MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19503

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010000	TAAT	2	8	83	90	50 %	50 %	0 %	0 %	160873077
2	NC_010000	TCAC	2	8	1597	1604	25 %	25 %	0 %	50 %	160873078
3	NC_010000	GACA	2	8	1967	1974	50 %	0 %	25 %	25 %	160873078
4	NC_010000	CAAT	2	8	2223	2230	50 %	25 %	0 %	25 %	160873078
5	NC_010000	ATGG	2	8	2297	2304	25 %	25 %	50 %	0 %	160873078
6	NC_010000	GTAT	2	8	2367	2374	25 %	50 %	25 %	0 %	160873078
7	NC_010000	TATC	2	8	2405	2412	25 %	50 %	0 %	25 %	160873078
8	NC_010000	GAAA	2	8	2710	2717	75 %	0 %	25 %	0 %	160873078
9	NC_010000	AGTG	2	8	2959	2966	25 %	25 %	50 %	0 %	160873078
10	NC_010000	TTCG	2	8	3517	3524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010000	AGCA	2	8	3635	3642	50 %	0 %	25 %	25 %	160873079
12	NC_010000	GTTG	2	8	3780	3787	0 %	50 %	50 %	0 %	160873079
13	NC_010000	TCAA	2	8	3917	3924	50 %	25 %	0 %	25 %	160873080
14	NC_010000	GCCA	2	8	4032	4039	25 %	0 %	25 %	50 %	160873080
15	NC_010000	AATT	2	8	4069	4076	50 %	50 %	0 %	0 %	160873080
16	NC_010000	CTTG	2	8	4527	4534	0 %	50 %	25 %	25 %	160873081
17	NC_010000	TTGA	2	8	4784	4791	25 %	50 %	25 %	0 %	160873081
18	NC_010000	CTTG	2	8	5309	5316	0 %	50 %	25 %	25 %	160873081
19	NC_010000	TTCT	2	8	5524	5531	0 %	75 %	0 %	25 %	160873081
20	NC_010000	CCAA	2	8	5776	5783	50 %	0 %	0 %	50 %	160873081
21	NC_010000	AAGA	2	8	7126	7133	75 %	0 %	25 %	0 %	160873083
22	NC_010000	AGCA	2	8	7157	7164	50 %	0 %	25 %	25 %	160873083
23	NC_010000	ATAA	2	8	7396	7403	75 %	25 %	0 %	0 %	160873083
24	NC_010000	TAAA	2	8	7591	7598	75 %	25 %	0 %	0 %	160873084
25	NC_010000	ATTG	2	8	7682	7689	25 %	50 %	25 %	0 %	160873084
26	NC_010000	TACC	2	8	8062	8069	25 %	25 %	0 %	50 %	160873084
27	NC_010000	AAAC	2	8	8118	8125	75 %	0 %	0 %	25 %	160873084
28	NC_010000	AGCA	2	8	8763	8770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010000	TAAA	2	8	9320	9327	75 %	25 %	0 %	0 %	160873086
30	NC_010000	AGAT	2	8	10090	10097	50 %	25 %	25 %	0 %	160873087
31	NC_010000	CCCG	2	8	10445	10452	0 %	0 %	25 %	75 %	160873087
32	NC_010000	TGCC	2	8	10479	10486	0 %	25 %	25 %	50 %	160873087
33	NC_010000	ACTT	2	8	10825	10832	25 %	50 %	0 %	25 %	160873088
34	NC_010000	TCAA	2	8	11316	11323	50 %	25 %	0 %	25 %	160873089
35	NC_010000	TACC	2	8	11677	11684	25 %	25 %	0 %	50 %	160873089
36	NC_010000	TTCA	2	8	11938	11945	25 %	50 %	0 %	25 %	160873090
37	NC_010000	ATAA	2	8	12131	12138	75 %	25 %	0 %	0 %	160873090
38	NC_010000	TATT	2	8	12816	12823	25 %	75 %	0 %	0 %	160873092
39	NC_010000	ATTT	2	8	12919	12926	25 %	75 %	0 %	0 %	160873092
40	NC_010000	TACT	2	8	13055	13062	25 %	50 %	0 %	25 %	160873092
41	NC_010000	CTAA	2	8	13230	13237	50 %	25 %	0 %	25 %	160873092
42	NC_010000	ATTT	2	8	13519	13526	25 %	75 %	0 %	0 %	160873092
43	NC_010000	ATAA	2	8	13531	13538	75 %	25 %	0 %	0 %	160873092
44	NC_010000	GGTA	2	8	13672	13679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010000	CAGC	2	8	13795	13802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010000	CTCA	2	8	13994	14001	25 %	25 %	0 %	50 %	160873093
