MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19503

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010000	AT	3	6	1189	1194	50 %	50 %	0 %	0 %	160873078
2	NC_010000	TA	3	6	4354	4359	50 %	50 %	0 %	0 %	160873081
3	NC_010000	TA	3	6	5487	5492	50 %	50 %	0 %	0 %	160873081
4	NC_010000	GC	3	6	6441	6446	0 %	0 %	50 %	50 %	160873082
5	NC_010000	TC	3	6	6514	6519	0 %	50 %	0 %	50 %	160873082
6	NC_010000	CA	3	6	7863	7868	50 %	0 %	0 %	50 %	160873084
7	NC_010000	AT	3	6	8021	8026	50 %	50 %	0 %	0 %	160873084
8	NC_010000	AG	3	6	8193	8198	50 %	0 %	50 %	0 %	160873084
9	NC_010000	AC	3	6	8329	8334	50 %	0 %	0 %	50 %	160873085
10	NC_010000	AG	3	6	9397	9402	50 %	0 %	50 %	0 %	160873086
11	NC_010000	CA	3	6	10006	10011	50 %	0 %	0 %	50 %	160873087
12	NC_010000	AC	3	6	12389	12394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010000	GT	3	6	12397	12402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010000	TA	3	6	12425	12430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010000	CG	3	6	13889	13894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010000	TA	3	6	14765	14770	50 %	50 %	0 %	0 %	160873094
17	NC_010000	TA	3	6	14920	14925	50 %	50 %	0 %	0 %	160873094
18	NC_010000	TA	3	6	14933	14938	50 %	50 %	0 %	0 %	160873094
19	NC_010000	AG	3	6	15233	15238	50 %	0 %	50 %	0 %	160873094
20	NC_010000	GA	3	6	15317	15322	50 %	0 %	50 %	0 %	160873094
21	NC_010000	AG	3	6	15444	15449	50 %	0 %	50 %	0 %	160873094
22	NC_010000	AT	3	6	17674	17679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010000	AG	3	6	19029	19034	50 %	0 %	50 %	0 %	160873098
24	NC_010000	AC	3	6	19770	19775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010000	TC	3	6	20674	20679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010000	AC	3	6	21011	21016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010000	CA	3	6	21633	21638	50 %	0 %	0 %	50 %	160873099
28	NC_010000	CT	3	6	21971	21976	0 %	50 %	0 %	50 %	160873099
29	NC_010000	AT	3	6	22023	22028	50 %	50 %	0 %	0 %	160873099
30	NC_010000	TC	3	6	23510	23515	0 %	50 %	0 %	50 %	160873101
31	NC_010000	CA	3	6	25999	26004	50 %	0 %	0 %	50 %	160873102
32	NC_010000	TA	3	6	31102	31107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010000	AT	3	6	35017	35022	50 %	50 %	0 %	0 %	160873111
34	NC_010000	CG	3	6	35210	35215	0 %	0 %	50 %	50 %	160873112
35	NC_010000	TC	3	6	35573	35578	0 %	50 %	0 %	50 %	160873112
36	NC_010000	CA	3	6	35773	35778	50 %	0 %	0 %	50 %	160873112
37	NC_010000	CA	3	6	36436	36441	50 %	0 %	0 %	50 %	160873112
38	NC_010000	AG	3	6	36886	36891	50 %	0 %	50 %	0 %	160873113
39	NC_010000	CA	3	6	37777	37782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010000	GC	3	6	37928	37933	0 %	0 %	50 %	50 %	160873114
41	NC_010000	AG	3	6	38024	38029	50 %	0 %	50 %	0 %	160873114
42	NC_010000	AC	3	6	38689	38694	50 %	0 %	0 %	50 %	160873115
43	NC_010000	CG	3	6	39387	39392	0 %	0 %	50 %	50 %	160873116
44	NC_010000	TG	3	6	42548	42553	0 %	50 %	50 %	0 %	160873119
45	NC_010000	AG	3	6	43254	43259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010000	AG	3	6	44377	44382	50 %	0 %	50 %	0 %	160873122
47	NC_010000	CA	3	6	44780	44785	50 %	0 %	0 %	50 %	160873123
48	NC_010000	CT	3	6	45093	45098	0 %	50 %	0 %	50 %	160873123
49	NC_010000	AT	3	6	45099	45104	50 %	50 %	0 %	0 %	160873123
50	NC_010000	TG	3	6	45953	45958	0 %	50 %	50 %	0 %	160873124
51	NC_010000	AT	3	6	46870	46875	50 %	50 %	0 %	0 %	160873124
52	NC_010000	TA	3	6	47446	47451	50 %	50 %	0 %	0 %	160873125
53	NC_010000	CA	3	6	48401	48406	50 %	0 %	0 %	50 %	160873125

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.