MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	TC	3	6	881	886	0 %	50 %	0 %	50 %	160873003
2	NC_009999	GC	3	6	1194	1199	0 %	0 %	50 %	50 %	160873003
3	NC_009999	AG	3	6	2848	2853	50 %	0 %	50 %	0 %	160873003
4	NC_009999	AG	3	6	3992	3997	50 %	0 %	50 %	0 %	160873003
5	NC_009999	TA	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	160873004
6	NC_009999	GA	3	6	5334	5339	50 %	0 %	50 %	0 %	160873005
7	NC_009999	TG	3	6	6841	6846	0 %	50 %	50 %	0 %	160873008
8	NC_009999	TG	3	6	7395	7400	0 %	50 %	50 %	0 %	160873008
9	NC_009999	GC	4	8	8417	8424	0 %	0 %	50 %	50 %	160873009
10	NC_009999	CG	3	6	10052	10057	0 %	0 %	50 %	50 %	160873010
11	NC_009999	CG	3	6	10521	10526	0 %	0 %	50 %	50 %	160873010
12	NC_009999	GC	3	6	13374	13379	0 %	0 %	50 %	50 %	160873014
13	NC_009999	AC	3	6	13464	13469	50 %	0 %	0 %	50 %	160873014
14	NC_009999	AG	3	6	14427	14432	50 %	0 %	50 %	0 %	160873015
15	NC_009999	CA	3	6	15003	15008	50 %	0 %	0 %	50 %	160873016
16	NC_009999	CG	3	6	15102	15107	0 %	0 %	50 %	50 %	160873016
17	NC_009999	CA	3	6	15285	15290	50 %	0 %	0 %	50 %	160873017
18	NC_009999	GC	3	6	16467	16472	0 %	0 %	50 %	50 %	160873019
19	NC_009999	AC	3	6	16558	16563	50 %	0 %	0 %	50 %	160873019
20	NC_009999	GT	3	6	16762	16767	0 %	50 %	50 %	0 %	160873020
21	NC_009999	TA	3	6	17648	17653	50 %	50 %	0 %	0 %	160873021
22	NC_009999	AC	3	6	18674	18679	50 %	0 %	0 %	50 %	160873023
23	NC_009999	CG	4	8	19688	19695	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
24	NC_009999	CG	3	6	20267	20272	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
25	NC_009999	TG	3	6	20411	20416	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
26	NC_009999	GC	5	10	21285	21294	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
27	NC_009999	GT	3	6	21479	21484	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
28	NC_009999	TG	3	6	21525	21530	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
29	NC_009999	GC	3	6	21841	21846	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
30	NC_009999	AT	3	6	22216	22221	50 %	50 %	0 %	0 %	160873024
31	NC_009999	GT	3	6	22875	22880	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
32	NC_009999	CT	3	6	23526	23531	0 %	50 %	0 %	50 %	160873024
33	NC_009999	CG	3	6	23665	23670	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
34	NC_009999	GC	4	8	24199	24206	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
35	NC_009999	GC	3	6	26373	26378	0 %	0 %	50 %	50 %	160873025
36	NC_009999	CA	3	6	26809	26814	50 %	0 %	0 %	50 %	160873025
37	NC_009999	TG	3	6	27312	27317	0 %	50 %	50 %	0 %	160873026
38	NC_009999	TG	3	6	27369	27374	0 %	50 %	50 %	0 %	160873026
39	NC_009999	GT	3	6	27671	27676	0 %	50 %	50 %	0 %	160873026
40	NC_009999	CG	3	6	27707	27712	0 %	0 %	50 %	50 %	160873026
41	NC_009999	TA	3	6	27718	27723	50 %	50 %	0 %	0 %	160873026
42	NC_009999	CT	3	6	28595	28600	0 %	50 %	0 %	50 %	160873028
43	NC_009999	CT	3	6	28635	28640	0 %	50 %	0 %	50 %	160873028
44	NC_009999	GC	3	6	29909	29914	0 %	0 %	50 %	50 %	160873028
45	NC_009999	CG	3	6	30316	30321	0 %	0 %	50 %	50 %	160873028
46	NC_009999	CG	3	6	31887	31892	0 %	0 %	50 %	50 %	160873029