47	NC_010000	GCTG	2	8	14050	14057	0 %	25 %	50 %	25 %	160873093
48	NC_010000	GCTT	2	8	14316	14323	0 %	50 %	25 %	25 %	160873093
49	NC_010000	GACG	2	8	14424	14431	25 %	0 %	50 %	25 %	160873093
50	NC_010000	GGAA	2	8	14648	14655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010000	AGTT	2	8	14866	14873	25 %	50 %	25 %	0 %	160873094
52	NC_010000	TTTC	2	8	15597	15604	0 %	75 %	0 %	25 %	160873094
53	NC_010000	TAAT	2	8	15968	15975	50 %	50 %	0 %	0 %	160873095
54	NC_010000	TAGC	2	8	16236	16243	25 %	25 %	25 %	25 %	160873096
55	NC_010000	TTCA	2	8	16258	16265	25 %	50 %	0 %	25 %	160873096
56	NC_010000	TCAA	2	8	16746	16753	50 %	25 %	0 %	25 %	160873097
57	NC_010000	CTTG	2	8	16885	16892	0 %	50 %	25 %	25 %	160873097
58	NC_010000	TCAA	2	8	17088	17095	50 %	25 %	0 %	25 %	160873097
59	NC_010000	ATCA	2	8	17159	17166	50 %	25 %	0 %	25 %	160873097
60	NC_010000	TAGC	2	8	17307	17314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010000	CTAG	2	8	17348	17355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010000	TAGC	2	8	17372	17379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010000	TAGC	2	8	17396	17403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010000	AACT	2	8	18309	18316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010000	AAAG	2	8	18350	18357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010000	TGAT	2	8	18495	18502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010000	ATCC	2	8	19085	19092	25 %	25 %	0 %	50 %	160873098
68	NC_010000	TTTG	2	8	19584	19591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010000	TAAC	2	8	19805	19812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010000	AATT	2	8	20682	20689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010000	CAAA	2	8	20787	20794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010000	CAAT	2	8	20809	20816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010000	TTAA	2	8	20817	20824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010000	TAAA	2	8	21426	21433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010000	TATT	2	8	21462	21469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010000	ATCA	2	8	21595	21602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010000	ACGA	2	8	22133	22140	50 %	0 %	25 %	25 %	160873099
78	NC_010000	CATT	2	8	23017	23024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010000	CAAA	2	8	23267	23274	75 %	0 %	0 %	25 %	160873101
80	NC_010000	ACTC	2	8	23345	23352	25 %	25 %	0 %	50 %	160873101
81	NC_010000	TAAA	2	8	23441	23448	75 %	25 %	0 %	0 %	160873101
82	NC_010000	TGTT	2	8	23549	23556	0 %	75 %	25 %	0 %	160873101
83	NC_010000	CTCG	2	8	24172	24179	0 %	25 %	25 %	50 %	160873101
84	NC_010000	GGGA	2	8	24180	24187	25 %	0 %	75 %	0 %	160873101
85	NC_010000	CAAA	2	8	24613	24620	75 %	0 %	0 %	25 %	160873101
86	NC_010000	CACT	2	8	24693	24700	25 %	25 %	0 %	50 %	160873101
87	NC_010000	ATAC	2	8	25616	25623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010000	ATCA	2	8	25796	25803	50 %	25 %	0 %	25 %	160873102
89	NC_010000	TGAT	2	8	25812	25819	25 %	50 %	25 %	0 %	160873102
