MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 57152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	CTT	2	6	165	170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878163
2	NC_010001	ATG	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
3	NC_010001	GAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
4	NC_010001	CTT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878163
5	NC_010001	GCA	2	6	471	476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878163
6	NC_010001	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878163
7	NC_010001	TAC	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878163
8	NC_010001	TTA	2	6	717	722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
9	NC_010001	GAT	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
10	NC_010001	TAT	2	6	740	745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
11	NC_010001	ATT	2	6	816	821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
12	NC_010001	GAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
13	NC_010001	GAA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
14	NC_010001	TGA	3	9	974	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
15	NC_010001	AGA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
16	NC_010001	AAG	2	6	1078	1083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
17	NC_010001	AGA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
18	NC_010001	ATA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
19	NC_010001	TTA	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
20	NC_010001	GTT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878163
21	NC_010001	TAC	2	6	1187	1192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878163
22	NC_010001	GAT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
23	NC_010001	TAA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
24	NC_010001	AAG	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
25	NC_010001	ATA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
26	NC_010001	TTC	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878164
27	NC_010001	ATA	2	6	2077	2082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
28	NC_010001	AGA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
29	NC_010001	AAG	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
30	NC_010001	TAA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
31	NC_010001	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878164
32	NC_010001	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
33	NC_010001	AAG	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
34	NC_010001	TAA	2	6	2622	2627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
35	NC_010001	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878164
36	NC_010001	TGA	3	9	2841	2849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878164
37	NC_010001	TTC	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878164
38	NC_010001	GCA	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878164
39	NC_010001	AGA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878165
40	NC_010001	TTG	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878165
41	NC_010001	TTA	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878165
42	NC_010001	TGG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878165
43	NC_010001	TCG	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878165
44	NC_010001	GAT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
45	NC_010001	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
46	NC_010001	AGA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
47	NC_010001	GAT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
48	NC_010001	ATC	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878166
49	NC_010001	TCT	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878166
50	NC_010001	ATT	2	6	4190	4195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
51	NC_010001	TGT	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878166
52	NC_010001	GGA	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878166
53	NC_010001	ACA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878166
54	NC_010001	TTA	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
55	NC_010001	TTA	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
56	NC_010001	AGA	2	6	4523	4528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
57	NC_010001	GCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878166
58	NC_010001	CTG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878166
59	NC_010001	GAT	2	6	4785	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
60	NC_010001	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
61	NC_010001	TTG	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878166
62	NC_010001	GAA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
63	NC_010001	TAG	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878167
64	NC_010001	CGG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160878167
65	NC_010001	GGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878167
66	NC_010001	GGA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878167
67	NC_010001	GTT	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878167
68	NC_010001	AAC	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
69	NC_010001	GAA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878167
70	NC_010001	AAC	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
71	NC_010001	ATT	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
72	NC_010001	GAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878167
73	NC_010001	GTT	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878167
74	NC_010001	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878167
75	NC_010001	GGT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878167
76	NC_010001	ATT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
77	NC_010001	AGC	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878167
78	NC_010001	TGC	2	6	6152	6157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878167
79	NC_010001	GGT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878167
80	NC_010001	AAC	2	6	6393	6398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
81	NC_010001	TGA	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878167
82	NC_010001	ATT	3	9	6477	6485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
83	NC_010001	TAT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
84	NC_010001	ACC	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878167
85	NC_010001	ACA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
86	NC_010001	ACA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
87	NC_010001	TTC	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878167
88	NC_010001	TAC	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878167
89	NC_010001	ATG	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
90	NC_010001	CCT	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878168
91	NC_010001	AGA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
92	NC_010001	TGC	3	9	7282	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878168
93	NC_010001	TGT	2	6	7335	7340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878168
94	NC_010001	TAA	2	6	7348	7353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878168
95	NC_010001	TTC	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878168
96	NC_010001	CTC	2	6	7482	7487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878168
97	NC_010001	ACA	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878168
98	NC_010001	AGT	2	6	7513	7518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
99	NC_010001	ATT	2	6	7523	7528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
100	NC_010001	ATA	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878168
101	NC_010001	GAA	2	6	7562	7567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
102	NC_010001	TTA	2	6	7568	7573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
103	NC_010001	GAA	2	6	7634	7639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
104	NC_010001	TAT	2	6	7717	7722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
105	NC_010001	TGA	2	6	7822	7827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
106	NC_010001	TCG	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878168
107	NC_010001	AAT	2	6	7958	7963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878168
108	NC_010001	CTT	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878168
109	NC_010001	TTA	2	6	7999	8004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
110	NC_010001	AAG	3	9	8016	8024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
111	NC_010001	GAA	2	6	8034	8039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
112	NC_010001	ATT	2	6	8089	8094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
113	NC_010001	TGA	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
114	NC_010001	TTA	2	6	8121	8126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
115	NC_010001	TGA	2	6	8191	8196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
116	NC_010001	AGA	2	6	8288	8293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
117	NC_010001	ATT	2	6	8329	8334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
118	NC_010001	TCA	2	6	8343	8348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878168
119	NC_010001	TTA	2	6	8364	8369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
120	NC_010001	AGA	2	6	8390	8395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
121	NC_010001	TGA	2	6	8410	8415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
122	NC_010001	GGC	2	6	8528	8533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160878168
123	NC_010001	CAC	2	6	8600	8605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878168
124	NC_010001	TAT	2	6	8608	8613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
125	NC_010001	CAA	2	6	8623	8628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878168
126	NC_010001	TCT	2	6	8704	8709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878168
127	NC_010001	ATT	2	6	8741	8746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878168
128	NC_010001	AGA	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878168
129	NC_010001	AGT	2	6	9034	9039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
130	NC_010001	TGA	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
131	NC_010001	GTG	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878168
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