MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 11775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	AATA	2	8	261	268	75 %	25 %	0 %	0 %	160878163
2	NC_010001	CTTA	2	8	406	413	25 %	50 %	0 %	25 %	160878163
3	NC_010001	TATT	2	8	520	527	25 %	75 %	0 %	0 %	160878163
4	NC_010001	AGAA	2	8	752	759	75 %	0 %	25 %	0 %	160878163
5	NC_010001	TCCT	2	8	1379	1386	0 %	50 %	0 %	50 %	160878163
6	NC_010001	ATTA	2	8	1406	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	160878163
7	NC_010001	GAAT	2	8	1869	1876	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
8	NC_010001	GAAG	2	8	2217	2224	50 %	0 %	50 %	0 %	160878164
9	NC_010001	TAGA	2	8	2648	2655	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
10	NC_010001	TTAA	2	8	2665	2672	50 %	50 %	0 %	0 %	160878164
11	NC_010001	TAAG	2	8	4297	4304	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
12	NC_010001	AATT	2	8	4420	4427	50 %	50 %	0 %	0 %	160878166
13	NC_010001	ATGA	2	8	4476	4483	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
14	NC_010001	TAGA	2	8	4804	4811	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
15	NC_010001	AAAC	2	8	5224	5231	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
16	NC_010001	TAAA	2	8	5689	5696	75 %	25 %	0 %	0 %	160878167
17	NC_010001	ACAA	2	8	6005	6012	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
18	NC_010001	AATT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	160878167
19	NC_010001	AGCA	2	8	6618	6625	50 %	0 %	25 %	25 %	160878167
20	NC_010001	GATG	2	8	6791	6798	25 %	25 %	50 %	0 %	160878167
21	NC_010001	GGTA	2	8	7459	7466	25 %	25 %	50 %	0 %	160878168
22	NC_010001	TAAA	2	8	7746	7753	75 %	25 %	0 %	0 %	160878168
23	NC_010001	TGCT	2	8	7944	7951	0 %	50 %	25 %	25 %	160878168
24	NC_010001	AAAG	2	8	8063	8070	75 %	0 %	25 %	0 %	160878168
25	NC_010001	GCAA	2	8	8206	8213	50 %	0 %	25 %	25 %	160878168
26	NC_010001	AATT	2	8	8883	8890	50 %	50 %	0 %	0 %	160878168
27	NC_010001	CAAC	2	8	8901	8908	50 %	0 %	0 %	50 %	160878168
28	NC_010001	TTAC	2	8	9071	9078	25 %	50 %	0 %	25 %	160878168
29	NC_010001	AACT	2	8	9102	9109	50 %	25 %	0 %	25 %	160878168
30	NC_010001	AAAG	2	8	9365	9372	75 %	0 %	25 %	0 %	160878168
31	NC_010001	AAAG	2	8	10006	10013	75 %	0 %	25 %	0 %	160878169
32	NC_010001	ATTT	2	8	10132	10139	25 %	75 %	0 %	0 %	160878169
33	NC_010001	AGGA	2	8	10215	10222	50 %	0 %	50 %	0 %	160878169
34	NC_010001	ATGC	2	8	10452	10459	25 %	25 %	25 %	25 %	160878169
35	NC_010001	TTAT	2	8	10979	10986	25 %	75 %	0 %	0 %	160878170
36	NC_010001	GAAG	2	8	11683	11690	50 %	0 %	50 %	0 %	160878171
37	NC_010001	TGAG	2	8	12345	12352	25 %	25 %	50 %	0 %	160878172
38	NC_010001	CTAT	2	8	12438	12445	25 %	50 %	0 %	25 %	160878172
39	NC_010001	TATT	2	8	12807	12814	25 %	75 %	0 %	0 %	160878172
40	NC_010001	TAAA	2	8	13278	13285	75 %	25 %	0 %	0 %	160878172
41	NC_010001	AAAG	2	8	13322	13329	75 %	0 %	25 %	0 %	160878172
42	NC_010001	ATAG	2	8	22655	22662	50 %	25 %	25 %	0 %	160878174
43	NC_010001	TAAT	2	8	22977	22984	50 %	50 %	0 %	0 %	160878174
44	NC_010001	ATTT	2	8	24415	24422	25 %	75 %	0 %	0 %	160878176
