MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	AATT	2	8	27	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009999	ATCA	2	8	61	68	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009999	CTAA	2	8	548	555	50 %	25 %	0 %	25 %	160873003
4	NC_009999	AGGT	2	8	1435	1442	25 %	25 %	50 %	0 %	160873003
5	NC_009999	CCTA	2	8	2045	2052	25 %	25 %	0 %	50 %	160873003
6	NC_009999	CTTA	2	8	2128	2135	25 %	50 %	0 %	25 %	160873003
7	NC_009999	TTGG	2	8	2400	2407	0 %	50 %	50 %	0 %	160873003
8	NC_009999	GCTT	2	8	3082	3089	0 %	50 %	25 %	25 %	160873003
9	NC_009999	TGTA	2	8	3693	3700	25 %	50 %	25 %	0 %	160873003
10	NC_009999	ACTT	2	8	3792	3799	25 %	50 %	0 %	25 %	160873003
11	NC_009999	AAGA	2	8	4101	4108	75 %	0 %	25 %	0 %	160873003
12	NC_009999	TAGG	2	8	4254	4261	25 %	25 %	50 %	0 %	160873003
13	NC_009999	TGAA	2	8	4310	4317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009999	ACTC	2	8	4371	4378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009999	GCTG	2	8	4445	4452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009999	GGAA	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	160873005
17	NC_009999	GAAA	2	8	5298	5305	75 %	0 %	25 %	0 %	160873005
18	NC_009999	AAGG	2	8	5562	5569	50 %	0 %	50 %	0 %	160873006
19	NC_009999	TCGT	2	8	5590	5597	0 %	50 %	25 %	25 %	160873006
20	NC_009999	CAAC	2	8	6078	6085	50 %	0 %	0 %	50 %	160873006
21	NC_009999	ACTG	2	8	7006	7013	25 %	25 %	25 %	25 %	160873008
22	NC_009999	CGAA	2	8	7102	7109	50 %	0 %	25 %	25 %	160873008
23	NC_009999	GCTT	2	8	7467	7474	0 %	50 %	25 %	25 %	160873008
24	NC_009999	TTGT	2	8	7902	7909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009999	AAGA	2	8	7942	7949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009999	TCAT	2	8	7957	7964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009999	GTTT	2	8	8205	8212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009999	TCGG	2	8	9207	9214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009999	GCAA	2	8	9256	9263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009999	TGTC	2	8	9507	9514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009999	GCAA	2	8	9603	9610	50 %	0 %	25 %	25 %	160873010
32	NC_009999	GCCA	2	8	9637	9644	25 %	0 %	25 %	50 %	160873010
33	NC_009999	GCGG	2	8	10408	10415	0 %	0 %	75 %	25 %	160873010
34	NC_009999	AGTT	2	8	10550	10557	25 %	50 %	25 %	0 %	160873010
35	NC_009999	TCTG	2	8	10912	10919	0 %	50 %	25 %	25 %	160873010
36	NC_009999	AGCC	2	8	11049	11056	25 %	0 %	25 %	50 %	160873010
37	NC_009999	AGAA	2	8	11129	11136	75 %	0 %	25 %	0 %	160873010
38	NC_009999	TAAA	2	8	11523	11530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009999	TGAA	2	8	11784	11791	50 %	25 %	25 %	0 %	160873011
40	NC_009999	TGGC	2	8	11834	11841	0 %	25 %	50 %	25 %	160873011
41	NC_009999	CAAA	2	8	11872	11879	75 %	0 %	0 %	25 %	160873011
