MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	ATCA	2	8	3636	3643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009974	ATCA	2	8	4959	4966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009974	TCAC	2	8	5585	5592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009974	CGTC	2	8	5593	5600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009974	CCAA	2	8	9144	9151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009974	TCAG	2	8	9243	9250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009974	ATCC	2	8	22289	22296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009974	GCAG	2	8	24301	24308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009974	AACG	2	8	24502	24509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009974	TTCT	2	8	26297	26304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009974	GCAA	2	8	26461	26468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009974	ATTG	2	8	26640	26647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009974	CTAT	2	8	27766	27773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009974	CCTT	2	8	34291	34298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009974	GGAT	2	8	36934	36941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009974	CCCG	2	8	37032	37039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_009974	TGTT	2	8	37200	37207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009974	GACG	2	8	44442	44449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009974	GATT	2	8	44487	44494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009974	AATC	2	8	44503	44510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009974	TGAT	2	8	52087	52094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009974	CAAT	2	8	52103	52110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009974	CTTG	2	8	53021	53028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009974	GATG	2	8	53517	53524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009974	GGCT	2	8	56876	56883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009974	ATCG	2	8	57108	57115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009974	GCCA	2	8	70319	70326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009974	TCCT	2	8	72157	72164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009974	TCGG	2	8	73614	73621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009974	TGCG	2	8	74272	74279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009974	CCAA	2	8	74557	74564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009974	GAAG	2	8	74755	74762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009974	GAAG	2	8	74783	74790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009974	CTTC	2	8	74815	74822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009974	AATC	2	8	75107	75114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009974	CATC	2	8	76489	76496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009974	ACCA	2	8	77420	77427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009974	GCTC	2	8	77463	77470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009974	GTTT	2	8	80779	80786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009974	CAAA	2	8	83417	83424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009974	AAAT	2	8	83494	83501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009974	AAAT	2	8	83845	83852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009974	GTAT	2	8	83874	83881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009974	CTAT	2	8	86291	86298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009974	TCGT	2	8	87368	87375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009974	CCCA	2	8	90254	90261	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_009974	TGCG	2	8	91037	91044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009974	GCAC	2	8	91568	91575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009974	GTCT	2	8	91707	91714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009974	AGCG	2	8	91864	91871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009974	CATT	2	8	92084	92091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009974	TGAT	2	8	92189	92196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009974	GCGT	2	8	96677	96684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.