	TTGA	2	8	26505	26512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010001	ATTA	2	8	27345	27352	50 %	50 %	0 %	0 %	160878178
82	NC_010001	TATT	2	8	28331	28338	25 %	75 %	0 %	0 %	160878178
83	NC_010001	TATT	2	8	28380	28387	25 %	75 %	0 %	0 %	160878178
84	NC_010001	TAAA	2	8	28798	28805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010001	GATA	2	8	29577	29584	50 %	25 %	25 %	0 %	160878179
86	NC_010001	TTAG	2	8	29587	29594	25 %	50 %	25 %	0 %	160878179
87	NC_010001	CCAA	2	8	29686	29693	50 %	0 %	0 %	50 %	160878179
88	NC_010001	ATGA	2	8	30195	30202	50 %	25 %	25 %	0 %	160878179
89	NC_010001	ATGA	2	8	31416	31423	50 %	25 %	25 %	0 %	160878180
90	NC_010001	TTTC	2	8	31700	31707	0 %	75 %	0 %	25 %	160878180
91	NC_010001	CAGC	2	8	31860	31867	25 %	0 %	25 %	50 %	160878180
92	NC_010001	GAGT	2	8	32024	32031	25 %	25 %	50 %	0 %	160878180
93	NC_010001	TTTC	2	8	32209	32216	0 %	75 %	0 %	25 %	160878180
94	NC_010001	ATGA	2	8	32316	32323	50 %	25 %	25 %	0 %	160878180
95	NC_010001	AAAG	2	8	32787	32794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010001	CATT	2	8	32922	32929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010001	AATT	2	8	32978	32985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010001	CTTT	2	8	33041	33048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010001	ATTA	2	8	33406	33413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010001	ATAG	2	8	34715	34722	50 %	25 %	25 %	0 %	160878182
101	NC_010001	TAAA	2	8	34761	34768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010001	CTAA	2	8	34942	34949	50 %	25 %	0 %	25 %	160878183
103	NC_010001	CCTT	2	8	35601	35608	0 %	50 %	0 %	50 %	160878183
104	NC_010001	ATTT	2	8	35870	35877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010001	ACTT	2	8	35973	35980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010001	AGGA	2	8	36139	36146	50 %	0 %	50 %	0 %	160878184
107	NC_010001	TTTC	2	8	37833	37840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010001	AATA	2	8	38067	38074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010001	CCAT	2	8	38349	38356	25 %	25 %	0 %	50 %	160878186
110	NC_010001	TAAA	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	160878186
111	NC_010001	CAGA	2	8	38611	38618	50 %	0 %	25 %	25 %	160878186
112	NC_010001	CAAG	2	8	39053	39060	50 %	0 %	25 %	25 %	160878186
113	NC_010001	AATG	2	8	39093	39100	50 %	25 %	25 %	0 %	160878186
114	NC_010001	AAGG	2	8	39460	39467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010001	AGAA	2	8	39912	39919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010001	ACTA	2	8	40514	40521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010001	ATTC	2	8	40818	40825	25 %	50 %	0 %	25 %	160878187
118	NC_010001	CAGC	2	8	40999	41006	25 %	0 %	25 %	50 %	160878187
119	NC_010001	AGAA	2	8	41101	41108	75 %	0 %	25 %	0 %	160878187
120	NC_010001	TTAT	2	8	41210	41217	25 %	75 %	0 %	0 %	160878187
121	NC_010001	TAAA	2	8	41690	41697	75 %	25 %	0 %	0 %	160878187
122	NC_010001	TGGT	2	8	42380	42387	0 %	50 %	50 %	0 %	160878187
123	NC_010001	GATA	2	8	42785	42792	50 %	25 %	25 %	0 %	160878188
124	NC_010001	CTAT	2	8	42796	42803	25 %	50 %	0 %	25 %	160878188
125	NC_010001	TATT	2	8	43043	43050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010001	TCGT	2	8	43369	43376	0 %	50 %	25 %	25 %	160878189
127	NC_010001	AGAT	2	8	43664	43671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010001	ATCT	2	8	43799	43806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010001	GTTG	2	8	44176	44183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010001	CCTA	2	8	44612	44619	25 %	25 %	0 %	50 %	160878190
131	NC_010001	TATT	2	8	44633	44640	25 %	75 %	0 %	0 %	160878190
132	NC_010001	CTTT	2	8	44692	44699	0 %	75 %	0 %	25 %	160878190
133	NC_010001	TACC	2	8	45402	45409	25 %	25 %	0 %	50 %	160878191
134	NC_010001	ATGG	2	8	45546	45553	25 %	25 %	50 %	0 %	160878191
135	NC_010001	ATCT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010001	ATCT	2	8	46106	46113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010001	TACT	2	8	46685	46692	25 %	50 %	0 %	25 %	160878192
138	NC_010001	GAAA	2	8	47667	47674	75 %	0 %	25 %	0 %	160878193
139	NC_010001	GACA	2	8	48576	48583	50 %	0 %	25 %	25 %	160878193
140	NC_010001	AAGT	2	8	49128	49135	50 %	25 %	25 %	0 %	160878194
141	NC_010001	ATTA	2	8	49266	49273	50 %	50 %	0 %	0 %	160878194
142	NC_010001	ATTT	2	8	49376	49383	25 %	75 %	0 %	0 %	160878194
143	NC_010001	ATTT	3	12	49414	49425	25 %	75 %	0 %	0 %	160878194
144	NC_010001	CTAA	2	8	49426	49433	50 %	25 %	0 %	25 %	160878194
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146	NC_010001	AAGG	2	8	50099	50106	50 %	0 %	50 %	0 %	160878195
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