42	NC_009999	TGAT	2	8	12367	12374	25 %	50 %	25 %	0 %	160873012
43	NC_009999	TTGA	2	8	12417	12424	25 %	50 %	25 %	0 %	160873012
44	NC_009999	AGCG	2	8	12785	12792	25 %	0 %	50 %	25 %	160873013
45	NC_009999	TCGG	2	8	13109	13116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009999	GCAA	2	8	13158	13165	50 %	0 %	25 %	25 %	160873014
47	NC_009999	GCGA	2	8	13400	13407	25 %	0 %	50 %	25 %	160873014
48	NC_009999	AGCA	2	8	13450	13457	50 %	0 %	25 %	25 %	160873014
49	NC_009999	AAAG	2	8	15235	15242	75 %	0 %	25 %	0 %	160873017
50	NC_009999	ATAA	2	8	15728	15735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009999	AGCA	2	8	15889	15896	50 %	0 %	25 %	25 %	160873018
52	NC_009999	GCAA	2	8	16251	16258	50 %	0 %	25 %	25 %	160873019
53	NC_009999	GCGA	2	8	16493	16500	25 %	0 %	50 %	25 %	160873019
54	NC_009999	AGCA	2	8	16543	16550	50 %	0 %	25 %	25 %	160873019
55	NC_009999	TTAA	2	8	17788	17795	50 %	50 %	0 %	0 %	160873021
56	NC_009999	CAGA	2	8	17858	17865	50 %	0 %	25 %	25 %	160873021
57	NC_009999	GTAA	2	8	19484	19491	50 %	25 %	25 %	0 %	160873024
58	NC_009999	CTTG	2	8	19621	19628	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
59	NC_009999	GAGT	2	8	19646	19653	25 %	25 %	50 %	0 %	160873024
60	NC_009999	GTTC	2	8	19777	19784	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
61	NC_009999	GTTA	2	8	20279	20286	25 %	50 %	25 %	0 %	160873024
62	NC_009999	TGAT	2	8	21009	21016	25 %	50 %	25 %	0 %	160873024
63	NC_009999	ATTG	2	8	21200	21207	25 %	50 %	25 %	0 %	160873024
64	NC_009999	TCAA	2	8	21303	21310	50 %	25 %	0 %	25 %	160873024
65	NC_009999	GTCT	2	8	21754	21761	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
66	NC_009999	TTTG	2	8	22453	22460	0 %	75 %	25 %	0 %	160873024
67	NC_009999	TTTG	2	8	22969	22976	0 %	75 %	25 %	0 %	160873024
68	NC_009999	CTTG	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
69	NC_009999	CTTT	2	8	23437	23444	0 %	75 %	0 %	25 %	160873024
70	NC_009999	GGTT	2	8	23536	23543	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
71	NC_009999	CAAA	2	8	24040	24047	75 %	0 %	0 %	25 %	160873024
72	NC_009999	GTGA	2	8	24240	24247	25 %	25 %	50 %	0 %	160873024
73	NC_009999	GCGT	2	8	25506	25513	0 %	25 %	50 %	25 %	160873025
74	NC_009999	CATC	2	8	25878	25885	25 %	25 %	0 %	50 %	160873025
75	NC_009999	CCAT	2	8	27240	27247	25 %	25 %	0 %	50 %	160873026
76	NC_009999	GGGT	2	8	27407	27414	0 %	25 %	75 %	0 %	160873026
77	NC_009999	GCAA	2	8	27453	27460	50 %	0 %	25 %	25 %	160873026
78	NC_009999	GGCT	2	8	27692	27699	0 %	25 %	50 %	25 %	160873026
79	NC_009999	CTTT	2	8	27930	27937	0 %	75 %	0 %	25 %	160873027
80	NC_009999	TAAG	2	8	27988	27995	50 %	25 %	25 %	0 %	160873027
81	NC_009999	TTGA	2	8	28495	28502	25 %	50 %	25 %	0 %	160873028
82	NC_009999	GATT	2	8	29112	29119	25 %	50 %	25 %	0 %	160873028
83	NC_009999	TGCG	2	8	29159	29166	0 %	25 %	50 %	25 %	160873028
