Penta-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 268

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_009973CGACA2103687369640 %0 %20 %40 %159901513
2NC_009973TGCCC210618261910 %20 %20 %60 %159901515
3NC_009973GCGGT210844184500 %20 %60 %20 %159901515
4NC_009973GCCCG210967196800 %0 %40 %60 %159901516
5NC_009973CCACC210104551046420 %0 %0 %80 %Non-Coding
6NC_009973ATCCG210110631107220 %20 %20 %40 %159901517
7NC_009973ATAGC210125661257540 %20 %20 %20 %Non-Coding
8NC_009973TGCAT210145751458420 %40 %20 %20 %159901519
9NC_009973TTTTA210175331754220 %80 %0 %0 %Non-Coding
10NC_009973CGTGC21022691227000 %20 %40 %40 %159901525
11NC_009973CAGAT210229262293540 %20 %20 %20 %159901526
12NC_009973TTTTA210231882319720 %80 %0 %0 %Non-Coding
13NC_009973CACCG210235972360620 %0 %20 %60 %Non-Coding
14NC_009973ATGGC210263782638720 %20 %40 %20 %Non-Coding
15NC_009973CACAA210283982840760 %0 %0 %40 %159901533
16NC_009973TTGTC21030452304610 %60 %20 %20 %Non-Coding
17NC_009973TAGGA210316213163040 %20 %40 %0 %Non-Coding
18NC_009973GCGCC21032259322680 %0 %40 %60 %159901536
19NC_009973TTGGC21033118331270 %40 %40 %20 %159901536
20NC_009973TGGGG21033696337050 %20 %80 %0 %159901537
21NC_009973CGCAC210345143452320 %0 %20 %60 %Non-Coding
22NC_009973GGGTT21037453374620 %40 %60 %0 %159901540
23NC_009973GCTAT210379293793820 %40 %20 %20 %Non-Coding
24NC_009973TGCGG21037996380050 %20 %60 %20 %Non-Coding
25NC_009973ATCCA210381323814140 %20 %0 %40 %Non-Coding
26NC_009973CTGAT210389663897520 %40 %20 %20 %159901541
27NC_009973AATGA210399163992560 %20 %20 %0 %Non-Coding
28NC_009973CAGTC210407684077720 %20 %20 %40 %159901542
29NC_009973CCCAA210441134412240 %0 %0 %60 %Non-Coding
30NC_009973CTTGA210449754498420 %40 %20 %20 %159901544
31NC_009973CCGCG21046721467300 %0 %40 %60 %159901545
32NC_009973GCGGT21048829488380 %20 %60 %20 %159901547
33NC_009973GACCA210497594976840 %0 %20 %40 %Non-Coding
34NC_009973CTCTA210499314994020 %40 %0 %40 %159901548
35NC_009973GGACA210509285093740 %0 %40 %20 %159901548
36NC_009973CTGCA210525565256520 %20 %20 %40 %159901549
37NC_009973CGCTG21058139581480 %20 %40 %40 %159901555
38NC_009973GCCTT21059292593010 %40 %20 %40 %159901556
39NC_009973CGATG210597585976720 %20 %40 %20 %Non-Coding
40NC_009973AGCCC210598525986120 %0 %20 %60 %Non-Coding
41NC_009973GGCAG210608706087920 %0 %60 %20 %159901557
42NC_009973TTGCA210629116292020 %40 %20 %20 %159901557
43NC_009973GTCTT21063448634570 %60 %20 %20 %Non-Coding
44NC_009973GCGCA210636046361320 %0 %40 %40 %159901558
45NC_009973GGCTG21063828638370 %20 %60 %20 %159901558
46NC_009973GCAAG210677036771240 %0 %40 %20 %159901560
47NC_009973GCAGG210677556776420 %0 %60 %20 %159901560
48NC_009973ACCAA210683996840860 %0 %0 %40 %159901561
49NC_009973AACCA210742667427560 %0 %0 %40 %159901569
50NC_009973CATGG210748557486420 %20 %40 %20 %159901570
51NC_009973GATCG210749777498620 %20 %40 %20 %159901570
52NC_009973CCCGC21075442754510 %0 %20 %80 %159901570
53NC_009973CGTGG21075568755770 %20 %60 %20 %159901570
54NC_009973CGCTG21076038760470 %20 %40 %40 %159901571