45	NC_010001	CTTT	2	8	25039	25046	0 %	75 %	0 %	25 %	160878176
46	NC_010001	GAAG	2	8	25157	25164	50 %	0 %	50 %	0 %	160878176
47	NC_010001	AATT	2	8	25201	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	160878176
48	NC_010001	TAAA	2	8	25276	25283	75 %	25 %	0 %	0 %	160878176
49	NC_010001	TTTG	2	8	25551	25558	0 %	75 %	25 %	0 %	160878176
50	NC_010001	TAGT	2	8	25915	25922	25 %	50 %	25 %	0 %	160878176
51	NC_010001	AAAG	2	8	25965	25972	75 %	0 %	25 %	0 %	160878176
52	NC_010001	ATTA	2	8	27345	27352	50 %	50 %	0 %	0 %	160878178
53	NC_010001	TATT	2	8	28331	28338	25 %	75 %	0 %	0 %	160878178
54	NC_010001	TATT	2	8	28380	28387	25 %	75 %	0 %	0 %	160878178
55	NC_010001	GATA	2	8	29577	29584	50 %	25 %	25 %	0 %	160878179
56	NC_010001	TTAG	2	8	29587	29594	25 %	50 %	25 %	0 %	160878179
57	NC_010001	CCAA	2	8	29686	29693	50 %	0 %	0 %	50 %	160878179
58	NC_010001	ATGA	2	8	30195	30202	50 %	25 %	25 %	0 %	160878179
59	NC_010001	ATGA	2	8	31416	31423	50 %	25 %	25 %	0 %	160878180
60	NC_010001	TTTC	2	8	31700	31707	0 %	75 %	0 %	25 %	160878180
61	NC_010001	CAGC	2	8	31860	31867	25 %	0 %	25 %	50 %	160878180
62	NC_010001	GAGT	2	8	32024	32031	25 %	25 %	50 %	0 %	160878180
63	NC_010001	TTTC	2	8	32209	32216	0 %	75 %	0 %	25 %	160878180
64	NC_010001	ATGA	2	8	32316	32323	50 %	25 %	25 %	0 %	160878180
65	NC_010001	ATAG	2	8	34715	34722	50 %	25 %	25 %	0 %	160878182
66	NC_010001	CTAA	2	8	34942	34949	50 %	25 %	0 %	25 %	160878183
67	NC_010001	CCTT	2	8	35601	35608	0 %	50 %	0 %	50 %	160878183
68	NC_010001	AGGA	2	8	36139	36146	50 %	0 %	50 %	0 %	160878184
69	NC_010001	CCAT	2	8	38349	38356	25 %	25 %	0 %	50 %	160878186
70	NC_010001	TAAA	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	160878186
71	NC_010001	CAGA	2	8	38611	38618	50 %	0 %	25 %	25 %	160878186
72	NC_010001	CAAG	2	8	39053	39060	50 %	0 %	25 %	25 %	160878186
73	NC_010001	AATG	2	8	39093	39100	50 %	25 %	25 %	0 %	160878186
74	NC_010001	ATTC	2	8	40818	40825	25 %	50 %	0 %	25 %	160878187
75	NC_010001	CAGC	2	8	40999	41006	25 %	0 %	25 %	50 %	160878187
76	NC_010001	AGAA	2	8	41101	41108	75 %	0 %	25 %	0 %	160878187
77	NC_010001	TTAT	2	8	41210	41217	25 %	75 %	0 %	0 %	160878187
78	NC_010001	TAAA	2	8	41690	41697	75 %	25 %	0 %	0 %	160878187
79	NC_010001	TGGT	2	8	42380	42387	0 %	50 %	50 %	0 %	160878187
80	NC_010001	GATA	2	8	42785	42792	50 %	25 %	25 %	0 %	160878188
81	NC_010001	CTAT	2	8	42796	42803	25 %	50 %	0 %	25 %	160878188
82	NC_010001	TCGT	2	8	43369	43376	0 %	50 %	25 %	25 %	160878189
83	NC_010001	CCTA	2	8	44612	44619	25 %	25 %	0 %	50 %	160878190
84	NC_010001	TATT	2	8	44633	44640	25 %	75 %	0 %	0 %	160878190
85	NC_010001	CTTT	2	8	44692	44699	0 %	75 %	0 %	25 %	160878190
86	NC_010001	TACC	2	8	45402	45409	25 %	25 %	0 %	50 %	160878191
87	NC_010001	ATGG	2	8	45546	45553	25 %	25 %	50 %	0 %	160878191
88	NC_010001	TACT	2	8	46685	46692	25 %	50 %	0 %	25 %	160878192
89	NC_010001	GAAA	2	8	47667	47674	75 %	0 %	25 %	0 %	160878193
90	NC_010001	GACA	2	8	48576	48583	50 %	0 %	25 %	25 %	160878193
91	NC_010001	AAGT	2	8	49128	49135	50 %	25 %	25 %	0 %	160878194
92	NC_010001	ATTA	2	8	49266	49273	50 %	50 %	0 %	0 %	160878194