84	NC_009999	CTTG	2	8	29776	29783	0 %	50 %	25 %	25 %	160873028
85	NC_009999	GTGA	2	8	30225	30232	25 %	25 %	50 %	0 %	160873028
86	NC_009999	TATT	2	8	30756	30763	25 %	75 %	0 %	0 %	160873028
87	NC_009999	CATA	2	8	30949	30956	50 %	25 %	0 %	25 %	160873028
88	NC_009999	GCAA	2	8	31071	31078	50 %	0 %	25 %	25 %	160873028
89	NC_009999	CTTG	2	8	31237	31244	0 %	50 %	25 %	25 %	160873028
90	NC_009999	AAGG	2	8	31966	31973	50 %	0 %	50 %	0 %	160873029
91	NC_009999	TCTT	2	8	32039	32046	0 %	75 %	0 %	25 %	160873029
92	NC_009999	GCAA	2	8	32753	32760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009999	ATGC	2	8	32774	32781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009999	GGAA	2	8	33047	33054	50 %	0 %	50 %	0 %	160873030
95	NC_009999	GAAA	2	8	33178	33185	75 %	0 %	25 %	0 %	160873030
96	NC_009999	AGCG	2	8	33387	33394	25 %	0 %	50 %	25 %	160873031
97	NC_009999	TAAC	2	8	33419	33426	50 %	25 %	0 %	25 %	160873031
98	NC_009999	TGGC	2	8	33485	33492	0 %	25 %	50 %	25 %	160873031
99	NC_009999	GTCT	2	8	33704	33711	0 %	50 %	25 %	25 %	160873031
100	NC_009999	GCTT	2	8	33958	33965	0 %	50 %	25 %	25 %	160873031
101	NC_009999	AGTT	2	8	35125	35132	25 %	50 %	25 %	0 %	160873032
102	NC_009999	TGAG	2	8	35224	35231	25 %	25 %	50 %	0 %	160873032
103	NC_009999	TCCT	2	8	35273	35280	0 %	50 %	0 %	50 %	160873032
104	NC_009999	AAGT	2	8	36055	36062	50 %	25 %	25 %	0 %	160873033
105	NC_009999	AATG	2	8	36650	36657	50 %	25 %	25 %	0 %	160873033
106	NC_009999	ATCT	2	8	37253	37260	25 %	50 %	0 %	25 %	160873034
107	NC_009999	TTGT	2	8	37771	37778	0 %	75 %	25 %	0 %	160873034
108	NC_009999	GCTT	2	8	37840	37847	0 %	50 %	25 %	25 %	160873035
109	NC_009999	GCCC	2	8	39044	39051	0 %	0 %	25 %	75 %	160873037
110	NC_009999	TGAG	2	8	39922	39929	25 %	25 %	50 %	0 %	160873037
111	NC_009999	TGCC	2	8	40301	40308	0 %	25 %	25 %	50 %	160873037
112	NC_009999	GATT	2	8	40676	40683	25 %	50 %	25 %	0 %	160873037
113	NC_009999	TCAA	2	8	40867	40874	50 %	25 %	0 %	25 %	160873037
114	NC_009999	ATAG	2	8	41067	41074	50 %	25 %	25 %	0 %	160873037
115	NC_009999	GACT	2	8	41550	41557	25 %	25 %	25 %	25 %	160873038
116	NC_009999	AATT	2	8	41898	41905	50 %	50 %	0 %	0 %	160873039
117	NC_009999	ATCA	2	8	43208	43215	50 %	25 %	0 %	25 %	160873039
118	NC_009999	CAAT	2	8	44060	44067	50 %	25 %	0 %	25 %	160873040
119	NC_009999	ATTT	2	8	44357	44364	25 %	75 %	0 %	0 %	160873041
120	NC_009999	CCAT	2	8	44687	44694	25 %	25 %	0 %	50 %	160873041
121	NC_009999	CGTT	2	8	44881	44888	0 %	50 %	25 %	25 %	160873042
122	NC_009999	CATC	2	8	45072	45079	25 %	25 %	0 %	50 %	160873042
123	NC_009999	GTTT	2	8	45709	45716	0 %	75 %	25 %	0 %	160873044
124	NC_009999	AACC	2	8	46037	46044	50 %	0 %	0 %	50 %	160873045
125	NC_009999	GGTT	2	8	46095	46102	0 %	50 %	50 %	0 %	160873045
126	NC_009999	ATTT	2	8	46582	46589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009999	ATAA	2	8	46590	46597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009999	GCTC	2	8	47385	47392	0 %	25 %	25 %	50 %	160873046
