MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19501

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009998	GATCGT	2	12	3854	3865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	160872937
2	NC_009998	ATAGGT	2	12	5190	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160872938
3	NC_009998	GGCTTG	2	12	7791	7802	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	160872940
4	NC_009998	GATAGC	2	12	8996	9007	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	160872942
5	NC_009998	GCTAAT	2	12	21657	21668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	160872956
6	NC_009998	AGCAAG	2	12	25695	25706	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	160872960
7	NC_009998	GCAAAA	2	12	27316	27327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	160872960
8	NC_009998	GTCTTG	2	12	29255	29266	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	160872961
9	NC_009998	TGGAAC	2	12	30942	30953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	160872963
10	NC_009998	ATGAAG	2	12	31202	31213	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	160872963
11	NC_009998	AAAGAT	2	12	35628	35639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	160872966
12	NC_009998	TAAAAA	2	12	45465	45476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	160872975
13	NC_009998	ATTAAA	2	12	45618	45629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160872975
14	NC_009998	ATGTTA	2	12	50690	50701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160872977
15	NC_009998	ATTTTT	2	12	51300	51311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009998	CACGTT	2	12	54395	54406	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	160872981
17	NC_009998	ATGAAA	2	12	54519	54530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	160872981
18	NC_009998	TGTTTT	2	12	55204	55215	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	160872984
19	NC_009998	TAAGCT	2	12	64424	64435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009998	TAGCGT	2	12	66128	66139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	160872997
21	NC_009998	TACCCG	2	12	70016	70027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	160873000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.