MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19501

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009998	CTTT	2	8	37	44	0 %	75 %	0 %	25 %	160872935
2	NC_009998	TTGG	2	8	59	66	0 %	50 %	50 %	0 %	160872935
3	NC_009998	TTGA	2	8	602	609	25 %	50 %	25 %	0 %	160872936
4	NC_009998	CTTC	2	8	740	747	0 %	50 %	0 %	50 %	160872936
5	NC_009998	TGAT	2	8	813	820	25 %	50 %	25 %	0 %	160872936
6	NC_009998	TCGC	2	8	1270	1277	0 %	25 %	25 %	50 %	160872936
7	NC_009998	CTTG	2	8	1877	1884	0 %	50 %	25 %	25 %	160872936
8	NC_009998	GTGA	2	8	2326	2333	25 %	25 %	50 %	0 %	160872936
9	NC_009998	ATTG	2	8	2392	2399	25 %	50 %	25 %	0 %	160872936
10	NC_009998	TATT	2	8	2857	2864	25 %	75 %	0 %	0 %	160872936
11	NC_009998	CATA	2	8	3050	3057	50 %	25 %	0 %	25 %	160872936
12	NC_009998	GCAA	2	8	3172	3179	50 %	0 %	25 %	25 %	160872936
13	NC_009998	AAGG	2	8	4067	4074	50 %	0 %	50 %	0 %	160872937
14	NC_009998	TCTT	2	8	4140	4147	0 %	75 %	0 %	25 %	160872937
15	NC_009998	CCGC	2	8	4176	4183	0 %	0 %	25 %	75 %	160872937
16	NC_009998	CTAC	2	8	4263	4270	25 %	25 %	0 %	50 %	160872937
17	NC_009998	GCAA	2	8	4842	4849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009998	ATGC	2	8	4863	4870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009998	GGAA	2	8	5136	5143	50 %	0 %	50 %	0 %	160872938
20	NC_009998	GAAA	2	8	5267	5274	75 %	0 %	25 %	0 %	160872938
21	NC_009998	AGCG	2	8	5476	5483	25 %	0 %	50 %	25 %	160872939
22	NC_009998	TAAC	2	8	5508	5515	50 %	25 %	0 %	25 %	160872939
23	NC_009998	TGGC	2	8	5574	5581	0 %	25 %	50 %	25 %	160872939
24	NC_009998	GCTT	2	8	6047	6054	0 %	50 %	25 %	25 %	160872939
25	NC_009998	TTGA	2	8	6983	6990	25 %	50 %	25 %	0 %	160872940
26	NC_009998	AAGT	2	8	8147	8154	50 %	25 %	25 %	0 %	160872941
27	NC_009998	AATG	2	8	8742	8749	50 %	25 %	25 %	0 %	160872941
28	NC_009998	ATCT	2	8	9345	9352	25 %	50 %	0 %	25 %	160872942
29	NC_009998	TTGT	2	8	9863	9870	0 %	75 %	25 %	0 %	160872942
30	NC_009998	GCTT	2	8	9932	9939	0 %	50 %	25 %	25 %	160872943
31	NC_009998	GCCC	2	8	11136	11143	0 %	0 %	25 %	75 %	160872945
32	NC_009998	TGAG	2	8	12014	12021	25 %	25 %	50 %	0 %	160872945
33	NC_009998	TGCC	2	8	12393	12400	0 %	25 %	25 %	50 %	160872945
34	NC_009998	GATT	2	8	12768	12775	25 %	50 %	25 %	0 %	160872945
35	NC_009998	ATAG	2	8	13159	13166	50 %	25 %	25 %	0 %	160872945
36	NC_009998	GACT	2	8	13642	13649	25 %	25 %	25 %	25 %	160872946
37	NC_009998	AATT	2	8	13990	13997	50 %	50 %	0 %	0 %	160872947
38	NC_009998	ATCA	2	8	15297	15304	50 %	25 %	0 %	25 %	160872947
39	NC_009998	TGTT	2	8	15557	15564	0 %	75 %	25 %	0 %	160872948
40	NC_009998	CAAT	2	8	16152	16159	50 %	25 %	0 %	25 %	160872948
41	NC_009998	CATC	2	8	17164	17171	25 %	25 %	0 %	50 %	160872950
42	NC_009998	TAAT	2	8	17659	17666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009998	TTTA	2	8	18007	18014	25 %	75 %	0 %	0 %	160872952
