MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	CGCA	2	8	23	30	25 %	0 %	25 %	50 %	159901511
2	NC_009973	CAAC	2	8	645	652	50 %	0 %	0 %	50 %	159901511
3	NC_009973	TGCC	2	8	684	691	0 %	25 %	25 %	50 %	159901511
4	NC_009973	TGGC	2	8	699	706	0 %	25 %	50 %	25 %	159901511
5	NC_009973	GCAC	2	8	1027	1034	25 %	0 %	25 %	50 %	159901511
6	NC_009973	CTGC	2	8	1606	1613	0 %	25 %	25 %	50 %	159901511
7	NC_009973	TCCC	2	8	2880	2887	0 %	25 %	0 %	75 %	159901512
8	NC_009973	CTCG	2	8	2956	2963	0 %	25 %	25 %	50 %	159901512
9	NC_009973	CAGG	2	8	3352	3359	25 %	0 %	50 %	25 %	159901512
10	NC_009973	GCGA	2	8	3425	3432	25 %	0 %	50 %	25 %	159901512
11	NC_009973	GCCG	2	8	5151	5158	0 %	0 %	50 %	50 %	159901515
12	NC_009973	AACC	2	8	5324	5331	50 %	0 %	0 %	50 %	159901515
13	NC_009973	CAGC	2	8	7527	7534	25 %	0 %	25 %	50 %	159901515
14	NC_009973	GCCA	2	8	7554	7561	25 %	0 %	25 %	50 %	159901515
15	NC_009973	CCAA	2	8	8260	8267	50 %	0 %	0 %	50 %	159901515
16	NC_009973	GCTG	2	8	8898	8905	0 %	25 %	50 %	25 %	159901515
17	NC_009973	GCGG	2	8	9084	9091	0 %	0 %	75 %	25 %	159901515
18	NC_009973	GGCT	2	8	9402	9409	0 %	25 %	50 %	25 %	159901516
19	NC_009973	CACG	2	8	10447	10454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009973	ATCA	2	8	11230	11237	50 %	25 %	0 %	25 %	159901517
21	NC_009973	CCAA	2	8	11957	11964	50 %	0 %	0 %	50 %	159901517
22	NC_009973	ACCT	2	8	12537	12544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009973	TGCC	2	8	13096	13103	0 %	25 %	25 %	50 %	159901518
24	NC_009973	ATGA	2	8	13667	13674	50 %	25 %	25 %	0 %	159901518
25	NC_009973	ACCG	2	8	13819	13826	25 %	0 %	25 %	50 %	159901519
26	NC_009973	TTGG	2	8	14161	14168	0 %	50 %	50 %	0 %	159901519
27	NC_009973	AAAG	2	8	14176	14183	75 %	0 %	25 %	0 %	159901519
28	NC_009973	TTTA	2	8	14500	14507	25 %	75 %	0 %	0 %	159901519
29	NC_009973	CGGT	2	8	14985	14992	0 %	25 %	50 %	25 %	159901519
30	NC_009973	GCAG	2	8	15297	15304	25 %	0 %	50 %	25 %	159901520
31	NC_009973	CCCG	2	8	16511	16518	0 %	0 %	25 %	75 %	159901521
32	NC_009973	GCAG	2	8	16661	16668	25 %	0 %	50 %	25 %	159901521
33	NC_009973	GGTT	2	8	16691	16698	0 %	50 %	50 %	0 %	159901521
34	NC_009973	CAGT	2	8	16826	16833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009973	AATA	2	8	16883	16890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009973	TATT	2	8	16960	16967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009973	CTAT	2	8	17109	17116	25 %	50 %	0 %	25 %	159901522
38	NC_009973	AATC	2	8	17783	17790	50 %	25 %	0 %	25 %	159901523
39	NC_009973	TTGG	2	8	17851	17858	0 %	50 %	50 %	0 %	159901523
40	NC_009973	CAAA	2	8	17872	17879	75 %	0 %	0 %	25 %	159901523
41	NC_009973	CATC	2	8	17956	17963	25 %	25 %	0 %	50 %	159901523
42	NC_009973	AAGG	2	8	18852	18859	50 %	0 %	50 %	0 %	159901523
43	NC_009973	CTCG	2	8	19068	19075	0 %	25 %	25 %	50 %	159901523
44	NC_009973	CAGT	2	8	19168	19175	25 %	25 %	25 %	25 %	159901523
45	NC_009973	TTGC	2	8	19986	19993	0 %	50 %	25 %	25 %	159901523
46	NC_009973	ATGA	2	8	20170	20177	50 %	25 %	25 %	0 %	159901523
47	NC_009973	GATT	2	8	20332	20339	25 %	50 %	25 %	0 %	159901523
48	NC_009973	TCCT	2	8	20464	20471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009973	GCTG	2	8	20533	20540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009973	CCAT	2	8	20682	20689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009973	GCAG	2	8	21004	21011	25 %	0 %	50 %	25 %	159901524
