MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19501

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009998	GCAA	2	8	4842	4849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009998	ATGC	2	8	4863	4870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009998	TAAT	2	8	17659	17666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009998	CGAT	2	8	18779	18786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009998	ATAA	2	8	19763	19770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009998	GTAT	2	8	19885	19892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009998	CTTA	2	8	19963	19970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009998	TAAT	2	8	24519	24526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009998	TGGG	2	8	27881	27888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009998	AAAC	2	8	28307	28314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009998	TCGA	2	8	28548	28555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009998	TAGT	2	8	28556	28563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009998	TGGT	2	8	31567	31574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009998	TCAA	2	8	31774	31781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009998	ATTA	2	8	32975	32982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009998	CAGC	2	8	36268	36275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009998	ATGT	2	8	40282	40289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009998	GATA	2	8	40358	40365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009998	GATT	2	8	40408	40415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009998	CTTC	2	8	40595	40602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009998	AATA	2	8	41624	41631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009998	ACGA	2	8	48281	48288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009998	TTGC	2	8	48408	48415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009998	TCAA	2	8	49409	49416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009998	ACTC	2	8	50949	50956	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009998	GCTG	2	8	51023	51030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009998	AAAT	2	8	55837	55844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009998	TTTG	2	8	56671	56678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009998	TCAT	2	8	56720	56727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009998	GTTT	2	8	57340	57347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009998	TCGG	2	8	58342	58349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009998	GCAA	2	8	58391	58398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009998	TGTC	2	8	58644	58651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009998	TAAA	2	8	60654	60661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009998	TATT	2	8	61991	61998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009998	TCGG	2	8	62235	62242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009998	TCGG	2	8	64629	64636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.