129	NC_009999	CAAG	2	8	47454	47461	50 %	0 %	25 %	25 %	160873046
130	NC_009999	AAGC	2	8	47602	47609	50 %	0 %	25 %	25 %	160873046
131	NC_009999	CTTT	2	8	47976	47983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009999	GCAA	2	8	48055	48062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009999	TTTA	2	8	49062	49069	25 %	75 %	0 %	0 %	160873047
134	NC_009999	GAAG	2	8	49322	49329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009999	GCGG	2	8	49529	49536	0 %	0 %	75 %	25 %	160873048
136	NC_009999	AATA	2	8	50139	50146	75 %	25 %	0 %	0 %	160873049
137	NC_009999	ATTG	2	8	50154	50161	25 %	50 %	25 %	0 %	160873049
138	NC_009999	GCTT	2	8	50646	50653	0 %	50 %	25 %	25 %	160873050
139	NC_009999	TACC	2	8	50935	50942	25 %	25 %	0 %	50 %	160873050
140	NC_009999	GTTG	2	8	51090	51097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009999	ATGC	2	8	51238	51245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009999	GATG	2	8	51541	51548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009999	TATT	2	8	51703	51710	25 %	75 %	0 %	0 %	160873051
144	NC_009999	TTTA	2	8	51813	51820	25 %	75 %	0 %	0 %	160873051
145	NC_009999	CAAA	2	8	52041	52048	75 %	0 %	0 %	25 %	160873051
146	NC_009999	ATTT	2	8	52205	52212	25 %	75 %	0 %	0 %	160873051
147	NC_009999	TACT	2	8	52562	52569	25 %	50 %	0 %	25 %	160873051
148	NC_009999	AAAT	2	8	52692	52699	75 %	25 %	0 %	0 %	160873051
149	NC_009999	ATCA	2	8	52755	52762	50 %	25 %	0 %	25 %	160873051
150	NC_009999	TCAA	2	8	52951	52958	50 %	25 %	0 %	25 %	160873052
151	NC_009999	TCTA	2	8	53586	53593	25 %	50 %	0 %	25 %	160873052
152	NC_009999	CCAT	2	8	53719	53726	25 %	25 %	0 %	50 %	160873052
153	NC_009999	TGTT	2	8	54083	54090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009999	TTGA	2	8	54673	54680	25 %	50 %	25 %	0 %	160873053
155	NC_009999	ATCT	2	8	54981	54988	25 %	50 %	0 %	25 %	160873053
156	NC_009999	GATT	2	8	55040	55047	25 %	50 %	25 %	0 %	160873053
157	NC_009999	CATT	2	8	55333	55340	25 %	50 %	0 %	25 %	160873053
158	NC_009999	TCAA	2	8	55924	55931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_009999	AGCA	2	8	56262	56269	50 %	0 %	25 %	25 %	160873054
160	NC_009999	GATC	2	8	56781	56788	25 %	25 %	25 %	25 %	160873055
161	NC_009999	ATGG	2	8	56988	56995	25 %	25 %	50 %	0 %	160873055
162	NC_009999	CCCA	2	8	57220	57227	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
163	NC_009999	GGAA	2	8	57956	57963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009999	CAAC	2	8	58115	58122	50 %	0 %	0 %	50 %	160873058
165	NC_009999	AAAC	2	8	59321	59328	75 %	0 %	0 %	25 %	160873059
166	NC_009999	TCAA	2	8	59629	59636	50 %	25 %	0 %	25 %	160873059
167	NC_009999	AGCG	2	8	59648	59655	25 %	0 %	50 %	25 %	160873059