44	NC_009998	TTTA	2	8	18217	18224	25 %	75 %	0 %	0 %	160872952
45	NC_009998	CGAT	2	8	18779	18786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009998	TGCT	2	8	19359	19366	0 %	50 %	25 %	25 %	160872954
47	NC_009998	ATAA	2	8	19763	19770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009998	GTAT	2	8	19885	19892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009998	CTTA	2	8	19963	19970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009998	ATGG	2	8	21204	21211	25 %	25 %	50 %	0 %	160872956
51	NC_009998	GGTT	2	8	21408	21415	0 %	50 %	50 %	0 %	160872956
52	NC_009998	CCCT	2	8	21518	21525	0 %	25 %	0 %	75 %	160872956
53	NC_009998	GTCA	2	8	21808	21815	25 %	25 %	25 %	25 %	160872956
54	NC_009998	AGCA	2	8	21958	21965	50 %	0 %	25 %	25 %	160872956
55	NC_009998	AAAT	2	8	22029	22036	75 %	25 %	0 %	0 %	160872957
56	NC_009998	AAGT	2	8	22092	22099	50 %	25 %	25 %	0 %	160872957
57	NC_009998	TCAT	2	8	22751	22758	25 %	50 %	0 %	25 %	160872957
58	NC_009998	CTGC	2	8	23326	23333	0 %	25 %	25 %	50 %	160872958
59	NC_009998	TAAA	2	8	23574	23581	75 %	25 %	0 %	0 %	160872958
60	NC_009998	TCAG	2	8	24371	24378	25 %	25 %	25 %	25 %	160872959
61	NC_009998	TAAT	2	8	24519	24526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009998	CAAC	2	8	25080	25087	50 %	0 %	0 %	50 %	160872960
63	NC_009998	TAAA	2	8	25559	25566	75 %	25 %	0 %	0 %	160872960
64	NC_009998	AGCA	2	8	26744	26751	50 %	0 %	25 %	25 %	160872960
65	NC_009998	GGTT	2	8	27076	27083	0 %	50 %	50 %	0 %	160872960
66	NC_009998	CCAG	2	8	27252	27259	25 %	0 %	25 %	50 %	160872960
67	NC_009998	TAAT	2	8	27365	27372	50 %	50 %	0 %	0 %	160872960
68	NC_009998	TGGG	2	8	27881	27888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009998	AAAC	2	8	28307	28314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009998	TCGA	2	8	28548	28555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009998	TAGT	2	8	28556	28563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009998	GAAA	2	8	28764	28771	75 %	0 %	25 %	0 %	160872961
73	NC_009998	AGCT	2	8	29396	29403	25 %	25 %	25 %	25 %	160872961
74	NC_009998	AAGT	2	8	29634	29641	50 %	25 %	25 %	0 %	160872961
75	NC_009998	ATTA	2	8	30114	30121	50 %	50 %	0 %	0 %	160872961
76	NC_009998	TAAA	2	8	30230	30237	75 %	25 %	0 %	0 %	160872961
77	NC_009998	TGGT	2	8	31567	31574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009998	TCAA	2	8	31774	31781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009998	ATCT	2	8	31967	31974	25 %	50 %	0 %	25 %	160872964
80	NC_009998	GAGC	2	8	31983	31990	25 %	0 %	50 %	25 %	160872964
81	NC_009998	TAAT	2	8	32177	32184	50 %	50 %	0 %	0 %	160872965
82	NC_009998	TTTA	2	8	32872	32879	25 %	75 %	0 %	0 %	160872965
83	NC_009998	ATAG	2	8	32928	32935	50 %	25 %	25 %	0 %	160872965
