MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	GGTCGT	2	12	128	139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901743
2	NC_009974	GCCAAG	2	12	720	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901743
3	NC_009974	TGGGGG	2	12	4339	4350	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	159901746
4	NC_009974	TCGCTC	2	12	11520	11531	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009974	GCCACC	2	12	12567	12578	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159901754
6	NC_009974	CGCACC	2	12	13038	13049	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159901754
7	NC_009974	TCGCCG	2	12	13422	13433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159901754
8	NC_009974	CCATGC	2	12	13606	13617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159901754
9	NC_009974	GCCGTG	2	12	14344	14355	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159901755
10	NC_009974	GGGGTC	2	12	15232	15243	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159901755
11	NC_009974	GTGCCT	2	12	16455	16466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901756
12	NC_009974	GGCCAT	2	12	16540	16551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159901756
13	NC_009974	GCGGCT	2	12	16811	16822	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159901756
14	NC_009974	ACTGGG	2	12	20650	20661	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159901760
15	NC_009974	TGCGCC	2	12	21349	21360	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159901760
16	NC_009974	TCACCT	2	12	22187	22198	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159901761
17	NC_009974	ACATGG	2	12	30100	30111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159901767
18	NC_009974	GGAACA	2	12	38181	38192	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	159901774
19	NC_009974	CGGTGG	2	12	39293	39304	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159901774
20	NC_009974	CAGCGC	2	12	42013	42024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159901776
21	NC_009974	AGCGGC	2	12	42141	42152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159901776
22	NC_009974	GGCTGG	2	12	43953	43964	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159901777
23	NC_009974	GCCACC	2	12	51015	51026	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009974	AGACCG	2	12	51339	51350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901779
25	NC_009974	GCGCTC	2	12	52181	52192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009974	ATCGTG	2	12	56539	56550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159901781
27	NC_009974	GATGAA	2	12	57685	57696	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009974	GAAAGC	2	12	59845	59856	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	159901784
29	NC_009974	CGCCCA	2	12	61714	61725	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159901785
30	NC_009974	TTGACC	2	12	62975	62986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159901786
31	NC_009974	AGCCGT	2	12	66908	66919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159901788
32	NC_009974	TCATTC	2	12	67409	67420	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159901788
33	NC_009974	TCGCGC	2	12	71157	71168	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159901791
34	NC_009974	CCTTGA	2	12	71823	71834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159901792
35	NC_009974	GCGAGG	2	12	77276	77287	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	159901797
36	NC_009974	ATGGCG	2	12	80906	80917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009974	ACACCA	2	12	86042	86053	50 %	0 %	0 %	50 %	159901803
38	NC_009974	CGGCTT	2	12	86948	86959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901804
39	NC_009974	GTGCTG	2	12	86968	86979	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901804
40	NC_009974	ATCGTG	2	12	87126	87137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159901804
41	NC_009974	AGCACC	2	12	91046	91057	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009974	ATTTCT	2	12	95111	95122	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	159901810
43	NC_009974	CACGCC	2	12	97724	97735	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159901811

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.