MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19501

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009998	TTTTG	2	10	2462	2471	0 %	80 %	20 %	0 %	160872936
2	NC_009998	CGGCG	2	10	4424	4433	0 %	0 %	60 %	40 %	160872937
3	NC_009998	TGGTT	2	10	6276	6285	0 %	60 %	40 %	0 %	160872939
4	NC_009998	CTTTG	2	10	8554	8563	0 %	60 %	20 %	20 %	160872941
5	NC_009998	AAATG	2	10	9648	9657	60 %	20 %	20 %	0 %	160872942
6	NC_009998	TGCCA	2	10	11762	11771	20 %	20 %	20 %	40 %	160872945
7	NC_009998	CTTCT	2	10	12442	12451	0 %	60 %	0 %	40 %	160872945
8	NC_009998	ATGGC	2	10	16069	16078	20 %	20 %	40 %	20 %	160872948
9	NC_009998	GACGA	2	10	16474	16483	40 %	0 %	40 %	20 %	160872949
10	NC_009998	TGTTT	2	10	16530	16539	0 %	80 %	20 %	0 %	160872949
11	NC_009998	TGAAA	2	10	17963	17972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009998	GAAAA	2	10	24780	24789	80 %	0 %	20 %	0 %	160872960
13	NC_009998	TTTCA	2	10	26241	26250	20 %	60 %	0 %	20 %	160872960
14	NC_009998	AGGAT	2	10	29602	29611	40 %	20 %	40 %	0 %	160872961
15	NC_009998	ATTGG	2	10	29925	29934	20 %	40 %	40 %	0 %	160872961
16	NC_009998	TTTCT	2	10	30066	30075	0 %	80 %	0 %	20 %	160872961
17	NC_009998	ATAAA	2	10	31280	31289	80 %	20 %	0 %	0 %	160872963
18	NC_009998	TGTAA	2	10	34892	34901	40 %	40 %	20 %	0 %	160872966
19	NC_009998	ATGAC	2	10	36192	36201	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009998	ATTGG	2	10	36648	36657	20 %	40 %	40 %	0 %	160872967
21	NC_009998	AGAAT	2	10	37256	37265	60 %	20 %	20 %	0 %	160872967
22	NC_009998	ATCAG	2	10	37441	37450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009998	AGATC	2	10	39083	39092	40 %	20 %	20 %	20 %	160872970
24	NC_009998	TTGGT	2	10	42341	42350	0 %	60 %	40 %	0 %	160872972
25	NC_009998	TATTT	2	10	42563	42572	20 %	80 %	0 %	0 %	160872972
26	NC_009998	TGAAT	2	10	45549	45558	40 %	40 %	20 %	0 %	160872975
27	NC_009998	TAGAA	2	10	46110	46119	60 %	20 %	20 %	0 %	160872975
28	NC_009998	TCAGC	2	10	47717	47726	20 %	20 %	20 %	40 %	160872975
29	NC_009998	TACAA	2	10	48614	48623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009998	AATAC	2	10	49569	49578	60 %	20 %	0 %	20 %	160872977
31	NC_009998	AATTA	2	10	56424	56433	60 %	40 %	0 %	0 %	160872985
32	NC_009998	TTTGT	2	10	56639	56648	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009998	GCTTA	2	10	56814	56823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009998	TTTGG	2	10	58132	58141	0 %	60 %	40 %	0 %	160872987
35	NC_009998	TCGCT	2	10	58355	58364	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009998	CCAAA	2	10	58453	58462	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009998	GCCAA	2	10	61474	61483	40 %	0 %	20 %	40 %	160872990
38	NC_009998	TCGCT	2	10	62248	62257	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009998	TTCGC	2	10	62486	62495	0 %	40 %	20 %	40 %	160872992
40	NC_009998	GATAT	2	10	63204	63213	40 %	40 %	20 %	0 %	160872992
41	NC_009998	TCGCT	2	10	64642	64651	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009998	TTCGC	2	10	64880	64889	0 %	40 %	20 %	40 %	160872996
43	NC_009998	CAAAA	2	10	65085	65094	80 %	0 %	0 %	20 %	160872996
44	NC_009998	GAGAA	2	10	66953	66962	60 %	0 %	40 %	0 %	160872999
45	NC_009998	TTTAT	2	10	67378	67387	20 %	80 %	0 %	0 %	160873000
46	NC_009998	CTGTT	2	10	69589	69598	0 %	60 %	20 %	20 %	160873000
47	NC_009998	GCGTG	2	10	70127	70136	0 %	20 %	60 %	20 %	160873000
48	NC_009998	GCTGT	2	10	70812	70821	0 %	40 %	40 %	20 %	160873000
49	NC_009998	TTTGT	2	10	71396	71405	0 %	80 %	20 %	0 %	160873000
50	NC_009998	GCTCT	2	10	73074	73083	0 %	40 %	20 %	40 %	160873000
51	NC_009998	TTCTT	2	10	73156	73165	0 %	80 %	0 %	20 %	160873000
52	NC_009998	GCCGC	2	10	73183	73192	0 %	0 %	40 %	60 %	160873000
53	NC_009998	TGGTT	2	10	74692	74701	0 %	60 %	40 %	0 %	160873001
54	NC_009998	CACAC	2	10	74842	74851	40 %	0 %	0 %	60 %	160873001
55	NC_009998	TAGCA	2	10	75453	75462	40 %	20 %	20 %	20 %	160873001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.