84	NC_009998	ATTA	2	8	32975	32982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009998	CATA	2	8	33110	33117	50 %	25 %	0 %	25 %	160872966
86	NC_009998	TCAA	2	8	33571	33578	50 %	25 %	0 %	25 %	160872966
87	NC_009998	ATGC	2	8	33704	33711	25 %	25 %	25 %	25 %	160872966
88	NC_009998	GCTG	2	8	34016	34023	0 %	25 %	50 %	25 %	160872966
89	NC_009998	TGTT	2	8	34145	34152	0 %	75 %	25 %	0 %	160872966
90	NC_009998	TGTT	2	8	34387	34394	0 %	75 %	25 %	0 %	160872966
91	NC_009998	GTAA	2	8	34937	34944	50 %	25 %	25 %	0 %	160872966
92	NC_009998	ATAG	2	8	36043	36050	50 %	25 %	25 %	0 %	160872966
93	NC_009998	CAGC	2	8	36268	36275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009998	ATTG	2	8	36484	36491	25 %	50 %	25 %	0 %	160872967
95	NC_009998	GTCA	2	8	36703	36710	25 %	25 %	25 %	25 %	160872967
96	NC_009998	AAAG	2	8	36975	36982	75 %	0 %	25 %	0 %	160872967
97	NC_009998	AGTG	2	8	37227	37234	25 %	25 %	50 %	0 %	160872967
98	NC_009998	GTCA	2	8	37556	37563	25 %	25 %	25 %	25 %	160872968
99	NC_009998	GAGT	2	8	37939	37946	25 %	25 %	50 %	0 %	160872969
100	NC_009998	GCTC	2	8	38118	38125	0 %	25 %	25 %	50 %	160872969
101	NC_009998	CAAT	2	8	38469	38476	50 %	25 %	0 %	25 %	160872969
102	NC_009998	TGAT	2	8	38884	38891	25 %	50 %	25 %	0 %	160872970
103	NC_009998	GTTT	2	8	38903	38910	0 %	75 %	25 %	0 %	160872970
104	NC_009998	AAAG	2	8	39108	39115	75 %	0 %	25 %	0 %	160872970
105	NC_009998	AATT	2	8	39920	39927	50 %	50 %	0 %	0 %	160872970
106	NC_009998	ATGT	2	8	40282	40289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009998	GATA	2	8	40358	40365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009998	GATT	2	8	40408	40415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009998	CTTC	2	8	40595	40602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009998	ATCA	2	8	40893	40900	50 %	25 %	0 %	25 %	160872971
111	NC_009998	TCAG	2	8	40906	40913	25 %	25 %	25 %	25 %	160872971
112	NC_009998	AATA	2	8	41624	41631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009998	TTAA	2	8	42315	42322	50 %	50 %	0 %	0 %	160872972
114	NC_009998	ATTT	2	8	42536	42543	25 %	75 %	0 %	0 %	160872972
115	NC_009998	CATC	2	8	42585	42592	25 %	25 %	0 %	50 %	160872972
116	NC_009998	TTAT	2	8	43128	43135	25 %	75 %	0 %	0 %	160872973
117	NC_009998	ATGG	2	8	43445	43452	25 %	25 %	50 %	0 %	160872973
118	NC_009998	ACTT	2	8	43650	43657	25 %	50 %	0 %	25 %	160872973
119	NC_009998	TTTA	2	8	43939	43946	25 %	75 %	0 %	0 %	160872973
120	NC_009998	GAAA	2	8	44221	44228	75 %	0 %	25 %	0 %	160872973
121	NC_009998	AATG	2	8	44498	44505	50 %	25 %	25 %	0 %	160872974
122	NC_009998	TTAT	2	8	44889	44896	25 %	75 %	0 %	0 %	160872975
123	NC_009998	CGAT	2	8	45002	45009	25 %	25 %	25 %	25 %	160872975
124	NC_009998	AGAA	2	8	45186	45193	75 %	0 %	25 %	0 %	160872975
