MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 chromosome

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009997	TAGCCT	2	12	3005	3016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009997	AATATT	2	12	21932	21943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009997	AGATTA	2	12	25775	25786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009997	TGAAGG	2	12	47949	47960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009997	AAACGC	2	12	49848	49859	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009997	TAACAC	2	12	68018	68029	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009997	CTCAAG	2	12	76048	76059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009997	GCAATT	2	12	103477	103488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009997	CGATCT	2	12	124719	124730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009997	CCATTA	2	12	154141	154152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009997	GACTTT	2	12	169320	169331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009997	GACTGG	2	12	189338	189349	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009997	TGAAGG	2	12	225105	225116	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009997	AAACGC	2	12	226999	227010	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009997	CTTTAA	2	12	259954	259965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009997	TGAAGG	2	12	276456	276467	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009997	AAACGC	2	12	278354	278365	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009997	AAAGAT	2	12	278694	278705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009997	ATAACT	2	12	303971	303982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009997	AATGAA	2	12	304703	304714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009997	CTAACT	2	12	307434	307445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009997	GCTCAA	2	12	348278	348289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009997	AGCTAA	2	12	371830	371841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009997	TCAAAG	2	12	371850	371861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009997	CAAAAT	2	12	427165	427176	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009997	AGGAAA	2	12	473148	473159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009997	TGAAGG	2	12	485915	485926	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009997	AAACGC	2	12	487814	487825	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009997	AAACGC	2	12	488081	488092	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009997	GAAATC	2	12	540318	540329	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009997	CTCGTT	2	12	544665	544676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009997	TTATTT	2	12	610242	610253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009997	TTGAGC	2	12	619278	619289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009997	GATATA	2	12	624133	624144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009997	AGCGTA	2	12	627395	627406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009997	GCTTTA	2	12	629300	629311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009997	AAAGTC	2	12	630337	630348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009997	AGCGAT	2	12	638775	638786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009997	ATTAGC	2	12	691745	691756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009997	TTTAAA	2	12	699728	699739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009997	TAGATA	2	12	703165	703176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009997	ATAAAA	2	12	730904	730915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009997	TTTTAT	2	12	745225	745236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009997	TCTGTT	5	30	752239	752268	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009997	TTTGTT	2	12	755182	755193	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009997	TTTGTT	2	12	784844	784855	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009997	GTCTAA	2	12	807782	807793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009997	GCAGTA	2	12	845538	845549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009997	TAAGTG	2	12	846422	846433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009997	TCCCTA	2	12	849420	849431	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009997	AGCTCA	2	12	884688	884699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009997	TACATC	2	12	903757	903768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009997	TTGAAA	2	12	909844	909855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009997	AAAATA	2	12	910354	910365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009997	AGATGA	2	12	910610	910621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009997	GTTGAA	2	12	915647	915658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009997	AAAAAC	2	12	979137	979148	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009997	GCAAGC	2	12	979187	979198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009997	AGGATT	2	12	981058	981069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009997	TGAAGG	2	12	1001690	1001701	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009997	AAACGC	2	12	1003588	1003599	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009997	CTTTAT	2	12	1006440	1006451	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009997	TCAATC	2	12	1024372	1024383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009997	TCTAAG	2	12	1063648	1063659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009997	ATTTTA	2	12	1100878	1100889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009997	TAGGGT	2	12	1132851	1132862	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009997	TTTTGA	2	12	1140064	1140075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009997	AAATGT	2	12	1186183	1186194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009997	TTTATC	2	12	1208910	1208921	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009997	GAATCC	2	12	1220338	1220349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009997	AGCTTC	2	12	1232184	1232195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009997	AATGAT	2	12	1248130	1248141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009997	AATCCC	2	12	1304255	1304266	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009997	AGCACC	2	12	1317975	1317986	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009997	AGCACC	2	12	1318148	1318159	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009997	ATTTAT	2	12	1321164	1321175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009997	TGAAGG	2	12	1329494	1329505	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009997	AAACGC	2	12	1331444	1331455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009997	AATAAA	2	12	1354940	1354951	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009997	TTTATT	2	12	1365840	1365851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009997	ATGAAT	2	12	1390498	1390509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009997	TTTTTA	2	12	1409960	1409971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009997	TTTTTG	2	12	1464655	1464666	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009997	TTTAGT	2	12	1484783	1484794	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009997	AGGGCT	2	12	1537518	1537529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009997	ACTAAC	2	12	1537871	1537882	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009997	CTTCAT	2	12	1549184	1549195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009997	GACTAA	2	12	1573189	1573200	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009997	TATATT	2	12	1585065	1585076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009997	TCATTA	2	12	1598118	1598129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009997	ATTGTG	2	12	1601737	1601748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009997	AAGCTT	2	12	1666175	1666186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009997	AGCATT	2	12	1692922	1692933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009997	GTTTTT	2	12	1708636	1708647	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009997	ATGCCC	2	12	1768882	1768893	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009997	TTTATA	2	12	1769941	1769952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009997	ATGGCA	2	12	1770206	1770217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009997	CTGGCT	2	12	1798518	1798529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009997	TTTACG	2	12	1826387	1826398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009997	CATAAA	2	12	1872581	1872592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009997	TCAAAG	4	24	1875452	1875475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009997	TAGTGA	2	12	1902491	1902502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009997	TTTTAT	2	12	1925084	1925095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009997	AAGATA	2	12	1925585	1925596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009997	CAAAGT	2	12	1929446	1929457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009997	TTTCTA	2	12	1945978	1945989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009997	GTTAAG	2	12	2038326	2038337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009997	GCTAAA	2	12	2057873	2057884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009997	GCAAAG	2	12	2079745	2079756	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009997	ATTTTC	2	12	2079851	2079862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009997	GTTTTT	2	12	2082376	2082387	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009997	TCTTGG	2	12	2084477	2084488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009997	GAGATA	2	12	2084510	2084521	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009997	TGTTTT	2	12	2108640	2108651	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009997	TTTTTA	2	12	2115572	2115583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009997	AATAAG	2	12	2121900	2121911	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009997	TATTGA	2	12	2129141	2129152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009997	TTCAAC	3	18	2133517	2133534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009997	TTGCAA	2	12	2154451	2154462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009997	GTTTTC	2	12	2165966	2165977	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009997	AGTATA	2	12	2190796	2190807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009997	ATTAAA	2	12	2191389	2191400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009997	ATATGA	2	12	2226037	2226048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009997	GATATT	2	12	2251613	2251624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009997	CATAAA	2	12	2257928	2257939	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009997	GGCAAT	2	12	2350512	2350523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009997	ATACCT	2	12	2353728	2353739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009997	CCCAAT	2	12	2372643	2372654	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009997	CTAGGC	2	12	2373715	2373726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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247	NC_009997	GACGAA	2	12	4596792	4596803	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_009997	AATAAC	2	12	4604125	4604136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_009997	AAGTCA	2	12	4608748	4608759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_009997	TTGTTA	2	12	4657391	4657402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_009997	AGACTG	2	12	4662504	4662515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_009997	TTAGAT	2	12	4695173	4695184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_009997	GCGTTT	2	12	4761479	4761490	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_009997	CCTTCA	2	12	4763378	4763389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
255	NC_009997	CACCAT	2	12	4791488	4791499	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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270	NC_009997	CCTTCA	2	12	5316692	5316703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
271	NC_009997	TTTTAA	2	12	5323490	5323501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.