93	NC_010001	ATTT	2	8	49376	49383	25 %	75 %	0 %	0 %	160878194
94	NC_010001	ATTT	3	12	49414	49425	25 %	75 %	0 %	0 %	160878194
95	NC_010001	CTAA	2	8	49426	49433	50 %	25 %	0 %	25 %	160878194
96	NC_010001	AGAA	2	8	49904	49911	75 %	0 %	25 %	0 %	160878195
97	NC_010001	AAGG	2	8	50099	50106	50 %	0 %	50 %	0 %	160878195
98	NC_010001	ACCA	2	8	50110	50117	50 %	0 %	0 %	50 %	160878195
99	NC_010001	GTAT	2	8	50369	50376	25 %	50 %	25 %	0 %	160878195
100	NC_010001	CTAT	2	8	51304	51311	25 %	50 %	0 %	25 %	160878197
101	NC_010001	ACAG	2	8	51407	51414	50 %	0 %	25 %	25 %	160878197
102	NC_010001	AGTT	2	8	51548	51555	25 %	50 %	25 %	0 %	160878197
103	NC_010001	AGCA	2	8	51694	51701	50 %	0 %	25 %	25 %	160878197
104	NC_010001	TATT	2	8	51744	51751	25 %	75 %	0 %	0 %	160878197
105	NC_010001	ATCA	2	8	52293	52300	50 %	25 %	0 %	25 %	160878197
106	NC_010001	ATAC	2	8	52674	52681	50 %	25 %	0 %	25 %	160878197
107	NC_010001	GCTT	2	8	52709	52716	0 %	50 %	25 %	25 %	160878197
108	NC_010001	CCTT	2	8	52860	52867	0 %	50 %	0 %	50 %	160878197
109	NC_010001	TATT	2	8	53112	53119	25 %	75 %	0 %	0 %	160878197
110	NC_010001	TTTA	2	8	53309	53316	25 %	75 %	0 %	0 %	160878197
111	NC_010001	GGAA	2	8	54991	54998	50 %	0 %	50 %	0 %	160878199
112	NC_010001	TTAT	2	8	55699	55706	25 %	75 %	0 %	0 %	160878200
113	NC_010001	AAAT	2	8	56063	56070	75 %	25 %	0 %	0 %	160878200
114	NC_010001	AGAA	2	8	57124	57131	75 %	0 %	25 %	0 %	160878201
115	NC_010001	GAAA	2	8	57139	57146	75 %	0 %	25 %	0 %	160878201
116	NC_010001	AGAA	2	8	57183	57190	75 %	0 %	25 %	0 %	160878201
117	NC_010001	CTTT	2	8	57261	57268	0 %	75 %	0 %	25 %	160878201
118	NC_010001	TATT	2	8	57291	57298	25 %	75 %	0 %	0 %	160878201
119	NC_010001	GTAT	2	8	57299	57306	25 %	50 %	25 %	0 %	160878201
120	NC_010001	AGAT	2	8	57363	57370	50 %	25 %	25 %	0 %	160878201
121	NC_010001	GAAA	3	12	57442	57453	75 %	0 %	25 %	0 %	160878201
122	NC_010001	ATTT	2	8	57504	57511	25 %	75 %	0 %	0 %	160878201
123	NC_010001	TTAA	2	8	57866	57873	50 %	50 %	0 %	0 %	160878201
124	NC_010001	CTGG	2	8	58482	58489	0 %	25 %	50 %	25 %	160878202
125	NC_010001	TTAC	2	8	59210	59217	25 %	50 %	0 %	25 %	160878202
126	NC_010001	GAAG	2	8	59261	59268	50 %	0 %	50 %	0 %	160878202
127	NC_010001	GCCA	2	8	59330	59337	25 %	0 %	25 %	50 %	160878202
128	NC_010001	GATG	2	8	59773	59780	25 %	25 %	50 %	0 %	160878202
129	NC_010001	CAAA	2	8	59963	59970	75 %	0 %	0 %	25 %	160878203
130	NC_010001	TCAG	2	8	60439	60446	25 %	25 %	25 %	25 %	160878203
131	NC_010001	AGAA	2	8	60461	60468	75 %	0 %	25 %	0 %	160878203
132	NC_010001	TCTG	2	8	60751	60758	0 %	50 %	25 %	25 %	160878203
133	NC_010001	TTTA	2	8	60805	60812	25 %	75 %	0 %	0 %	160878203
134	NC_010001	ATTG	2	8	60865	60872	25 %	50 %	25 %	0 %	160878203
135	NC_010001	ATGG	2	8	61253	61260	25 %	25 %	50 %	0 %	160878204
136	NC_010001	CGAA	2	8	61499	61506	50 %	0 %	25 %	25 %	160878204
137	NC_010001	ATGT	2	8	61638	61645	25 %	50 %	25 %	0 %	160878204
138	NC_010001	GAAA	2	8	61919	61926	75 %	0 %	25 %	0 %	160878204
139	NC_010001	CTTT	2	8	62689	62696	0 %	75 %	0 %	25 %	160878206
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