55NC_009973ACCCA210771387714740 %0 %0 %60 %159901572
56NC_009973GCCCA210774727748120 %0 %20 %60 %159901573
57NC_009973AGCGC210779407794920 %0 %40 %40 %159901574
58NC_009973CGCCA210780927810120 %0 %20 %60 %159901574
59NC_009973GCGGT21079218792270 %20 %60 %20 %159901576
60NC_009973GGTCG21079435794440 %20 %60 %20 %159901576
61NC_009973ATCGC210796647967320 %20 %20 %40 %159901576
62NC_009973CCTGC21081393814020 %20 %20 %60 %159901576
63NC_009973CGGCC21081844818530 %0 %40 %60 %159901577
64NC_009973TATGC210827918280020 %40 %20 %20 %159901578
65NC_009973TTGTG21084124841330 %60 %40 %0 %Non-Coding
66NC_009973GATTT210856818569020 %60 %20 %0 %159901580
67NC_009973TAATA210869418695060 %40 %0 %0 %159901580
68NC_009973ATTCA210877598776840 %40 %0 %20 %159901581
69NC_009973ATATT210882228823140 %60 %0 %0 %159901581
70NC_009973ATAAC210891798918860 %20 %0 %20 %159901582
71NC_009973GGCGG21091485914940 %0 %80 %20 %159901584
72NC_009973AGTGG210930269303520 %20 %60 %0 %159901585
73NC_009973AAATC210940209402960 %20 %0 %20 %159901586
74NC_009973CGATG210945479455620 %20 %40 %20 %159901586
75NC_009973CAATT210956169562540 %40 %0 %20 %159901587
76NC_009973GATTG210958479585620 %40 %40 %0 %159901588
77NC_009973GATTG210967399674820 %40 %40 %0 %159901589
78NC_009973AGCGA210972099721840 %0 %40 %20 %159901589
79NC_009973CGCGG2101003401003490 %0 %60 %40 %159901591
80NC_009973TTGGT2101003571003660 %60 %40 %0 %159901591
81NC_009973ATCCA21010200910201840 %20 %0 %40 %Non-Coding
82NC_009973CGATC21010222210223120 %20 %20 %40 %Non-Coding
83NC_009973AAACT21010301010301960 %20 %0 %20 %Non-Coding
84NC_009973CGGCG2101030331030420 %0 %60 %40 %Non-Coding
85NC_009973CATTT21010544110545020 %60 %0 %20 %Non-Coding
86NC_009973GCGCA21010962810963720 %0 %40 %40 %159901594
87NC_009973GGGCT2101098511098600 %20 %60 %20 %Non-Coding
88NC_009973CAATG21011041611042540 %20 %20 %20 %Non-Coding
89NC_009973CAACT21011213411214340 %20 %0 %40 %159901597
90NC_009973CAAAC21011289011289960 %0 %0 %40 %159901597
91NC_009973TGAGG21011562111563020 %20 %60 %0 %159901599
92NC_009973ACCAA21011900711901660 %0 %0 %40 %Non-Coding
93NC_009973AATGG21012210012210940 %20 %40 %0 %159901604
94NC_009973GTGCC2101227571227660 %20 %40 %40 %159901605
95NC_009973CCCTG2101235131235220 %20 %20 %60 %159901607
96NC_009973CGATT21012494612495520 %40 %20 %20 %159901608
97NC_009973CAGCG21012674312675220 %0 %40 %40 %159901609
98NC_009973TTTGG2101281691281780 %60 %40 %0 %159901609
99NC_009973CGGGG2101324751324840 %0 %80 %20 %159901612
100NC_009973GGGGA21013360513361420 %0 %80 %0 %159901612
101NC_009973TGGAA21013486513487440 %20 %40 %0 %Non-Coding
102NC_009973GCGCC2101360071360160 %0 %40 %60 %159901613
103NC_009973ATGGC21013678813679720 %20 %40 %20 %159901613
104NC_009973TGGGG2101370351370440 %20 %80 %0 %159901613
105NC_009973GACCT21013758413759320 %20 %20 %40 %159901614
106NC_009973GCACG21013983513984420 %0 %40 %40 %159901616
107NC_009973TCCGA21014045814046720 %20 %20 %40 %159901616
108NC_009973CGCGC2101409041409130 %0 %40 %60 %159901616
109NC_009973GGCAG21014240314241220 %0 %60 %20 %159901617
