MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 1449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	CAC	2	6	46	51	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009974	TCT	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901743
3	NC_009974	CCA	2	6	234	239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
4	NC_009974	CGT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901743
5	NC_009974	CGC	2	6	270	275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
6	NC_009974	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
7	NC_009974	TCT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901743
8	NC_009974	GGC	2	6	394	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
9	NC_009974	GAC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901743
10	NC_009974	CAC	2	6	473	478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
11	NC_009974	CAC	2	6	518	523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
12	NC_009974	GGC	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
13	NC_009974	CGG	2	6	637	642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
14	NC_009974	GAG	2	6	660	665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901743
15	NC_009974	TCA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901743
16	NC_009974	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
17	NC_009974	CAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901743
18	NC_009974	GCG	2	6	932	937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
19	NC_009974	CGT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
20	NC_009974	TCC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
21	NC_009974	CGG	2	6	1091	1096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
22	NC_009974	GTC	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
23	NC_009974	GTG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
24	NC_009974	CAT	2	6	1113	1118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
25	NC_009974	TCC	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
26	NC_009974	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
27	NC_009974	CAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
28	NC_009974	CCT	3	9	1358	1366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
29	NC_009974	TCG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
30	NC_009974	TCA	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
31	NC_009974	TTC	2	6	1458	1463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
32	NC_009974	CAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901744
33	NC_009974	TCG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
34	NC_009974	GCG	2	6	1653	1658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
35	NC_009974	AGT	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901744
36	NC_009974	TCC	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
37	NC_009974	GGC	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
38	NC_009974	CCG	2	6	1797	1802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
39	NC_009974	GTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901744
40	NC_009974	TTC	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
41	NC_009974	TTC	2	6	1950	1955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
42	NC_009974	CTT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
43	NC_009974	TGA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901744
44	NC_009974	AGC	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901744
45	NC_009974	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901744
46	NC_009974	CGC	2	6	2445	2450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
47	NC_009974	CGT	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
48	NC_009974	TTG	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901744
49	NC_009974	CCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901744
50	NC_009974	TGG	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
51	NC_009974	CAC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901744
52	NC_009974	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
53	NC_009974	CGC	2	6	2879	2884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
54	NC_009974	GCT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
55	NC_009974	GGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
56	NC_009974	TCC	2	6	2933	2938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009974	CAG	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009974	CTG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
59	NC_009974	TGA	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901745
60	NC_009974	TCA	3	9	3297	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901745
61	NC_009974	GCT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
62	NC_009974	GAC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901745
63	NC_009974	CCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901745
64	NC_009974	ATG	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901745
65	NC_009974	CAC	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901745
66	NC_009974	GCT	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
67	NC_009974	CCT	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009974	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009974	TGC	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009974	GCA	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009974	TCG	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009974	GCT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009974	GTC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009974	AGC	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901746
75	NC_009974	CAG	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901746
76	NC_009974	CAA	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901746
77	NC_009974	TGG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009974	GCG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901747
79	NC_009974	TGG	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901747
80	NC_009974	GCA	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901747
81	NC_009974	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
82	NC_009974	ACC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
83	NC_009974	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
84	NC_009974	GCC	2	6	4805	4810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
85	NC_009974	CCA	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
86	NC_009974	CCA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
87	NC_009974	CCT	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009974	TGC	2	6	4967	4972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009974	AAC	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901748
90	NC_009974	AAC	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901748
91	NC_009974	CGC	3	9	5197	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901748
92	NC_009974	ACT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901748
93	NC_009974	GGT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901748
94	NC_009974	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901748
95	NC_009974	CGC	2	6	5443	5448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901748
96	NC_009974	TGC	3	9	5514	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901748
97	NC_009974	ACC	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901748
98	NC_009974	CGC	2	6	5610	5615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009974	CGG	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009974	TCA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009974	ACC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
102	NC_009974	CAT	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
103	NC_009974	ATC	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
104	NC_009974	ATC	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
105	NC_009974	CCA	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
106	NC_009974	GGT	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901749
107	NC_009974	CAC	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
108	NC_009974	ACC	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
109	NC_009974	TCC	2	6	6099	6104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009974	CGG	2	6	6139	6144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009974	GCT	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009974	CGC	2	6	6168	6173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009974	GCC	2	6	6185	6190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009974	CCA	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009974	CAC	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009974	CTG	2	6	6258	6263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009974	CGT	2	6	6267	6272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009974	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009974	CCT	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009974	CTT	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901750
121	NC_009974	TGG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901750
122	NC_009974	GCC	2	6	6490	6495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901750
123	NC_009974	CGG	2	6	6508	6513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901750
124	NC_009974	TGT	2	6	6514	6519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901750
125	NC_009974	GTC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
126	NC_009974	ACC	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901750
127	NC_009974	TCG	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
128	NC_009974	CCA	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901750
129	NC_009974	TCG	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
130	NC_009974	GTT	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901750
131	NC_009974	CCA	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901750
132	NC_009974	GCG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901750
133	NC_009974	GTC	2	6	6977	6982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
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262	NC_009974	GGA	2	6	15224	15229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901755
263	NC_009974	CGC	2	6	15281	15286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901755
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265	NC_009974	TGG	2	6	15317	15322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901755
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291	NC_009974	CTG	2	6	16778	16783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901756
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433	NC_009974	ATC	2	6	26634	26639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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