52	NC_009973	GGCT	2	8	22184	22191	0 %	25 %	50 %	25 %	159901525
53	NC_009973	TCAA	2	8	22650	22657	50 %	25 %	0 %	25 %	159901525
54	NC_009973	GACG	2	8	22795	22802	25 %	0 %	50 %	25 %	159901526
55	NC_009973	GGAT	2	8	22956	22963	25 %	25 %	50 %	0 %	159901526
56	NC_009973	CGAG	2	8	23464	23471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009973	TCAA	2	8	23668	23675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009973	ATCG	2	8	24135	24142	25 %	25 %	25 %	25 %	159901527
59	NC_009973	ACCG	2	8	24379	24386	25 %	0 %	25 %	50 %	159901528
60	NC_009973	AGCA	2	8	24720	24727	50 %	0 %	25 %	25 %	159901528
61	NC_009973	TAAT	2	8	24769	24776	50 %	50 %	0 %	0 %	159901528
62	NC_009973	AGTC	2	8	25923	25930	25 %	25 %	25 %	25 %	159901531
63	NC_009973	ATGC	2	8	26259	26266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009973	CCAT	2	8	26849	26856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009973	ACCC	2	8	27122	27129	25 %	0 %	0 %	75 %	159901532
66	NC_009973	AGGG	2	8	27390	27397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009973	GCTG	2	8	27968	27975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009973	ACGG	2	8	28552	28559	25 %	0 %	50 %	25 %	159901533
69	NC_009973	AATC	2	8	28900	28907	50 %	25 %	0 %	25 %	159901533
70	NC_009973	CACC	2	8	28987	28994	25 %	0 %	0 %	75 %	159901533
71	NC_009973	GAGG	2	8	29021	29028	25 %	0 %	75 %	0 %	159901533
72	NC_009973	ATGG	2	8	29491	29498	25 %	25 %	50 %	0 %	159901534
73	NC_009973	TATG	2	8	30238	30245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009973	CAAG	2	8	30262	30269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009973	CACG	2	8	30414	30421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009973	GCTG	2	8	30616	30623	0 %	25 %	50 %	25 %	159901535
77	NC_009973	CGCA	2	8	30894	30901	25 %	0 %	25 %	50 %	159901535
78	NC_009973	TGGC	2	8	30923	30930	0 %	25 %	50 %	25 %	159901535
79	NC_009973	ATCC	2	8	31248	31255	25 %	25 %	0 %	50 %	159901535
80	NC_009973	GCAT	2	8	32347	32354	25 %	25 %	25 %	25 %	159901536
81	NC_009973	ATTC	2	8	33974	33981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009973	CATC	2	8	34256	34263	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009973	GGGT	2	8	34425	34432	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009973	GGCA	2	8	34463	34470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009973	TTGT	2	8	35150	35157	0 %	75 %	25 %	0 %	159901538
86	NC_009973	CGCT	2	8	35286	35293	0 %	25 %	25 %	50 %	159901538
87	NC_009973	TAGG	2	8	35506	35513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009973	TAGC	2	8	35883	35890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009973	TCAT	2	8	36151	36158	25 %	50 %	0 %	25 %	159901539
90	NC_009973	ACGT	2	8	36165	36172	25 %	25 %	25 %	25 %	159901539
91	NC_009973	CTGG	2	8	36663	36670	0 %	25 %	50 %	25 %	159901539
92	NC_009973	GGAT	2	8	36737	36744	25 %	25 %	50 %	0 %	159901539
93	NC_009973	CATA	2	8	36964	36971	50 %	25 %	0 %	25 %	159901539
94	NC_009973	GAGT	2	8	36978	36985	25 %	25 %	50 %	0 %	159901539
95	NC_009973	GAGC	2	8	37333	37340	25 %	0 %	50 %	25 %	159901540
96	NC_009973	ATCC	2	8	37410	37417	25 %	25 %	0 %	50 %	159901540
97	NC_009973	ATCG	2	8	37481	37488	25 %	25 %	25 %	25 %	159901540
98	NC_009973	TCAT	2	8	38320	38327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009973	TATC	2	8	38679	38686	25 %	50 %	0 %	25 %	159901541
