MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19501

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009998	CT	3	6	1068	1073	0 %	50 %	0 %	50 %	160872936
2	NC_009998	TA	3	6	1491	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	160872936
3	NC_009998	GC	3	6	2010	2015	0 %	0 %	50 %	50 %	160872936
4	NC_009998	CG	3	6	2417	2422	0 %	0 %	50 %	50 %	160872936
5	NC_009998	CG	3	6	3988	3993	0 %	0 %	50 %	50 %	160872937
6	NC_009998	GA	3	6	5460	5465	50 %	0 %	50 %	0 %	160872939
7	NC_009998	CG	3	6	5731	5736	0 %	0 %	50 %	50 %	160872939
8	NC_009998	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	160872939
9	NC_009998	GC	3	6	6467	6472	0 %	0 %	50 %	50 %	160872940
10	NC_009998	GC	3	6	6492	6497	0 %	0 %	50 %	50 %	160872940
11	NC_009998	AC	3	6	6540	6545	50 %	0 %	0 %	50 %	160872940
12	NC_009998	TG	3	6	8624	8629	0 %	50 %	50 %	0 %	160872941
13	NC_009998	CG	3	6	9563	9568	0 %	0 %	50 %	50 %	160872942
14	NC_009998	CG	3	6	10005	10010	0 %	0 %	50 %	50 %	160872943
15	NC_009998	GT	3	6	10067	10072	0 %	50 %	50 %	0 %	160872943
16	NC_009998	CG	3	6	10221	10226	0 %	0 %	50 %	50 %	160872943
17	NC_009998	CG	3	6	10847	10852	0 %	0 %	50 %	50 %	160872944
18	NC_009998	GC	3	6	11093	11098	0 %	0 %	50 %	50 %	160872945
19	NC_009998	CA	3	6	11458	11463	50 %	0 %	0 %	50 %	160872945
20	NC_009998	GT	3	6	12810	12815	0 %	50 %	50 %	0 %	160872945
21	NC_009998	AC	3	6	13794	13799	50 %	0 %	0 %	50 %	160872946
22	NC_009998	CG	3	6	16093	16098	0 %	0 %	50 %	50 %	160872948
23	NC_009998	GC	3	6	16294	16299	0 %	0 %	50 %	50 %	160872948
24	NC_009998	GC	3	6	16431	16436	0 %	0 %	50 %	50 %	160872949
25	NC_009998	GT	3	6	16845	16850	0 %	50 %	50 %	0 %	160872949
26	NC_009998	CA	3	6	17483	17488	50 %	0 %	0 %	50 %	160872951
27	NC_009998	TA	3	6	17636	17641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009998	GT	3	6	18666	18671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009998	GC	3	6	19169	19174	0 %	0 %	50 %	50 %	160872954
30	NC_009998	TC	4	8	19816	19823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009998	CT	3	6	20362	20367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009998	CT	3	6	21455	21460	0 %	50 %	0 %	50 %	160872956
33	NC_009998	GA	3	6	22342	22347	50 %	0 %	50 %	0 %	160872957
34	NC_009998	AT	3	6	22422	22427	50 %	50 %	0 %	0 %	160872957
35	NC_009998	CA	3	6	22686	22691	50 %	0 %	0 %	50 %	160872957
36	NC_009998	AT	3	6	23174	23179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009998	AC	3	6	24264	24269	50 %	0 %	0 %	50 %	160872959
38	NC_009998	GA	3	6	25891	25896	50 %	0 %	50 %	0 %	160872960
39	NC_009998	TA	4	8	26367	26374	50 %	50 %	0 %	0 %	160872960
40	NC_009998	AT	4	8	26401	26408	50 %	50 %	0 %	0 %	160872960
41	NC_009998	CT	3	6	26755	26760	0 %	50 %	0 %	50 %	160872960
42	NC_009998	AC	3	6	27346	27351	50 %	0 %	0 %	50 %	160872960
43	NC_009998	AG	4	8	27522	27529	50 %	0 %	50 %	0 %	160872960
44	NC_009998	AG	3	6	27552	27557	50 %	0 %	50 %	0 %	160872960
45	NC_009998	AT	3	6	28177	28182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009998	AG	4	8	29115	29122	50 %	0 %	50 %	0 %	160872961
47	NC_009998	AT	3	6	29202	29207	50 %	50 %	0 %	0 %	160872961
48	NC_009998	AC	3	6	30182	30187	50 %	0 %	0 %	50 %	160872961
49	NC_009998	TA	3	6	30663	30668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009998	AC	3	6	30974	30979	50 %	0 %	0 %	50 %	160872963
51	NC_009998	GA	3	6	31221	31226	50 %	0 %	50 %	0 %	160872963
52	NC_009998	CA	3	6	31313	31318	50 %	0 %	0 %	50 %	160872963
53	NC_009998	CG	3	6	31832	31837	0 %	0 %	50 %	50 %	160872964
54	NC_009998	TC	4	8	32567	32574	0 %	50 %	0 %	50 %	160872965
55	NC_009998	GT	3	6	35012	35017	0 %	50 %	50 %	0 %	160872966
56	NC_009998	CA	3	6	36467	36472	50 %	0 %	0 %	50 %	160872967
57	NC_009998	CA	3	6	36560	36565	50 %	0 %	0 %	50 %	160872967
58	NC_009998	AG	3	6	36624	36629	50 %	0 %	50 %	0 %	160872967
59	NC_009998	AT	3	6	38007	38012	50 %	50 %	0 %	0 %	160872969