110NC_009973GCGCA21014398614399520 %0 %40 %40 %159901617
111NC_009973CATCG21014422014422920 %20 %20 %40 %159901617
112NC_009973CCACC21014521414522320 %0 %0 %80 %159901618
113NC_009973CGGTC2101453201453290 %20 %40 %40 %159901618
114NC_009973GCCAC21014546914547820 %0 %20 %60 %159901618
115NC_009973CCACC21014642014642920 %0 %0 %80 %159901618
116NC_009973TGCCG2101469491469580 %20 %40 %40 %Non-Coding
117NC_009973TCGCC2101491581491670 %20 %20 %60 %159901620
118NC_009973GTCCA21015032415033320 %20 %20 %40 %159901622
119NC_009973CCCAC21015063215064120 %0 %0 %80 %159901622
120NC_009973GCGGG2101519801519890 %0 %80 %20 %159901623
121NC_009973GGCGG2101520841520930 %0 %80 %20 %159901623
122NC_009973ATGGG21015225515226420 %20 %60 %0 %159901623
123NC_009973GCTGG2101525331525420 %20 %60 %20 %159901623
124NC_009973GCGAT21015273115274020 %20 %40 %20 %Non-Coding
125NC_009973CATCG21015277815278720 %20 %20 %40 %Non-Coding
126NC_009973CATCG21015283015283920 %20 %20 %40 %Non-Coding
127NC_009973CATCG21015288215289120 %20 %20 %40 %Non-Coding
128NC_009973CATCG21015297515298420 %20 %20 %40 %Non-Coding
129NC_009973GTCCT2101531041531130 %40 %20 %40 %159901624
130NC_009973ATTCC21015333915334820 %40 %0 %40 %159901624
131NC_009973ACCGC21015525515526420 %0 %20 %60 %159901625
132NC_009973GCGCC2101553341553430 %0 %40 %60 %159901625
133NC_009973GCACG21015539415540320 %0 %40 %40 %159901625
134NC_009973GCGCC2101558111558200 %0 %40 %60 %159901625
135NC_009973GCAGG21015587615588520 %0 %60 %20 %159901625
136NC_009973CCACG21015648815649720 %0 %20 %60 %159901626
137NC_009973TGGCA21015797015797920 %20 %40 %20 %159901627
138NC_009973TGTTT2101580821580910 %80 %20 %0 %Non-Coding
139NC_009973GCCGC2101584831584920 %0 %40 %60 %159901628
140NC_009973CCCAT21015940415941320 %20 %0 %60 %159901629
141NC_009973TTCCC2101599621599710 %40 %0 %60 %159901629
142NC_009973GCAAG21016187016187940 %0 %40 %20 %159901631
143NC_009973CGCGC2101627831627920 %0 %40 %60 %159901632
144NC_009973CGCGC2101658151658240 %0 %40 %60 %159901633
145NC_009973AATAC21016615016615960 %20 %0 %20 %159901633
146NC_009973AGATC21016680916681840 %20 %20 %20 %159901633
147NC_009973TCCAG21016782816783720 %20 %20 %40 %159901633
148NC_009973CAGCC21016800916801820 %0 %20 %60 %159901633
149NC_009973GCACC21016880316881220 %0 %20 %60 %159901634
150NC_009973ATACC21016905116906040 %20 %0 %40 %159901634
151NC_009973TGGCA21017082917083820 %20 %40 %20 %159901634
152NC_009973TGTCC2101723611723700 %40 %20 %40 %159901635
153NC_009973GATCG21017284517285420 %20 %40 %20 %159901635
154NC_009973ACACC21017333917334840 %0 %0 %60 %Non-Coding
155NC_009973AATCA21017398917399860 %20 %0 %20 %159901636
156NC_009973CAGTC21017445917446820 %20 %20 %40 %159901636
157NC_009973GATAC21017454517455440 %20 %20 %20 %159901636
158NC_009973GTGAC21017846617847520 %20 %40 %20 %159901637
159NC_009973CGCGA21017921817922720 %0 %40 %40 %159901638
160NC_009973TGCAG21018065918066820 %20 %40 %20 %Non-Coding
161NC_009973AAGGA21018084718085660 %0 %40 %0 %Non-Coding
162NC_009973TAATA21018721518722460 %40 %0 %0 %159901645
