MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19503

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010000	TTAAT	2	10	387	396	40 %	60 %	0 %	0 %	160873078
2	NC_010000	GTTAT	2	10	2454	2463	20 %	60 %	20 %	0 %	160873078
3	NC_010000	TAATG	2	10	4010	4019	40 %	40 %	20 %	0 %	160873080
4	NC_010000	GCACT	2	10	4566	4575	20 %	20 %	20 %	40 %	160873081
5	NC_010000	AATAA	2	10	7090	7099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010000	TACCT	2	10	7362	7371	20 %	40 %	0 %	40 %	160873083
7	NC_010000	GAAAA	2	10	7414	7423	80 %	0 %	20 %	0 %	160873083
8	NC_010000	CTTAT	2	10	7801	7810	20 %	60 %	0 %	20 %	160873084
9	NC_010000	CCTTT	2	10	15111	15120	0 %	60 %	0 %	40 %	160873094
10	NC_010000	TGATT	2	10	18027	18036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010000	CAATC	2	10	18381	18390	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010000	AAACG	2	10	19649	19658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010000	ATTGC	2	10	20011	20020	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010000	GTAAA	2	10	20603	20612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010000	AAAAC	2	10	20852	20861	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010000	CTAAA	2	10	23888	23897	60 %	20 %	0 %	20 %	160873101
17	NC_010000	TTTCA	2	10	24810	24819	20 %	60 %	0 %	20 %	160873101
18	NC_010000	CAAAT	2	10	25746	25755	60 %	20 %	0 %	20 %	160873102
19	NC_010000	GTGAG	2	10	27795	27804	20 %	20 %	60 %	0 %	160873104
20	NC_010000	AAAAC	2	10	29013	29022	80 %	0 %	0 %	20 %	160873105
21	NC_010000	AAAAG	2	10	29489	29498	80 %	0 %	20 %	0 %	160873106
22	NC_010000	TTTCA	2	10	29707	29716	20 %	60 %	0 %	20 %	160873106
23	NC_010000	TCACG	2	10	35974	35983	20 %	20 %	20 %	40 %	160873112
24	NC_010000	TTTAT	2	10	37838	37847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010000	CAAAC	2	10	37871	37880	60 %	0 %	0 %	40 %	160873114
26	NC_010000	GCGCT	2	10	38778	38787	0 %	20 %	40 %	40 %	160873115
27	NC_010000	AAGCA	2	10	42805	42814	60 %	0 %	20 %	20 %	160873120
28	NC_010000	CAACA	2	10	42971	42980	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010000	TTAGT	2	10	45668	45677	20 %	60 %	20 %	0 %	160873124

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.