MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	T	6	6	100	105	0 %	100 %	0 %	0 %	159901743
2	NC_009974	T	6	6	6644	6649	0 %	100 %	0 %	0 %	159901750
3	NC_009974	C	7	7	16861	16867	0 %	0 %	0 %	100 %	159901756
4	NC_009974	A	6	6	21154	21159	100 %	0 %	0 %	0 %	159901760
5	NC_009974	T	6	6	23616	23621	0 %	100 %	0 %	0 %	159901762
6	NC_009974	A	8	8	25417	25424	100 %	0 %	0 %	0 %	159901763
7	NC_009974	T	6	6	27371	27376	0 %	100 %	0 %	0 %	159901764
8	NC_009974	A	6	6	27418	27423	100 %	0 %	0 %	0 %	159901764
9	NC_009974	T	6	6	28392	28397	0 %	100 %	0 %	0 %	159901766
10	NC_009974	T	6	6	28692	28697	0 %	100 %	0 %	0 %	159901766
11	NC_009974	T	6	6	28766	28771	0 %	100 %	0 %	0 %	159901766
12	NC_009974	T	7	7	30062	30068	0 %	100 %	0 %	0 %	159901767
13	NC_009974	C	6	6	30256	30261	0 %	0 %	0 %	100 %	159901767
14	NC_009974	A	6	6	30438	30443	100 %	0 %	0 %	0 %	159901767
15	NC_009974	T	6	6	33135	33140	0 %	100 %	0 %	0 %	159901770
16	NC_009974	T	6	6	35233	35238	0 %	100 %	0 %	0 %	159901771
17	NC_009974	T	6	6	37728	37733	0 %	100 %	0 %	0 %	159901773
18	NC_009974	A	6	6	39181	39186	100 %	0 %	0 %	0 %	159901774
19	NC_009974	A	7	7	42316	42322	100 %	0 %	0 %	0 %	159901776
20	NC_009974	C	6	6	45025	45030	0 %	0 %	0 %	100 %	159901778
21	NC_009974	G	6	6	46223	46228	0 %	0 %	100 %	0 %	159901778
22	NC_009974	A	7	7	47688	47694	100 %	0 %	0 %	0 %	159901778
23	NC_009974	C	6	6	52574	52579	0 %	0 %	0 %	100 %	159901780
24	NC_009974	C	6	6	54978	54983	0 %	0 %	0 %	100 %	159901781
25	NC_009974	T	6	6	57509	57514	0 %	100 %	0 %	0 %	159901782
26	NC_009974	A	9	9	58767	58775	100 %	0 %	0 %	0 %	159901783
27	NC_009974	T	7	7	60455	60461	0 %	100 %	0 %	0 %	159901784
28	NC_009974	T	8	8	63019	63026	0 %	100 %	0 %	0 %	159901786
29	NC_009974	A	6	6	63474	63479	100 %	0 %	0 %	0 %	159901786
30	NC_009974	T	7	7	63803	63809	0 %	100 %	0 %	0 %	159901786
31	NC_009974	T	6	6	64588	64593	0 %	100 %	0 %	0 %	159901787
32	NC_009974	A	6	6	65067	65072	100 %	0 %	0 %	0 %	159901787
33	NC_009974	A	6	6	66876	66881	100 %	0 %	0 %	0 %	159901788
34	NC_009974	T	6	6	66888	66893	0 %	100 %	0 %	0 %	159901788
35	NC_009974	A	6	6	67367	67372	100 %	0 %	0 %	0 %	159901788
36	NC_009974	T	6	6	70584	70589	0 %	100 %	0 %	0 %	159901790
37	NC_009974	C	6	6	71896	71901	0 %	0 %	0 %	100 %	159901792
38	NC_009974	G	6	6	72257	72262	0 %	0 %	100 %	0 %	159901793
39	NC_009974	A	7	7	76242	76248	100 %	0 %	0 %	0 %	159901796
40	NC_009974	T	7	7	78812	78818	0 %	100 %	0 %	0 %	159901799
41	NC_009974	A	8	8	79991	79998	100 %	0 %	0 %	0 %	159901799
42	NC_009974	T	7	7	84665	84671	0 %	100 %	0 %	0 %	159901802
43	NC_009974	T	6	6	84684	84689	0 %	100 %	0 %	0 %	159901802
44	NC_009974	T	6	6	84758	84763	0 %	100 %	0 %	0 %	159901802
45	NC_009974	C	6	6	84826	84831	0 %	0 %	0 %	100 %	159901802
46	NC_009974	A	6	6	85637	85642	100 %	0 %	0 %	0 %	159901803
47	NC_009974	A	6	6	85746	85751	100 %	0 %	0 %	0 %	159901803
48	NC_009974	T	7	7	85771	85777	0 %	100 %	0 %	0 %	159901803
49	NC_009974	A	6	6	90807	90812	100 %	0 %	0 %	0 %	159901806
50	NC_009974	A	7	7	97145	97151	100 %	0 %	0 %	0 %	159901811
51	NC_009974	G	6	6	97163	97168	0 %	0 %	100 %	0 %	159901811

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.