163NC_009973ATCAT21018723418724340 %40 %0 %20 %159901645
164NC_009973TTTTG2101881651881740 %80 %20 %0 %159901646
165NC_009973GAATG21019091919092840 %20 %40 %0 %159901649
166NC_009973TTATT21019239019239920 %80 %0 %0 %Non-Coding
167NC_009973CGGGG2101960471960560 %0 %80 %20 %159901653
168NC_009973TACAG21019625719626640 %20 %20 %20 %Non-Coding
169NC_009973TTGCT2101979281979370 %60 %20 %20 %Non-Coding
170NC_009973TCGCC2101984571984660 %20 %20 %60 %159901655
171NC_009973CCACC21020419120420020 %0 %0 %80 %159901656
172NC_009973TTAAC21020421520422440 %40 %0 %20 %159901656
173NC_009973AATCA21020487420488360 %20 %0 %20 %159901656
174NC_009973ACGGC21020728020728920 %0 %40 %40 %159901656
175NC_009973TCGCG2102082512082600 %20 %40 %40 %159901656
176NC_009973TGGGA21020949120950020 %20 %60 %0 %159901656
177NC_009973CTATC21021731921732820 %40 %0 %40 %Non-Coding
178NC_009973TGGTA21021862221863120 %40 %40 %0 %159901660
179NC_009973CATGC21021948021948920 %20 %20 %40 %159901661
180NC_009973GGACT21022178522179420 %20 %40 %20 %159901662
181NC_009973CTGCG2102269712269800 %20 %40 %40 %159901664
182NC_009973GCGCC2102270432270520 %0 %40 %60 %159901664
183NC_009973GCCAG21022763022763920 %0 %40 %40 %159901664
184NC_009973GACGC21022974122975020 %0 %40 %40 %Non-Coding
185NC_009973TCCGC2102303142303230 %20 %20 %60 %159901667
186NC_009973TCCAA21023626123627040 %20 %0 %40 %159901673
187NC_009973GATAG21023650123651040 %20 %40 %0 %159901673
188NC_009973TGATC21023797623798520 %40 %20 %20 %159901673
189NC_009973ACCGA21023848823849740 %0 %20 %40 %159901673
190NC_009973CACGC21023895023895920 %0 %20 %60 %Non-Coding
191NC_009973GGGGC2102392802392890 %0 %80 %20 %159901674
192NC_009973GCGCG2102397782397870 %0 %60 %40 %159901674
193NC_009973TATGG21024126024126920 %40 %40 %0 %Non-Coding
194NC_009973ATGCA21024425524426440 %20 %20 %20 %159901676
195NC_009973CAATA21024468324469260 %20 %0 %20 %159901676
196NC_009973CCCAG21024714924715820 %0 %20 %60 %159901678
197NC_009973AGGCA21024757924758840 %0 %40 %20 %Non-Coding
198NC_009973TGATA21024804124805040 %40 %20 %0 %Non-Coding
199NC_009973GCAAC21025180125181040 %0 %20 %40 %159901680
200NC_009973TGCCA21025215625216520 %20 %20 %40 %159901680
201NC_009973CAGCG21025396125397020 %0 %40 %40 %159901681
202NC_009973AGCAA21025475725476660 %0 %20 %20 %Non-Coding
203NC_009973TGGCG2102549862549950 %20 %60 %20 %Non-Coding
204NC_009973GGCAT31525663225664620 %20 %40 %20 %159901684
205NC_009973TCGCC2102567192567280 %20 %20 %60 %159901684
206NC_009973CCCCG2102571772571860 %0 %20 %80 %Non-Coding
207NC_009973CACGG21026035426036320 %0 %40 %40 %159901687
208NC_009973GGCAG21026056926057820 %0 %60 %20 %159901687
209NC_009973TCCTG2102614142614230 %40 %20 %40 %159901689
210NC_009973GGGAA21026227726228640 %0 %60 %0 %159901691
211NC_009973GATGG21026264926265820 %20 %60 %0 %159901691
212NC_009973TGGCA21026326026326920 %20 %40 %20 %159901692
213NC_009973CCAAG21026360526361440 %0 %20 %40 %159901692
214NC_009973ATAAA21026384026384980 %20 %0 %0 %159901692
215NC_009973CATAC21026510726511640 %20 %0 %40 %159901692