90	NC_010000	AATT	2	8	26998	27005	50 %	50 %	0 %	0 %	160873103
91	NC_010000	TGGC	2	8	27231	27238	0 %	25 %	50 %	25 %	160873103
92	NC_010000	CTCG	2	8	27456	27463	0 %	25 %	25 %	50 %	160873103
93	NC_010000	AGCA	2	8	27552	27559	50 %	0 %	25 %	25 %	160873103
94	NC_010000	ATGA	2	8	28001	28008	50 %	25 %	25 %	0 %	160873104
95	NC_010000	GAAA	2	8	28575	28582	75 %	0 %	25 %	0 %	160873105
96	NC_010000	GTCG	2	8	28683	28690	0 %	25 %	50 %	25 %	160873105
97	NC_010000	GCAA	2	8	30327	30334	50 %	0 %	25 %	25 %	160873107
98	NC_010000	AAGA	2	8	31282	31289	75 %	0 %	25 %	0 %	160873108
99	NC_010000	TTTA	2	8	31345	31352	25 %	75 %	0 %	0 %	160873108
100	NC_010000	TTAT	2	8	31439	31446	25 %	75 %	0 %	0 %	160873108
101	NC_010000	TTTA	2	8	31635	31642	25 %	75 %	0 %	0 %	160873108
102	NC_010000	CAAC	2	8	31782	31789	50 %	0 %	0 %	50 %	160873108
103	NC_010000	GCTG	2	8	32016	32023	0 %	25 %	50 %	25 %	160873109
104	NC_010000	AAAC	2	8	32264	32271	75 %	0 %	0 %	25 %	160873109
105	NC_010000	TCAT	2	8	32440	32447	25 %	50 %	0 %	25 %	160873109
106	NC_010000	GTAC	2	8	32682	32689	25 %	25 %	25 %	25 %	160873109
107	NC_010000	CAGT	2	8	33511	33518	25 %	25 %	25 %	25 %	160873110
108	NC_010000	ATCA	2	8	34355	34362	50 %	25 %	0 %	25 %	160873110
109	NC_010000	CCCG	2	8	34428	34435	0 %	0 %	25 %	75 %	160873110
110	NC_010000	ATCT	2	8	35507	35514	25 %	50 %	0 %	25 %	160873112
111	NC_010000	CCGA	2	8	35651	35658	25 %	0 %	25 %	50 %	160873112
112	NC_010000	ACAA	2	8	36361	36368	75 %	0 %	0 %	25 %	160873112
113	NC_010000	TGAT	2	8	36603	36610	25 %	50 %	25 %	0 %	160873112
114	NC_010000	GCAG	2	8	36825	36832	25 %	0 %	50 %	25 %	160873113
115	NC_010000	AGAT	2	8	37574	37581	50 %	25 %	25 %	0 %	160873113
116	NC_010000	AATT	2	8	40115	40122	50 %	50 %	0 %	0 %	160873117
117	NC_010000	AGAA	2	8	40278	40285	75 %	0 %	25 %	0 %	160873117
118	NC_010000	AATA	2	8	40614	40621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010000	TAAA	2	8	40625	40632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010000	ATTT	2	8	40636	40643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010000	AAAC	2	8	40786	40793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010000	ACGC	2	8	41182	41189	25 %	0 %	25 %	50 %	160873118
123	NC_010000	AGCA	2	8	41453	41460	50 %	0 %	25 %	25 %	160873118
124	NC_010000	AACG	2	8	41544	41551	50 %	0 %	25 %	25 %	160873118
125	NC_010000	CAGC	2	8	41612	41619	25 %	0 %	25 %	50 %	160873118
126	NC_010000	GAAT	2	8	42691	42698	50 %	25 %	25 %	0 %	160873120
127	NC_010000	AGTG	2	8	44395	44402	25 %	25 %	50 %	0 %	160873122
128	NC_010000	TATG	2	8	44650	44657	25 %	50 %	25 %	0 %	160873123
129	NC_010000	AATT	2	8	44671	44678	50 %	50 %	0 %	0 %	160873123
130	NC_010000	CACT	2	8	45743	45750	25 %	25 %	0 %	50 %	160873124
131	NC_010000	TGAT	2	8	46139	46146	25 %	50 %	25 %	0 %	160873124
132	NC_010000	AAGA	2	8	46801	46808	75 %	0 %	25 %	0 %	160873124
133	NC_010000	TTAT	2	8	46844	46851	25 %	75 %	0 %	0 %	160873124
134	NC_010000	AAAC	2	8	46879	46886	75 %	0 %	0 %	25 %	160873124
135	NC_010000	ATCA	2	8	47455	47462	50 %	25 %	0 %	25 %	160873125

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.