100	NC_009973	CTCA	2	8	39703	39710	25 %	25 %	0 %	50 %	159901541
101	NC_009973	CATC	2	8	40134	40141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009973	ATGC	2	8	40228	40235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009973	CGTC	2	8	40330	40337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009973	TCCA	2	8	40514	40521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009973	GTGC	2	8	40740	40747	0 %	25 %	50 %	25 %	159901542
106	NC_009973	TCCA	2	8	42320	42327	25 %	25 %	0 %	50 %	159901542
107	NC_009973	GGCT	2	8	42422	42429	0 %	25 %	50 %	25 %	159901542
108	NC_009973	TGTA	2	8	42650	42657	25 %	50 %	25 %	0 %	159901542
109	NC_009973	CCAG	2	8	42689	42696	25 %	0 %	25 %	50 %	159901542
110	NC_009973	GCCA	2	8	43401	43408	25 %	0 %	25 %	50 %	159901542
111	NC_009973	GCAT	2	8	43524	43531	25 %	25 %	25 %	25 %	159901542
112	NC_009973	GTGC	2	8	43704	43711	0 %	25 %	50 %	25 %	159901542
113	NC_009973	ACAT	2	8	43882	43889	50 %	25 %	0 %	25 %	159901542
114	NC_009973	GCAT	2	8	44067	44074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009973	GCAT	2	8	44228	44235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009973	TCGA	2	8	44257	44264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009973	ACGA	2	8	44514	44521	50 %	0 %	25 %	25 %	159901543
118	NC_009973	GGGT	2	8	44612	44619	0 %	25 %	75 %	0 %	159901543
119	NC_009973	CCCT	2	8	44635	44642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_009973	CAGC	2	8	45380	45387	25 %	0 %	25 %	50 %	159901544
121	NC_009973	ATGG	2	8	47503	47510	25 %	25 %	50 %	0 %	159901545
122	NC_009973	GCGT	2	8	47859	47866	0 %	25 %	50 %	25 %	159901545
123	NC_009973	ACCG	2	8	48365	48372	25 %	0 %	25 %	50 %	159901546
124	NC_009973	CCAT	2	8	48407	48414	25 %	25 %	0 %	50 %	159901546
125	NC_009973	TGGG	2	8	48508	48515	0 %	25 %	75 %	0 %	159901546
126	NC_009973	GGGC	2	8	48810	48817	0 %	0 %	75 %	25 %	159901547
127	NC_009973	CTAC	2	8	49097	49104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009973	GTTT	2	8	49270	49277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009973	GCAA	2	8	49340	49347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009973	TTTG	2	8	50088	50095	0 %	75 %	25 %	0 %	159901548
131	NC_009973	GGCA	2	8	50136	50143	25 %	0 %	50 %	25 %	159901548
132	NC_009973	GTCA	2	8	51534	51541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009973	TGGC	2	8	51714	51721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009973	ATCC	2	8	51759	51766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009973	CTGC	2	8	51975	51982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009973	ACCG	2	8	52836	52843	25 %	0 %	25 %	50 %	159901549
137	NC_009973	CTGG	2	8	52868	52875	0 %	25 %	50 %	25 %	159901549
138	NC_009973	ATAG	2	8	53212	53219	50 %	25 %	25 %	0 %	159901550
139	NC_009973	CACC	2	8	54092	54099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_009973	GGCT	2	8	54410	54417	0 %	25 %	50 %	25 %	159901552
141	NC_009973	TCAT	2	8	55371	55378	25 %	50 %	0 %	25 %	159901553
142	NC_009973	CCGC	2	8	55555	55562	0 %	0 %	25 %	75 %	159901553
143	NC_009973	CCAT	2	8	55916	55923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009973	ATCG	2	8	56185	56192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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