MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	AGGCA	2	10	685	694	40 %	0 %	40 %	20 %	160873003
2	NC_009999	GGAGC	2	10	1606	1615	20 %	0 %	60 %	20 %	160873003
3	NC_009999	AAAAT	2	10	2508	2517	80 %	20 %	0 %	0 %	160873003
4	NC_009999	ATCAG	2	10	3499	3508	40 %	20 %	20 %	20 %	160873003
5	NC_009999	ATGCA	2	10	4791	4800	40 %	20 %	20 %	20 %	160873004
6	NC_009999	GTGAC	2	10	5740	5749	20 %	20 %	40 %	20 %	160873006
7	NC_009999	TCGCT	2	10	9220	9229	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009999	CCAAA	2	10	9317	9326	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009999	CTTGT	2	10	11283	11292	0 %	60 %	20 %	20 %	160873010
10	NC_009999	GCCAA	2	10	12343	12352	40 %	0 %	20 %	40 %	160873012
11	NC_009999	TCGCT	2	10	13122	13131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009999	TTCGC	2	10	13360	13369	0 %	40 %	20 %	40 %	160873014
13	NC_009999	GATAT	2	10	14078	14087	40 %	40 %	20 %	0 %	160873014
14	NC_009999	TCGCT	2	10	16215	16224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009999	TTCGC	2	10	16453	16462	0 %	40 %	20 %	40 %	160873019
16	NC_009999	CAAAA	2	10	16659	16668	80 %	0 %	0 %	20 %	160873020
17	NC_009999	GAGAA	2	10	18526	18535	60 %	0 %	40 %	0 %	160873023
18	NC_009999	TTTAT	2	10	18951	18960	20 %	80 %	0 %	0 %	160873024
19	NC_009999	CTGTT	2	10	21162	21171	0 %	60 %	20 %	20 %	160873024
20	NC_009999	GCTGT	2	10	22385	22394	0 %	40 %	40 %	20 %	160873024
21	NC_009999	GCTCT	2	10	24647	24656	0 %	40 %	20 %	40 %	160873024
22	NC_009999	TTCTT	2	10	24729	24738	0 %	80 %	0 %	20 %	160873024
23	NC_009999	GCCGC	2	10	24756	24765	0 %	0 %	40 %	60 %	160873024
24	NC_009999	TCGTG	2	10	25011	25020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009999	TGCGC	2	10	25257	25266	0 %	20 %	40 %	40 %	160873025
26	NC_009999	TGGTT	2	10	26265	26274	0 %	60 %	40 %	0 %	160873025
27	NC_009999	CACAC	2	10	26415	26424	40 %	0 %	0 %	60 %	160873025
28	NC_009999	CATGA	2	10	26935	26944	40 %	20 %	20 %	20 %	160873025
29	NC_009999	ATAGC	2	10	27025	27034	40 %	20 %	20 %	20 %	160873025
30	NC_009999	CAACA	2	10	27771	27780	60 %	0 %	0 %	40 %	160873026
31	NC_009999	TGGTT	2	10	29590	29599	0 %	60 %	40 %	0 %	160873028
32	NC_009999	TTTTG	2	10	30361	30370	0 %	80 %	20 %	0 %	160873028
33	NC_009999	GCCTT	2	10	32345	32354	0 %	40 %	20 %	40 %	160873029
34	NC_009999	GTTGC	2	10	33536	33545	0 %	40 %	40 %	20 %	160873031
35	NC_009999	TGGTT	2	10	34187	34196	0 %	60 %	40 %	0 %	160873031
36	NC_009999	CTTTG	2	10	36462	36471	0 %	60 %	20 %	20 %	160873033
37	NC_009999	AAATG	2	10	37556	37565	60 %	20 %	20 %	0 %	160873034
38	NC_009999	TGCCA	2	10	39670	39679	20 %	20 %	20 %	40 %	160873037
39	NC_009999	ATGCA	2	10	40616	40625	40 %	20 %	20 %	20 %	160873037
40	NC_009999	ATGGC	2	10	43977	43986	20 %	20 %	40 %	20 %	160873040
41	NC_009999	AATGA	2	10	46774	46783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009999	GAAAA	2	10	48490	48499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009999	ACCGT	2	10	49824	49833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009999	AATTG	2	10	50544	50553	40 %	40 %	20 %	0 %	160873050
45	NC_009999	AAAGA	2	10	51319	51328	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009999	ATTTC	2	10	52144	52153	20 %	60 %	0 %	20 %	160873051
47	NC_009999	GGTGT	2	10	52903	52912	0 %	40 %	60 %	0 %	160873052
48	NC_009999	TTTCT	2	10	53455	53464	0 %	80 %	0 %	20 %	160873052
49	NC_009999	AGATG	2	10	53691	53700	40 %	20 %	40 %	0 %	160873052
50	NC_009999	GGTAA	2	10	54511	54520	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009999	AAAGC	2	10	56198	56207	60 %	0 %	20 %	20 %	160873054
52	NC_009999	AAGCA	2	10	56382	56391	60 %	0 %	20 %	20 %	160873054
53	NC_009999	TCGAC	2	10	58451	58460	20 %	20 %	20 %	40 %	160873058
54	NC_009999	GTGAT	2	10	59137	59146	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009999	GGTCT	2	10	60557	60566	0 %	40 %	40 %	20 %	160873060
56	NC_009999	ACGTC	2	10	60954	60963	20 %	20 %	20 %	40 %	160873060
57	NC_009999	CCACA	2	10	60965	60974	40 %	0 %	0 %	60 %	160873060
58	NC_009999	CTTCA	2	10	61201	61210	20 %	40 %	0 %	40 %	160873060
59	NC_009999	TTTTC	2	10	61241	61250	0 %	80 %	0 %	20 %	160873060
60	NC_009999	GTCAC	2	10	62057	62066	20 %	20 %	20 %	40 %	160873062
61	NC_009999	TGGTC	2	10	65988	65997	0 %	40 %	40 %	20 %	160873066
62	NC_009999	AAAAG	2	10	66821	66830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009999	AGTGA	2	10	66863	66872	40 %	20 %	40 %	0 %	160873068
64	NC_009999	GTCAC	2	10	67646	67655	20 %	20 %	20 %	40 %	160873069
65	NC_009999	GGTAT	2	10	69312	69321	20 %	40 %	40 %	0 %	160873071
66	NC_009999	CCAAG	2	10	69560	69569	40 %	0 %	20 %	40 %	160873071
67	NC_009999	ATTTC	2	10	69593	69602	20 %	60 %	0 %	20 %	160873071
68	NC_009999	ATCTG	2	10	70213	70222	20 %	40 %	20 %	20 %	160873071
69	NC_009999	TCCTT	2	10	71429	71438	0 %	60 %	0 %	40 %	160873072
70	NC_009999	CGTCT	2	10	71657	71666	0 %	40 %	20 %	40 %	160873072
71	NC_009999	GCGTT	2	10	72197	72206	0 %	40 %	40 %	20 %	160873073
72	NC_009999	CTTGG	2	10	72717	72726	0 %	40 %	40 %	20 %	160873073
73	NC_009999	ATAAA	2	10	72929	72938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009999	ATCAT	2	10	72992	73001	40 %	40 %	0 %	20 %	160873074

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.