MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	GAAGTT	2	12	1961	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
2	NC_009999	AGATAG	2	12	2259	2270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	160873003
3	NC_009999	ATGGGT	2	12	2481	2492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	160873003
4	NC_009999	TAATGA	2	12	8893	8904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	160873009
5	NC_009999	AACGTG	2	12	10759	10770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	160873010
6	NC_009999	TAGCGT	2	12	17702	17713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	160873021
7	NC_009999	TACCCG	2	12	21589	21600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	160873024
8	NC_009999	TTTTGA	2	12	21678	21689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	160873024
9	NC_009999	ATAGAA	2	12	26001	26012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	160873025
10	NC_009999	GCTTCG	2	12	28572	28583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873028
11	NC_009999	ATAGGT	2	12	33101	33112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873030
12	NC_009999	GGCTTG	2	12	35699	35710	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	160873032
13	NC_009999	GATAGC	2	12	36904	36915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	160873034
14	NC_009999	AGATTG	2	12	43988	43999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873040
15	NC_009999	GATTGA	2	12	48983	48994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873047
16	NC_009999	TCACTA	2	12	50113	50124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873049
17	NC_009999	TTTTAG	2	12	50569	50580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	160873050
18	NC_009999	AAACTC	2	12	53742	53753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	160873052
19	NC_009999	GTTTGT	2	12	59268	59279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873059
20	NC_009999	TTATAT	2	12	70297	70308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873071
21	NC_009999	TGCTCT	2	12	71391	71402	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	160873072

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.