MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	TAACTG	2	12	2024	2035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904398
2	NC_009975	TGCAGT	2	12	3242	3253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159904399
3	NC_009975	GGAATT	2	12	3285	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
4	NC_009975	GAAAAA	2	12	10343	10354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904407
5	NC_009975	CAATTG	2	12	11417	11428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904409
6	NC_009975	TTTATT	2	12	12929	12940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	159904411
7	NC_009975	TTATTT	2	12	20687	20698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	159904418
8	NC_009975	AAAGTA	2	12	21511	21522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904419
9	NC_009975	TTGAAA	2	12	25985	25996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904425
10	NC_009975	AAAATG	2	12	27049	27060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904426
11	NC_009975	ACTTTC	2	12	29859	29870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904431
12	NC_009975	GAAAAA	2	12	33095	33106	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904434
13	NC_009975	TTAAAA	2	12	38318	38329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904436
14	NC_009975	TCAATT	2	12	38990	39001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904437
15	NC_009975	CATTTC	2	12	40096	40107	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904439
16	NC_009975	GCTTTA	2	12	40179	40190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	159904439
17	NC_009975	AGAATA	2	12	43403	43414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904444
18	NC_009975	TGAAAT	2	12	44854	44865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904447
19	NC_009975	GATATT	2	12	44952	44963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904447
20	NC_009975	AAGATT	2	12	47111	47122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904451
21	NC_009975	CTACTG	2	12	58425	58436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159904468
22	NC_009975	ATCTGA	2	12	59281	59292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904468
23	NC_009975	TTTCAT	2	12	61242	61253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	159904471
24	NC_009975	CTGCAA	2	12	64493	64504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159904473
25	NC_009975	TAATCT	2	12	68411	68422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904475
26	NC_009975	TCAATA	2	12	72218	72229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904483
27	NC_009975	GAAAAA	2	12	79006	79017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904491
28	NC_009975	TCAAAA	2	12	79859	79870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	159904493
29	NC_009975	ATCTCC	2	12	90039	90050	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159904506
30	NC_009975	TCACAC	2	12	90280	90291	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	159904506
31	NC_009975	ATTAAT	2	12	96458	96469	50 %	50 %	0 %	0 %	159904512
32	NC_009975	TTCTTT	2	12	99095	99106	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	159904517
33	NC_009975	ATTTCC	2	12	99166	99177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904517
34	NC_009975	TTCAGA	2	12	99652	99663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904518
35	NC_009975	AATGTC	2	12	99781	99792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904518
36	NC_009975	GTTGAA	2	12	104331	104342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904526
37	NC_009975	TTGACA	2	12	105772	105783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904526
38	NC_009975	ACAATA	2	12	108595	108606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	159904530
39	NC_009975	ATGGAT	2	12	109134	109145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904530
40	NC_009975	CATTTA	2	12	115594	115605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904534
41	NC_009975	ATGTAA	2	12	116496	116507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904534
42	NC_009975	ATGTAA	2	12	116847	116858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904534
43	NC_009975	ATGTAA	2	12	117198	117209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904534
44	NC_009975	AAGTTC	2	12	118807	118818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904534
45	NC_009975	AAGTTC	2	12	118975	118986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904534
46	NC_009975	TTTGAA	2	12	122466	122477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904538
47	NC_009975	ATCGTC	2	12	122750	122761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159904538
48	NC_009975	TTCCAA	2	12	123130	123141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904538
49	NC_009975	AATTAA	2	12	124664	124675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904539
50	NC_009975	AAAATA	2	12	124826	124837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	159904539
51	NC_009975	AAATTA	2	12	128564	128575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904544
52	NC_009975	AAATTG	2	12	132331	132342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904547
53	NC_009975	ATGAAA	2	12	132571	132582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904547
54	NC_009975	GTTGCA	2	12	133214	133225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159904549
55	NC_009975	TGCAAT	2	12	133702	133713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904550
56	NC_009975	TTTCAA	2	12	134757	134768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904550
57	NC_009975	CAATAT	2	12	140438	140449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904553
58	NC_009975	ATTTCC	2	12	141247	141258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904555
59	NC_009975	ATTTGA	2	12	141282	141293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904555
60	NC_009975	TCAATT	2	12	142130	142141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904556