216NC_009973ACCAT21026632326633240 %20 %0 %40 %159901693
217NC_009973CGAGC21026740126741020 %0 %40 %40 %Non-Coding
218NC_009973GCTCG2102674212674300 %20 %40 %40 %Non-Coding
219NC_009973TAGCG21026751026751920 %20 %40 %20 %159901694
220NC_009973CAACC21026903926904840 %0 %0 %60 %159901694
221NC_009973ACCAG21026929826930740 %0 %20 %40 %Non-Coding
222NC_009973CCATC21026987926988820 %20 %0 %60 %159901695
223NC_009973GCTCG2102721182721270 %20 %40 %40 %159901697
224NC_009973CGGTG2102730602730690 %20 %60 %20 %159901697
225NC_009973GATTA21027651327652240 %40 %20 %0 %Non-Coding
226NC_009973CAAAA21027763827764780 %0 %0 %20 %159901701
227NC_009973GCCCT2102819692819780 %20 %20 %60 %Non-Coding
228NC_009973AACAC21028332728333660 %0 %0 %40 %159901705
229NC_009973GCATA21028445928446840 %20 %20 %20 %159901707
230NC_009973CGTAT21028472828473720 %40 %20 %20 %159901707
231NC_009973CCGCA21028707228708120 %0 %20 %60 %159901708
232NC_009973ATGGT21028766128767020 %40 %40 %0 %159901708
233NC_009973CCGTT2102883002883090 %40 %20 %40 %159901709
234NC_009973GGAAC21029027229028140 %0 %40 %20 %159901710
235NC_009973GACGC21029242029242920 %0 %40 %40 %159901712
236NC_009973CAACA21029320429321360 %0 %0 %40 %159901713
237NC_009973CAAGG21029376829377740 %0 %40 %20 %159901714
238NC_009973CAGGG21029566829567720 %0 %60 %20 %Non-Coding
239NC_009973ACTCT21029680429681320 %40 %0 %40 %Non-Coding
240NC_009973GATCG21029817529818420 %20 %40 %20 %159901716
241NC_009973GAATC21029914029914940 %20 %20 %20 %159901717
242NC_009973CATAG21029957229958140 %20 %20 %20 %159901717
243NC_009973AGCAG21030021430022340 %0 %40 %20 %159901718
244NC_009973CTATC21030099430100320 %40 %0 %40 %Non-Coding
245NC_009973CACAA21030114330115260 %0 %0 %40 %Non-Coding
246NC_009973ATCCA21030445730446640 %20 %0 %40 %159901719
247NC_009973GTGCT2103047093047180 %40 %40 %20 %159901719
248NC_009973CATGC21030650530651420 %20 %20 %40 %159901721
249NC_009973ATCAC21030942630943540 %20 %0 %40 %159901724
250NC_009973GTGAG21030967030967920 %20 %60 %0 %159901724
251NC_009973ACCAC21031058731059640 %0 %0 %60 %159901725
252NC_009973CATCA21031103331104240 %20 %0 %40 %159901725
253NC_009973TCCAC21031273731274620 %20 %0 %60 %Non-Coding
254NC_009973AATGA21031339231340160 %20 %20 %0 %159901726
255NC_009973ACCAA21031571731572660 %0 %0 %40 %159901726
256NC_009973AGCGA21031575231576140 %0 %40 %20 %159901726
257NC_009973TCTGT2103160853160940 %60 %20 %20 %159901726
258NC_009973GCGCA21031853331854220 %0 %40 %40 %159901727
259NC_009973CGCTG2103245383245470 %20 %40 %40 %Non-Coding
260NC_009973TTCCA21032478932479820 %40 %0 %40 %159901732
261NC_009973AATCG21032519832520740 %20 %20 %20 %159901733
262NC_009973CATAG21032993032993940 %20 %20 %20 %Non-Coding
263NC_009973ACTAT21033203033203940 %40 %0 %20 %159901736
264NC_009973CGCGC2103348133348220 %0 %40 %60 %Non-Coding
265NC_009973CCATG21033624533625420 %20 %20 %40 %159901738
266NC_009973GCGCA21033645433646320 %0 %40 %40 %159901738
267NC_009973TCTGT2103368893368980 %60 %20 %20 %Non-Coding
268NC_009973CGCCA21033761933762820 %0 %20 %60 %159901740