MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	CTAA	2	8	548	555	50 %	25 %	0 %	25 %	160873003
2	NC_009999	AGGT	2	8	1435	1442	25 %	25 %	50 %	0 %	160873003
3	NC_009999	CCTA	2	8	2045	2052	25 %	25 %	0 %	50 %	160873003
4	NC_009999	CTTA	2	8	2128	2135	25 %	50 %	0 %	25 %	160873003
5	NC_009999	TTGG	2	8	2400	2407	0 %	50 %	50 %	0 %	160873003
6	NC_009999	GCTT	2	8	3082	3089	0 %	50 %	25 %	25 %	160873003
7	NC_009999	TGTA	2	8	3693	3700	25 %	50 %	25 %	0 %	160873003
8	NC_009999	ACTT	2	8	3792	3799	25 %	50 %	0 %	25 %	160873003
9	NC_009999	AAGA	2	8	4101	4108	75 %	0 %	25 %	0 %	160873003
10	NC_009999	TAGG	2	8	4254	4261	25 %	25 %	50 %	0 %	160873003
11	NC_009999	GGAA	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	160873005
12	NC_009999	GAAA	2	8	5298	5305	75 %	0 %	25 %	0 %	160873005
13	NC_009999	AAGG	2	8	5562	5569	50 %	0 %	50 %	0 %	160873006
14	NC_009999	TCGT	2	8	5590	5597	0 %	50 %	25 %	25 %	160873006
15	NC_009999	CAAC	2	8	6078	6085	50 %	0 %	0 %	50 %	160873006
16	NC_009999	ACTG	2	8	7006	7013	25 %	25 %	25 %	25 %	160873008
17	NC_009999	CGAA	2	8	7102	7109	50 %	0 %	25 %	25 %	160873008
18	NC_009999	GCTT	2	8	7467	7474	0 %	50 %	25 %	25 %	160873008
19	NC_009999	GCAA	2	8	9603	9610	50 %	0 %	25 %	25 %	160873010
20	NC_009999	GCCA	2	8	9637	9644	25 %	0 %	25 %	50 %	160873010
21	NC_009999	GCGG	2	8	10408	10415	0 %	0 %	75 %	25 %	160873010
22	NC_009999	AGTT	2	8	10550	10557	25 %	50 %	25 %	0 %	160873010
23	NC_009999	TCTG	2	8	10912	10919	0 %	50 %	25 %	25 %	160873010
24	NC_009999	AGCC	2	8	11049	11056	25 %	0 %	25 %	50 %	160873010
25	NC_009999	AGAA	2	8	11129	11136	75 %	0 %	25 %	0 %	160873010
26	NC_009999	TGAA	2	8	11784	11791	50 %	25 %	25 %	0 %	160873011
27	NC_009999	TGGC	2	8	11834	11841	0 %	25 %	50 %	25 %	160873011
28	NC_009999	CAAA	2	8	11872	11879	75 %	0 %	0 %	25 %	160873011
29	NC_009999	TGAT	2	8	12367	12374	25 %	50 %	25 %	0 %	160873012
30	NC_009999	TTGA	2	8	12417	12424	25 %	50 %	25 %	0 %	160873012
31	NC_009999	AGCG	2	8	12785	12792	25 %	0 %	50 %	25 %	160873013
32	NC_009999	GCAA	2	8	13158	13165	50 %	0 %	25 %	25 %	160873014
33	NC_009999	GCGA	2	8	13400	13407	25 %	0 %	50 %	25 %	160873014
34	NC_009999	AGCA	2	8	13450	13457	50 %	0 %	25 %	25 %	160873014
35	NC_009999	AAAG	2	8	15235	15242	75 %	0 %	25 %	0 %	160873017
36	NC_009999	AGCA	2	8	15889	15896	50 %	0 %	25 %	25 %	160873018
37	NC_009999	GCAA	2	8	16251	16258	50 %	0 %	25 %	25 %	160873019
38	NC_009999	GCGA	2	8	16493	16500	25 %	0 %	50 %	25 %	160873019
39	NC_009999	AGCA	2	8	16543	16550	50 %	0 %	25 %	25 %	160873019
40	NC_009999	TTAA	2	8	17788	17795	50 %	50 %	0 %	0 %	160873021
41	NC_009999	CAGA	2	8	17858	17865	50 %	0 %	25 %	25 %	160873021
42	NC_009999	GTAA	2	8	19484	19491	50 %	25 %	25 %	0 %	160873024
43	NC_009999	CTTG	2	8	19621	19628	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
44	NC_009999	GAGT	2	8	19646	19653	25 %	25 %	50 %	0 %	160873024
45	NC_009999	GTTC	2	8	19777	19784	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
46	NC_009999	GTTA	2	8	20279	20286	25 %	50 %	25 %	0 %	160873024