61	NC_009975	ATGCAT	2	12	146078	146089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904561
62	NC_009975	GTATTT	2	12	151975	151986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	159904566
63	NC_009975	ATGCAA	2	12	153558	153569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159904567
64	NC_009975	CAAACC	2	12	154285	154296	50 %	0 %	0 %	50 %	159904567
65	NC_009975	TAGGAT	2	12	158494	158505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904571
66	NC_009975	AATTGA	2	12	159960	159971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904572
67	NC_009975	ATTGCA	2	12	165795	165806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904578
68	NC_009975	TTTTGA	2	12	167651	167662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	159904580
69	NC_009975	CATTTC	2	12	167887	167898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904580
70	NC_009975	GAAAAG	2	12	173350	173361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904583
71	NC_009975	TACGCA	2	12	175350	175361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159904584
72	NC_009975	ATGAAA	2	12	176384	176395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904586
73	NC_009975	GTGCAA	2	12	177964	177975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159904587
74	NC_009975	AAAGTT	2	12	179767	179778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904588
75	NC_009975	AGCATT	2	12	180741	180752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904590
76	NC_009975	TTTTGG	2	12	185500	185511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904594
77	NC_009975	ATGGAA	2	12	186584	186595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	159904596
78	NC_009975	CAAAAG	2	12	187035	187046	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	159904596
79	NC_009975	AACTGT	2	12	188446	188457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904598
80	NC_009975	AAGGAA	2	12	188904	188915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904598
81	NC_009975	CAAAAC	2	12	190149	190160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904599
82	NC_009975	ATATAC	2	12	193923	193934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904603
83	NC_009975	AGAAAT	2	12	195143	195154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904604
84	NC_009975	TTGCCA	2	12	196042	196053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159904605
85	NC_009975	ATAAAA	2	12	197018	197029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	159904605
86	NC_009975	TAAATG	2	12	209750	209761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904619
87	NC_009975	GTTTCT	2	12	213468	213479	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	159904624
88	NC_009975	TTTAAA	2	12	214705	214716	50 %	50 %	0 %	0 %	159904625
89	NC_009975	ATCTAT	2	12	219615	219626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904630
90	NC_009975	CAAGTG	2	12	219767	219778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159904630
91	NC_009975	CAAATC	2	12	221328	221339	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	159904631
92	NC_009975	GCAATT	2	12	226664	226675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904637
93	NC_009975	TCCAAT	2	12	229836	229847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904642
94	NC_009975	GAATCA	2	12	232294	232305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159904644
95	NC_009975	TTGCAA	2	12	233747	233758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904645
96	NC_009975	GTCTTT	2	12	235616	235627	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	159904647
97	NC_009975	GCAATT	2	12	235749	235760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904647
98	NC_009975	CTGAAT	2	12	236612	236623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904648
99	NC_009975	ATTGAA	2	12	239272	239283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904651
100	NC_009975	GAAAAC	2	12	243003	243014	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	159904656
101	NC_009975	GTGCAA	2	12	244534	244545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159904659
102	NC_009975	TCAAAT	2	12	253588	253599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904669
103	NC_009975	ACATCG	2	12	256168	256179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159904673
104	NC_009975	AAAGAA	2	12	260262	260273	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904676
105	NC_009975	ACGAAA	2	12	264331	264342	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	159904681
106	NC_009975	GATGAA	2	12	264766	264777	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	159904682
107	NC_009975	TATTGA	2	12	265068	265079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904682
108	NC_009975	ATACAT	2	12	265889	265900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904683
109	NC_009975	ATCAGA	2	12	267529	267540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159904685
110	NC_009975	CTATCC	2	12	269177	269188	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159904687
111	NC_009975	GGCCTT	2	12	269222	269233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904687
112	NC_009975	TAAATT	2	12	274407	274418	50 %	50 %	0 %	0 %	159904693
113	NC_009975	CAAAAA	2	12	279063	279074	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	159904698
114	NC_009975	AATTTA	2	12	279428	279439	50 %	50 %	0 %	0 %	159904698
115	NC_009975	ATTGAA	2	12	282288	282299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904700
116	NC_009975	TGATTA	2	12	283554	283565	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904702
117	NC_009975	TCATTT	2	12	284973	284984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	159904703
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459	NC_009975	GCAATC	2	12	1033908	1033919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159905479
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