60	NC_009998	AG	4	8	40056	40063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009998	TA	3	6	40351	40356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009998	GC	3	6	41245	41250	0 %	0 %	50 %	50 %	160872971
63	NC_009998	AT	3	6	41335	41340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009998	AT	3	6	41887	41892	50 %	50 %	0 %	0 %	160872972
65	NC_009998	TC	4	8	42365	42372	0 %	50 %	0 %	50 %	160872972
66	NC_009998	AG	3	6	43060	43065	50 %	0 %	50 %	0 %	160872973
67	NC_009998	AG	3	6	43670	43675	50 %	0 %	50 %	0 %	160872973
68	NC_009998	TA	3	6	43895	43900	50 %	50 %	0 %	0 %	160872973
69	NC_009998	AT	3	6	43924	43929	50 %	50 %	0 %	0 %	160872973
70	NC_009998	AT	3	6	44088	44093	50 %	50 %	0 %	0 %	160872973
71	NC_009998	AT	4	8	44368	44375	50 %	50 %	0 %	0 %	160872974
72	NC_009998	CT	3	6	45375	45380	0 %	50 %	0 %	50 %	160872975
73	NC_009998	AT	3	6	45660	45665	50 %	50 %	0 %	0 %	160872975
74	NC_009998	GA	3	6	46647	46652	50 %	0 %	50 %	0 %	160872975
75	NC_009998	AT	3	6	47186	47191	50 %	50 %	0 %	0 %	160872975
76	NC_009998	AT	3	6	47415	47420	50 %	50 %	0 %	0 %	160872975
77	NC_009998	AT	4	8	48461	48468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009998	TA	3	6	51516	51521	50 %	50 %	0 %	0 %	160872978
79	NC_009998	TG	3	6	52181	52186	0 %	50 %	50 %	0 %	160872979
80	NC_009998	TG	3	6	52735	52740	0 %	50 %	50 %	0 %	160872979
81	NC_009998	TA	3	6	53088	53093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009998	TA	3	6	53122	53127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009998	TA	3	6	53156	53161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009998	GT	3	6	53380	53385	0 %	50 %	50 %	0 %	160872980
85	NC_009998	AT	3	6	55020	55025	50 %	50 %	0 %	0 %	160872983
86	NC_009998	TG	3	6	57163	57168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009998	TC	3	6	57517	57522	0 %	50 %	0 %	50 %	160872986
88	NC_009998	GC	4	8	57552	57559	0 %	0 %	50 %	50 %	160872986
89	NC_009998	GC	3	6	58635	58640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009998	CG	3	6	59658	59663	0 %	0 %	50 %	50 %	160872988
91	NC_009998	TG	3	6	60668	60673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009998	GT	3	6	60679	60684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009998	GC	3	6	62500	62505	0 %	0 %	50 %	50 %	160872992
94	NC_009998	AC	3	6	62590	62595	50 %	0 %	0 %	50 %	160872992
95	NC_009998	AG	3	6	63553	63558	50 %	0 %	50 %	0 %	160872993
96	NC_009998	TA	4	8	63742	63749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009998	GA	3	6	64018	64023	50 %	0 %	50 %	0 %	160872994
98	NC_009998	GC	3	6	64894	64899	0 %	0 %	50 %	50 %	160872996
99	NC_009998	AC	3	6	64984	64989	50 %	0 %	0 %	50 %	160872996
100	NC_009998	GT	3	6	65188	65193	0 %	50 %	50 %	0 %	160872996
101	NC_009998	TA	3	6	66074	66079	50 %	50 %	0 %	0 %	160872997
102	NC_009998	CG	3	6	66987	66992	0 %	0 %	50 %	50 %	160872999
103	NC_009998	AC	3	6	67101	67106	50 %	0 %	0 %	50 %	160872999
104	NC_009998	TA	3	6	67256	67261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009998	CG	4	8	68115	68122	0 %	0 %	50 %	50 %	160873000
106	NC_009998	CG	3	6	68694	68699	0 %	0 %	50 %	50 %	160873000
107	NC_009998	TG	3	6	68838	68843	0 %	50 %	50 %	0 %	160873000
108	NC_009998	GC	5	10	69712	69721	0 %	0 %	50 %	50 %	160873000
109	NC_009998	GT	3	6	69906	69911	0 %	50 %	50 %	0 %	160873000
110	NC_009998	TG	3	6	69952	69957	0 %	50 %	50 %	0 %	160873000
111	NC_009998	GC	3	6	70268	70273	0 %	0 %	50 %	50 %	160873000
112	NC_009998	AT	3	6	70643	70648	50 %	50 %	0 %	0 %	160873000
113	NC_009998	GT	3	6	71302	71307	0 %	50 %	50 %	0 %	160873000
114	NC_009998	CT	3	6	71953	71958	0 %	50 %	0 %	50 %	160873000
115	NC_009998	CG	3	6	72092	72097	0 %	0 %	50 %	50 %	160873000
116	NC_009998	GC	4	8	72626	72633	0 %	0 %	50 %	50 %	160873000
117	NC_009998	CG	3	6	73251	73256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009998	GC	3	6	74800	74805	0 %	0 %	50 %	50 %	160873001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.