47	NC_009999	TG	3	6	32129	32134	0 %	50 %	50 %	0 %	160873029
48	NC_009999	GA	3	6	33371	33376	50 %	0 %	50 %	0 %	160873031
49	NC_009999	GC	3	6	33643	33648	0 %	0 %	50 %	50 %	160873031
50	NC_009999	GC	3	6	34115	34120	0 %	0 %	50 %	50 %	160873031
51	NC_009999	GC	3	6	34378	34383	0 %	0 %	50 %	50 %	160873032
52	NC_009999	GC	3	6	34403	34408	0 %	0 %	50 %	50 %	160873032
53	NC_009999	AC	3	6	34451	34456	50 %	0 %	0 %	50 %	160873032
54	NC_009999	TG	3	6	36532	36537	0 %	50 %	50 %	0 %	160873033
55	NC_009999	CG	3	6	37471	37476	0 %	0 %	50 %	50 %	160873034
56	NC_009999	CG	3	6	37913	37918	0 %	0 %	50 %	50 %	160873035
57	NC_009999	GT	3	6	37975	37980	0 %	50 %	50 %	0 %	160873035
58	NC_009999	CG	3	6	38129	38134	0 %	0 %	50 %	50 %	160873035
59	NC_009999	CG	3	6	38755	38760	0 %	0 %	50 %	50 %	160873036
60	NC_009999	GC	3	6	39001	39006	0 %	0 %	50 %	50 %	160873037
61	NC_009999	CA	3	6	39366	39371	50 %	0 %	0 %	50 %	160873037
62	NC_009999	GT	3	6	40718	40723	0 %	50 %	50 %	0 %	160873037
63	NC_009999	AC	3	6	41702	41707	50 %	0 %	0 %	50 %	160873038
64	NC_009999	CG	3	6	44001	44006	0 %	0 %	50 %	50 %	160873040
65	NC_009999	GC	3	6	44202	44207	0 %	0 %	50 %	50 %	160873040
66	NC_009999	CG	3	6	44340	44345	0 %	0 %	50 %	50 %	160873041
67	NC_009999	TA	3	6	44508	44513	50 %	50 %	0 %	0 %	160873041
68	NC_009999	GT	3	6	45099	45104	0 %	50 %	50 %	0 %	160873042
69	NC_009999	AC	3	6	45260	45265	50 %	0 %	0 %	50 %	160873043
70	NC_009999	GT	3	6	47465	47470	0 %	50 %	50 %	0 %	160873046
71	NC_009999	CT	3	6	50585	50590	0 %	50 %	0 %	50 %	160873050
72	NC_009999	GT	3	6	50731	50736	0 %	50 %	50 %	0 %	160873050
73	NC_009999	CT	3	6	52222	52227	0 %	50 %	0 %	50 %	160873051
74	NC_009999	TA	4	8	52643	52650	50 %	50 %	0 %	0 %	160873051
75	NC_009999	AT	3	6	52849	52854	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
76	NC_009999	AT	3	6	53040	53045	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
77	NC_009999	AT	3	6	53120	53125	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
78	NC_009999	TA	3	6	53577	53582	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
79	NC_009999	TC	4	8	55133	55140	0 %	50 %	0 %	50 %	160873053
80	NC_009999	TG	3	6	55230	55235	0 %	50 %	50 %	0 %	160873053
81	NC_009999	AT	3	6	55423	55428	50 %	50 %	0 %	0 %	160873053
82	NC_009999	CG	3	6	58387	58392	0 %	0 %	50 %	50 %	160873058
83	NC_009999	GA	3	6	59796	59801	50 %	0 %	50 %	0 %	160873059
84	NC_009999	AT	3	6	60790	60795	50 %	50 %	0 %	0 %	160873060
85	NC_009999	AG	3	6	61370	61375	50 %	0 %	50 %	0 %	160873061
86	NC_009999	TC	3	6	62467	62472	0 %	50 %	0 %	50 %	160873063
87	NC_009999	TG	3	6	63317	63322	0 %	50 %	50 %	0 %	160873065
88	NC_009999	AT	5	10	65009	65018	50 %	50 %	0 %	0 %	160873066
89	NC_009999	TA	3	6	65700	65705	50 %	50 %	0 %	0 %	160873066
90	NC_009999	CT	3	6	66700	66705	0 %	50 %	0 %	50 %	160873067
91	NC_009999	TC	3	6	68056	68061	0 %	50 %	0 %	50 %	160873070
92	NC_009999	AG	3	6	71284	71289	50 %	0 %	50 %	0 %	160873072
93	NC_009999	TA	3	6	71301	71306	50 %	50 %	0 %	0 %	160873072
94	NC_009999	CT	3	6	73843	73848	0 %	50 %	0 %	50 %	160873074

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.