MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 chromosome

Total Repeats: 710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009997	TGAAT	2	10	11070	11079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009997	TGATG	2	10	16061	16070	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009997	CTGGG	2	10	38014	38023	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009997	GGTCA	2	10	44334	44343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009997	AGTCG	2	10	47846	47855	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009997	AGGCT	2	10	48173	48182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009997	ATCCC	2	10	49825	49834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_009997	TCCGC	2	10	50011	50020	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_009997	CCGTC	2	10	50096	50105	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_009997	GATAG	2	10	56704	56713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009997	GGATG	2	10	59937	59946	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009997	CTTTA	2	10	67810	67819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009997	ATAGC	2	10	82895	82904	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009997	CTGTC	2	10	103456	103465	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009997	TGGGT	2	10	111458	111467	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009997	AATTT	2	10	114570	114579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009997	ATCCA	2	10	116684	116693	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009997	TTATT	2	10	118528	118537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009997	AGTGA	2	10	137898	137907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009997	AGGTT	2	10	139062	139071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009997	TTCAA	2	10	149606	149615	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009997	CGCGA	2	10	154108	154117	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009997	CACTC	2	10	163089	163098	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009997	ATCTA	2	10	163222	163231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009997	TGTGA	2	10	163324	163333	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009997	TCACT	2	10	164279	164288	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009997	ATTGG	2	10	174996	175005	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009997	ATTTG	2	10	178505	178514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009997	ATTTT	2	10	178545	178554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009997	TTTGT	2	10	197070	197079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009997	CTTAT	2	10	209200	209209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009997	TAAAC	2	10	223370	223379	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009997	AGTCG	2	10	225002	225011	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009997	AGGCT	2	10	225329	225338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009997	ATCCC	2	10	226976	226985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_009997	AGTCG	2	10	276353	276362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009997	AGGCT	2	10	276680	276689	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009997	ATCCC	2	10	278331	278340	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_009997	TCCGC	2	10	278517	278526	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009997	CCGTC	2	10	278602	278611	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_009997	TAATT	2	10	279785	279794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009997	TTATT	2	10	304797	304806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009997	TTGGC	2	10	312228	312237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009997	TGGCT	2	10	312373	312382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009997	CTTAT	2	10	319097	319106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009997	ATAAG	2	10	327197	327206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009997	TTTGT	2	10	328516	328525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009997	TTTAA	2	10	348493	348502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009997	GTATT	2	10	348831	348840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009997	TAAGC	2	10	368517	368526	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009997	GCTTT	2	10	412912	412921	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009997	TTTTA	2	10	427429	427438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009997	TTCAA	2	10	433743	433752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009997	GAAGT	2	10	433802	433811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009997	TATTG	2	10	456014	456023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009997	GATAG	2	10	457842	457851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009997	ATCCC	2	10	460459	460468	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_009997	GTTAT	2	10	476553	476562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009997	TAGAA	2	10	481770	481779	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009997	AAAGC	2	10	481886	481895	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009997	TAAAC	2	10	484180	484189	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009997	AGTCG	2	10	485812	485821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009997	AGGCT	2	10	486139	486148	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009997	ATCCC	2	10	487791	487800	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_009997	ATCCC	2	10	488058	488067	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_009997	GAAAA	2	10	499239	499248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009997	ATTCG	2	10	499971	499980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009997	TCGGA	2	10	505580	505589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009997	CTAGG	2	10	505649	505658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009997	GTAAC	2	10	508889	508898	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009997	CCGCA	2	10	512618	512627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_009997	ACGAT	2	10	522955	522964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009997	AGGAT	2	10	531069	531078	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009997	CCGCA	2	10	539242	539251	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009997	ATTTA	2	10	556303	556312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009997	AGAGG	2	10	563394	563403	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009997	ATGTG	2	10	563936	563945	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009997	ACTTA	2	10	585226	585235	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009997	AAATA	2	10	596742	596751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009997	TTCAA	2	10	615156	615165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009997	TGATT	2	10	620488	620497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009997	GTTAA	2	10	627409	627418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009997	TAAGT	2	10	633240	633249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009997	ATTTT	2	10	635392	635401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009997	GATCA	2	10	638222	638231	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009997	AATCA	2	10	642265	642274	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009997	GAGGG	2	10	659754	659763	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009997	CTTTG	2	10	661298	661307	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009997	TTCTT	2	10	687356	687365	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009997	TTAAA	2	10	692843	692852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009997	GTGCT	2	10	694245	694254	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009997	TAATT	2	10	694340	694349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009997	ATATT	3	15	695974	695988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009997	ATTTT	2	10	696003	696012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009997	TATTT	2	10	703119	703128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009997	GTCGA	2	10	725641	725650	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009997	ATAAA	2	10	727589	727598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009997	AATAT	2	10	730959	730968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009997	TGAAG	2	10	731107	731116	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009997	GGAAC	2	10	735044	735053	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009997	GAAGT	2	10	735193	735202	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009997	ATTGT	2	10	735647	735656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009997	ACTTT	2	10	735658	735667	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009997	ATTCA	2	10	736700	736709	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009997	TTTAT	2	10	742253	742262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009997	GATCA	2	10	744703	744712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009997	ATATT	2	10	745172	745181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009997	TAAAC	2	10	748966	748975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009997	ATATA	2	10	751946	751955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009997	CTAAT	2	10	752099	752108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009997	CCTAT	2	10	753397	753406	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009997	TTTGT	2	10	775875	775884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009997	ATAGA	2	10	781701	781710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009997	ACTGA	2	10	784898	784907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009997	TTATT	2	10	803211	803220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009997	GTTTT	2	10	820764	820773	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009997	CATTG	3	15	825989	826003	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009997	TATGT	2	10	829083	829092	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009997	GATTT	2	10	837220	837229	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009997	AATTT	2	10	854950	854959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009997	TTCGT	2	10	860778	860787	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009997	TTTTA	2	10	861557	861566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009997	ATCAC	2	10	862735	862744	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009997	ATGAA	2	10	865470	865479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009997	GTGCT	2	10	896825	896834	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009997	CCATT	2	10	899427	899436	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009997	TTTAA	2	10	903078	903087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009997	GAAAA	2	10	904050	904059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009997	GTTTT	2	10	929392	929401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009997	ATTTT	2	10	953367	953376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009997	AAATC	2	10	983176	983185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009997	TTAGA	2	10	998037	998046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009997	AGTCG	2	10	1001587	1001596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009997	AGGCT	2	10	1001914	1001923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009997	ATCCC	2	10	1003565	1003574	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_009997	CCGTC	2	10	1004902	1004911	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_009997	TCCAT	2	10	1006285	1006294	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_009997	TAACT	2	10	1010746	1010755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009997	TTTTC	2	10	1012059	1012068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009997	TAGGA	2	10	1012244	1012253	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009997	GCTTT	2	10	1012294	1012303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009997	TGTTA	2	10	1019483	1019492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009997	GAATC	2	10	1024478	1024487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009997	AGAGG	2	10	1024658	1024667	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009997	CATGA	2	10	1031808	1031817	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009997	ACGTT	2	10	1049427	1049436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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