47	NC_009999	TGAT	2	8	21009	21016	25 %	50 %	25 %	0 %	160873024
48	NC_009999	ATTG	2	8	21200	21207	25 %	50 %	25 %	0 %	160873024
49	NC_009999	TCAA	2	8	21303	21310	50 %	25 %	0 %	25 %	160873024
50	NC_009999	GTCT	2	8	21754	21761	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
51	NC_009999	TTTG	2	8	22453	22460	0 %	75 %	25 %	0 %	160873024
52	NC_009999	TTTG	2	8	22969	22976	0 %	75 %	25 %	0 %	160873024
53	NC_009999	CTTG	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	160873024
54	NC_009999	CTTT	2	8	23437	23444	0 %	75 %	0 %	25 %	160873024
55	NC_009999	GGTT	2	8	23536	23543	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
56	NC_009999	CAAA	2	8	24040	24047	75 %	0 %	0 %	25 %	160873024
57	NC_009999	GTGA	2	8	24240	24247	25 %	25 %	50 %	0 %	160873024
58	NC_009999	GCGT	2	8	25506	25513	0 %	25 %	50 %	25 %	160873025
59	NC_009999	CATC	2	8	25878	25885	25 %	25 %	0 %	50 %	160873025
60	NC_009999	CCAT	2	8	27240	27247	25 %	25 %	0 %	50 %	160873026
61	NC_009999	GGGT	2	8	27407	27414	0 %	25 %	75 %	0 %	160873026
62	NC_009999	GCAA	2	8	27453	27460	50 %	0 %	25 %	25 %	160873026
63	NC_009999	GGCT	2	8	27692	27699	0 %	25 %	50 %	25 %	160873026
64	NC_009999	CTTT	2	8	27930	27937	0 %	75 %	0 %	25 %	160873027
65	NC_009999	TAAG	2	8	27988	27995	50 %	25 %	25 %	0 %	160873027
66	NC_009999	TTGA	2	8	28495	28502	25 %	50 %	25 %	0 %	160873028
67	NC_009999	GATT	2	8	29112	29119	25 %	50 %	25 %	0 %	160873028
68	NC_009999	TGCG	2	8	29159	29166	0 %	25 %	50 %	25 %	160873028
69	NC_009999	CTTG	2	8	29776	29783	0 %	50 %	25 %	25 %	160873028
70	NC_009999	GTGA	2	8	30225	30232	25 %	25 %	50 %	0 %	160873028
71	NC_009999	TATT	2	8	30756	30763	25 %	75 %	0 %	0 %	160873028
72	NC_009999	CATA	2	8	30949	30956	50 %	25 %	0 %	25 %	160873028
73	NC_009999	GCAA	2	8	31071	31078	50 %	0 %	25 %	25 %	160873028
74	NC_009999	CTTG	2	8	31237	31244	0 %	50 %	25 %	25 %	160873028
75	NC_009999	AAGG	2	8	31966	31973	50 %	0 %	50 %	0 %	160873029
76	NC_009999	TCTT	2	8	32039	32046	0 %	75 %	0 %	25 %	160873029
77	NC_009999	GGAA	2	8	33047	33054	50 %	0 %	50 %	0 %	160873030
78	NC_009999	GAAA	2	8	33178	33185	75 %	0 %	25 %	0 %	160873030
79	NC_009999	AGCG	2	8	33387	33394	25 %	0 %	50 %	25 %	160873031
80	NC_009999	TAAC	2	8	33419	33426	50 %	25 %	0 %	25 %	160873031
81	NC_009999	TGGC	2	8	33485	33492	0 %	25 %	50 %	25 %	160873031
82	NC_009999	GTCT	2	8	33704	33711	0 %	50 %	25 %	25 %	160873031
83	NC_009999	GCTT	2	8	33958	33965	0 %	50 %	25 %	25 %	160873031
84	NC_009999	AGTT	2	8	35125	35132	25 %	50 %	25 %	0 %	160873032
85	NC_009999	TGAG	2	8	35224	35231	25 %	25 %	50 %	0 %	160873032
86	NC_009999	TCCT	2	8	35273	35280	0 %	50 %	0 %	50 %	160873032
87	NC_009999	AAGT	2	8	36055	36062	50 %	25 %	25 %	0 %	160873033
88	NC_009999	AATG	2	8	36650	36657	50 %	25 %	25 %	0 %	160873033
89	NC_009999	ATCT	2	8	37253	37260	25 %	50 %	0 %	25 %	160873034
90	NC_009999	TTGT	2	8	37771	37778	0 %	75 %	25 %	0 %	160873034
91	NC_009999	GCTT	2	8	37840	37847	0 %	50 %	25 %	25 %	160873035
92	NC_009999	GCCC	2	8	39044	39051	0 %	0 %	25 %	75 %	160873037