125	NC_009998	AACT	2	8	45947	45954	50 %	25 %	0 %	25 %	160872975
126	NC_009998	TAAA	2	8	46046	46053	75 %	25 %	0 %	0 %	160872975
127	NC_009998	AGCA	2	8	46251	46258	50 %	0 %	25 %	25 %	160872975
128	NC_009998	AATC	2	8	46351	46358	50 %	25 %	0 %	25 %	160872975
129	NC_009998	AGAT	2	8	46838	46845	50 %	25 %	25 %	0 %	160872975
130	NC_009998	GTTA	2	8	46911	46918	25 %	50 %	25 %	0 %	160872975
131	NC_009998	ATTT	2	8	47063	47070	25 %	75 %	0 %	0 %	160872975
132	NC_009998	AATA	2	8	47109	47116	75 %	25 %	0 %	0 %	160872975
133	NC_009998	AGTT	2	8	47207	47214	25 %	50 %	25 %	0 %	160872975
134	NC_009998	CAAA	2	8	47253	47260	75 %	0 %	0 %	25 %	160872975
135	NC_009998	TATT	2	8	47272	47279	25 %	75 %	0 %	0 %	160872975
136	NC_009998	TAAT	2	8	47567	47574	50 %	50 %	0 %	0 %	160872975
137	NC_009998	ATTT	2	8	47963	47970	25 %	75 %	0 %	0 %	160872975
138	NC_009998	ACGA	2	8	48281	48288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009998	TTGC	2	8	48408	48415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009998	TGCT	2	8	49053	49060	0 %	50 %	25 %	25 %	160872976
141	NC_009998	TCAA	2	8	49409	49416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009998	ATAA	2	8	50143	50150	75 %	25 %	0 %	0 %	160872977
143	NC_009998	ATAA	2	8	50530	50537	75 %	25 %	0 %	0 %	160872977
144	NC_009998	GTAG	2	8	50644	50651	25 %	25 %	50 %	0 %	160872977
145	NC_009998	ACTC	2	8	50949	50956	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009998	GCTG	2	8	51023	51030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009998	ACTG	2	8	52346	52353	25 %	25 %	25 %	25 %	160872979
148	NC_009998	CGAA	2	8	52442	52449	50 %	0 %	25 %	25 %	160872979
149	NC_009998	GCTT	2	8	52807	52814	0 %	50 %	25 %	25 %	160872979
150	NC_009998	TCAA	2	8	53947	53954	50 %	25 %	0 %	25 %	160872980
151	NC_009998	AGCT	2	8	55084	55091	25 %	25 %	25 %	25 %	160872983
152	NC_009998	AAAT	2	8	55837	55844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009998	CCTT	2	8	56348	56355	0 %	50 %	0 %	50 %	160872985
154	NC_009998	TTTG	2	8	56671	56678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009998	TCAT	2	8	56720	56727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_009998	GTTT	2	8	57340	57347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009998	CTCA	2	8	58229	58236	25 %	25 %	0 %	50 %	160872987
158	NC_009998	TCGG	2	8	58342	58349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_009998	GCAA	2	8	58391	58398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_009998	TGTC	2	8	58644	58651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_009998	GCAA	2	8	58740	58747	50 %	0 %	25 %	25 %	160872988
162	NC_009998	GCGG	2	8	59545	59552	0 %	0 %	75 %	25 %	160872988
163	NC_009998	AGTT	2	8	59687	59694	25 %	50 %	25 %	0 %	160872988
164	NC_009998	TCTG	2	8	60043	60050	0 %	50 %	25 %	25 %	160872988