168	NC_009999	GATC	2	8	60013	60020	25 %	25 %	25 %	25 %	160873059
169	NC_009999	ACGA	2	8	62209	62216	50 %	0 %	25 %	25 %	160873062
170	NC_009999	CCTT	2	8	62237	62244	0 %	50 %	0 %	50 %	160873062
171	NC_009999	TTTC	2	8	62501	62508	0 %	75 %	0 %	25 %	160873063
172	NC_009999	TTCC	2	8	62604	62611	0 %	50 %	0 %	50 %	160873063
173	NC_009999	ATCA	2	8	63630	63637	50 %	25 %	0 %	25 %	160873065
174	NC_009999	AAGC	2	8	63650	63657	50 %	0 %	25 %	25 %	160873065
175	NC_009999	GGGT	2	8	63726	63733	0 %	25 %	75 %	0 %	160873065
176	NC_009999	TGAA	2	8	64011	64018	50 %	25 %	25 %	0 %	160873065
177	NC_009999	AAGA	2	8	64123	64130	75 %	0 %	25 %	0 %	160873065
178	NC_009999	ACTT	2	8	64649	64656	25 %	50 %	0 %	25 %	160873066
179	NC_009999	TGGG	2	8	65087	65094	0 %	25 %	75 %	0 %	160873066
180	NC_009999	AATA	2	8	65301	65308	75 %	25 %	0 %	0 %	160873066
181	NC_009999	AGCG	2	8	65421	65428	25 %	0 %	50 %	25 %	160873066
182	NC_009999	CAAC	2	8	65581	65588	50 %	0 %	0 %	50 %	160873066
183	NC_009999	GCAT	2	8	66187	66194	25 %	25 %	25 %	25 %	160873066
184	NC_009999	TTAG	2	8	66319	66326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009999	ACGA	2	8	67798	67805	50 %	0 %	25 %	25 %	160873069
186	NC_009999	CCTT	2	8	67826	67833	0 %	50 %	0 %	50 %	160873069
187	NC_009999	TTTC	2	8	68090	68097	0 %	75 %	0 %	25 %	160873070
188	NC_009999	TTCC	2	8	68193	68200	0 %	50 %	0 %	50 %	160873070
189	NC_009999	TGAA	2	8	68514	68521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009999	TTTG	2	8	68896	68903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009999	GTTC	2	8	69029	69036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_009999	TCGT	2	8	69213	69220	0 %	50 %	25 %	25 %	160873071
193	NC_009999	GTTT	2	8	70409	70416	0 %	75 %	25 %	0 %	160873071
194	NC_009999	GCAT	2	8	70666	70673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_009999	CTAG	2	8	70725	70732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
196	NC_009999	GATT	2	8	70817	70824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_009999	AATT	2	8	70834	70841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009999	ATTC	2	8	71020	71027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
199	NC_009999	GGAA	2	8	71050	71057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
200	NC_009999	ATGT	2	8	71517	71524	25 %	50 %	25 %	0 %	160873072
201	NC_009999	GGTG	2	8	72294	72301	0 %	25 %	75 %	0 %	160873073
202	NC_009999	CAAC	2	8	72511	72518	50 %	0 %	0 %	50 %	160873073
203	NC_009999	ATAG	2	8	73174	73181	50 %	25 %	25 %	0 %	160873074
204	NC_009999	TAAT	2	8	73826	73833	50 %	50 %	0 %	0 %	160873074
205	NC_009999	CAAA	2	8	74177	74184	75 %	0 %	0 %	25 %	160873075
206	NC_009999	GAAT	2	8	74216	74223	50 %	25 %	25 %	0 %	160873075
207	NC_009999	GATT	2	8	74387	74394	25 %	50 %	25 %	0 %	160873075
208	NC_009999	TGAA	2	8	74763	74770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.