93	NC_009999	TGAG	2	8	39922	39929	25 %	25 %	50 %	0 %	160873037
94	NC_009999	TGCC	2	8	40301	40308	0 %	25 %	25 %	50 %	160873037
95	NC_009999	GATT	2	8	40676	40683	25 %	50 %	25 %	0 %	160873037
96	NC_009999	TCAA	2	8	40867	40874	50 %	25 %	0 %	25 %	160873037
97	NC_009999	ATAG	2	8	41067	41074	50 %	25 %	25 %	0 %	160873037
98	NC_009999	GACT	2	8	41550	41557	25 %	25 %	25 %	25 %	160873038
99	NC_009999	AATT	2	8	41898	41905	50 %	50 %	0 %	0 %	160873039
100	NC_009999	ATCA	2	8	43208	43215	50 %	25 %	0 %	25 %	160873039
101	NC_009999	CAAT	2	8	44060	44067	50 %	25 %	0 %	25 %	160873040
102	NC_009999	ATTT	2	8	44357	44364	25 %	75 %	0 %	0 %	160873041
103	NC_009999	CCAT	2	8	44687	44694	25 %	25 %	0 %	50 %	160873041
104	NC_009999	CGTT	2	8	44881	44888	0 %	50 %	25 %	25 %	160873042
105	NC_009999	CATC	2	8	45072	45079	25 %	25 %	0 %	50 %	160873042
106	NC_009999	GTTT	2	8	45709	45716	0 %	75 %	25 %	0 %	160873044
107	NC_009999	AACC	2	8	46037	46044	50 %	0 %	0 %	50 %	160873045
108	NC_009999	GGTT	2	8	46095	46102	0 %	50 %	50 %	0 %	160873045
109	NC_009999	GCTC	2	8	47385	47392	0 %	25 %	25 %	50 %	160873046
110	NC_009999	CAAG	2	8	47454	47461	50 %	0 %	25 %	25 %	160873046
111	NC_009999	AAGC	2	8	47602	47609	50 %	0 %	25 %	25 %	160873046
112	NC_009999	TTTA	2	8	49062	49069	25 %	75 %	0 %	0 %	160873047
113	NC_009999	GCGG	2	8	49529	49536	0 %	0 %	75 %	25 %	160873048
114	NC_009999	AATA	2	8	50139	50146	75 %	25 %	0 %	0 %	160873049
115	NC_009999	ATTG	2	8	50154	50161	25 %	50 %	25 %	0 %	160873049
116	NC_009999	GCTT	2	8	50646	50653	0 %	50 %	25 %	25 %	160873050
117	NC_009999	TACC	2	8	50935	50942	25 %	25 %	0 %	50 %	160873050
118	NC_009999	TATT	2	8	51703	51710	25 %	75 %	0 %	0 %	160873051
119	NC_009999	TTTA	2	8	51813	51820	25 %	75 %	0 %	0 %	160873051
120	NC_009999	CAAA	2	8	52041	52048	75 %	0 %	0 %	25 %	160873051
121	NC_009999	ATTT	2	8	52205	52212	25 %	75 %	0 %	0 %	160873051
122	NC_009999	TACT	2	8	52562	52569	25 %	50 %	0 %	25 %	160873051
123	NC_009999	AAAT	2	8	52692	52699	75 %	25 %	0 %	0 %	160873051
124	NC_009999	ATCA	2	8	52755	52762	50 %	25 %	0 %	25 %	160873051
125	NC_009999	TCAA	2	8	52951	52958	50 %	25 %	0 %	25 %	160873052
126	NC_009999	TCTA	2	8	53586	53593	25 %	50 %	0 %	25 %	160873052
127	NC_009999	CCAT	2	8	53719	53726	25 %	25 %	0 %	50 %	160873052
128	NC_009999	TTGA	2	8	54673	54680	25 %	50 %	25 %	0 %	160873053
129	NC_009999	ATCT	2	8	54981	54988	25 %	50 %	0 %	25 %	160873053
130	NC_009999	GATT	2	8	55040	55047	25 %	50 %	25 %	0 %	160873053
131	NC_009999	CATT	2	8	55333	55340	25 %	50 %	0 %	25 %	160873053
132	NC_009999	AGCA	2	8	56262	56269	50 %	0 %	25 %	25 %	160873054
133	NC_009999	GATC	2	8	56781	56788	25 %	25 %	25 %	25 %	160873055
134	NC_009999	ATGG	2	8	56988	56995	25 %	25 %	50 %	0 %	160873055
135	NC_009999	CAAC	2	8	58115	58122	50 %	0 %	0 %	50 %	160873058
136	NC_009999	AAAC	2	8	59321	59328	75 %	0 %	0 %	25 %	160873059
137	NC_009999	TCAA	2	8	59629	59636	50 %	25 %	0 %	25 %	160873059
138	NC_009999	AGCG	2	8	59648	59655	25 %	0 %	50 %	25 %	160873059
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.