165	NC_009998	AGCC	2	8	60180	60187	25 %	0 %	25 %	50 %	160872988
166	NC_009998	AGAA	2	8	60260	60267	75 %	0 %	25 %	0 %	160872988
167	NC_009998	TAAA	2	8	60654	60661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009998	TGAA	2	8	60915	60922	50 %	25 %	25 %	0 %	160872989
169	NC_009998	TGGC	2	8	60965	60972	0 %	25 %	50 %	25 %	160872989
170	NC_009998	CAAA	2	8	61003	61010	75 %	0 %	0 %	25 %	160872989
171	NC_009998	AGCA	2	8	61255	61262	50 %	0 %	25 %	25 %	160872990
172	NC_009998	TGAT	2	8	61498	61505	25 %	50 %	25 %	0 %	160872990
173	NC_009998	TTGA	2	8	61548	61555	25 %	50 %	25 %	0 %	160872990
174	NC_009998	TATT	2	8	61991	61998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009998	TCGG	2	8	62235	62242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_009998	GCAA	2	8	62284	62291	50 %	0 %	25 %	25 %	160872992
177	NC_009998	GCGA	2	8	62526	62533	25 %	0 %	50 %	25 %	160872992
178	NC_009998	AGCA	2	8	62576	62583	50 %	0 %	25 %	25 %	160872992
179	NC_009998	TTTC	2	8	62733	62740	0 %	75 %	0 %	25 %	160872992
180	NC_009998	CAAT	2	8	63519	63526	50 %	25 %	0 %	25 %	160872993
181	NC_009998	GAAT	2	8	63862	63869	50 %	25 %	25 %	0 %	160872994
182	NC_009998	TCGG	2	8	64629	64636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_009998	GCAA	2	8	64678	64685	50 %	0 %	25 %	25 %	160872996
184	NC_009998	GCGA	2	8	64920	64927	25 %	0 %	50 %	25 %	160872996
185	NC_009998	AGCA	2	8	64970	64977	50 %	0 %	25 %	25 %	160872996
186	NC_009998	TTAA	2	8	66214	66221	50 %	50 %	0 %	0 %	160872997
187	NC_009998	CAGA	2	8	66284	66291	50 %	0 %	25 %	25 %	160872997
188	NC_009998	GTAA	2	8	67911	67918	50 %	25 %	25 %	0 %	160873000
189	NC_009998	CTTG	2	8	68048	68055	0 %	50 %	25 %	25 %	160873000
190	NC_009998	GAGT	2	8	68073	68080	25 %	25 %	50 %	0 %	160873000
191	NC_009998	GTTC	2	8	68204	68211	0 %	50 %	25 %	25 %	160873000
192	NC_009998	TTAA	2	8	68275	68282	50 %	50 %	0 %	0 %	160873000
193	NC_009998	GTTA	2	8	68706	68713	25 %	50 %	25 %	0 %	160873000
194	NC_009998	TGAT	2	8	69436	69443	25 %	50 %	25 %	0 %	160873000
195	NC_009998	ATTG	2	8	69627	69634	25 %	50 %	25 %	0 %	160873000
196	NC_009998	TCAA	2	8	69730	69737	50 %	25 %	0 %	25 %	160873000
197	NC_009998	GTCT	2	8	70181	70188	0 %	50 %	25 %	25 %	160873000
198	NC_009998	TTTG	2	8	70880	70887	0 %	75 %	25 %	0 %	160873000
199	NC_009998	CTTG	2	8	71474	71481	0 %	50 %	25 %	25 %	160873000
200	NC_009998	CTTT	2	8	71864	71871	0 %	75 %	0 %	25 %	160873000
201	NC_009998	CAAA	2	8	72467	72474	75 %	0 %	0 %	25 %	160873000
202	NC_009998	GTGA	2	8	72667	72674	25 %	25 %	50 %	0 %	160873000
203	NC_009998	GCAA	2	8	72880	72887	50 %	0 %	25 %	25 %	160873000
204	NC_009998	GCGT	2	8	73933	73940	0 %	25 %	50 %	25 %	160873001
205	NC_009998	CATC	2	8	74305	74312	25 %	25 %	0 %	50 %	160873001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.