MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 3979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	ACC	2	6	97	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
2	NC_009973	ACC	2	6	106	111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
3	NC_009973	ACC	2	6	124	129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
4	NC_009973	CTA	2	6	180	185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901511
5	NC_009973	GCC	2	6	207	212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
6	NC_009973	TGG	2	6	214	219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901511
7	NC_009973	GCC	2	6	301	306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
8	NC_009973	GGA	2	6	387	392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901511
9	NC_009973	GAG	2	6	517	522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901511
10	NC_009973	GCA	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
11	NC_009973	CCA	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
12	NC_009973	GCC	2	6	616	621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
13	NC_009973	TGG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901511
14	NC_009973	ACC	2	6	794	799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
15	NC_009973	CAA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901511
16	NC_009973	GAC	2	6	862	867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
17	NC_009973	GTC	2	6	896	901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
18	NC_009973	CCT	2	6	953	958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901511
19	NC_009973	ATG	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901511
20	NC_009973	CAC	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
21	NC_009973	CGG	2	6	1107	1112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901511
22	NC_009973	AAC	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901511
23	NC_009973	GTC	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
24	NC_009973	ACG	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
25	NC_009973	CCG	2	6	1319	1324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
26	NC_009973	GGC	2	6	1489	1494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901511
27	NC_009973	CCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
28	NC_009973	GAC	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
29	NC_009973	AGC	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
30	NC_009973	TCC	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901511
31	NC_009973	CCA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
32	NC_009973	CAA	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901511
33	NC_009973	GTC	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
34	NC_009973	GTC	2	6	1933	1938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
35	NC_009973	CGC	2	6	1978	1983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
36	NC_009973	CTT	2	6	2022	2027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901511
37	NC_009973	GTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901511
38	NC_009973	GGC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901511
39	NC_009973	CAC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
40	NC_009973	CCG	2	6	2312	2317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
41	NC_009973	GTC	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
42	NC_009973	CCA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
43	NC_009973	GCC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901512
44	NC_009973	GCT	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901512
45	NC_009973	GAG	3	9	2971	2979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901512
46	NC_009973	CAC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901512
47	NC_009973	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901512
48	NC_009973	CAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901512
49	NC_009973	GCC	2	6	3265	3270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901512
50	NC_009973	ACC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901512
51	NC_009973	ATC	2	6	3386	3391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901512
52	NC_009973	ATC	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901512
53	NC_009973	GGC	2	6	3406	3411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901512
54	NC_009973	CGG	2	6	3563	3568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901513
55	NC_009973	CAG	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901513
56	NC_009973	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901513
57	NC_009973	GGT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901513
58	NC_009973	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901513
59	NC_009973	GGA	2	6	3981	3986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901513
60	NC_009973	AGC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901514
61	NC_009973	GCG	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901514
62	NC_009973	CCG	2	6	4452	4457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901514
63	NC_009973	TGA	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901515
64	NC_009973	CTT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901515
65	NC_009973	CCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901515
66	NC_009973	AGC	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
67	NC_009973	CAC	2	6	5085	5090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
68	NC_009973	GGC	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901515
69	NC_009973	CCG	3	9	5180	5188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
70	NC_009973	CTG	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
71	NC_009973	GCA	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
72	NC_009973	GGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901515
73	NC_009973	CCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
74	NC_009973	CGC	2	6	5343	5348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
75	NC_009973	GCA	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
76	NC_009973	TGC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
77	NC_009973	AGC	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
78	NC_009973	TGG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901515
79	NC_009973	CAC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
80	NC_009973	AGC	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
81	NC_009973	GCC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
82	NC_009973	GCC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
83	NC_009973	AGC	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
84	NC_009973	AGA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901515
85	NC_009973	CAG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
86	NC_009973	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
87	NC_009973	GTC	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
88	NC_009973	CTG	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
89	NC_009973	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
90	NC_009973	CCG	2	6	6488	6493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
91	NC_009973	CCA	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
92	NC_009973	GAA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901515
93	NC_009973	TCG	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
94	NC_009973	GCC	2	6	6825	6830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
95	NC_009973	CGA	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
96	NC_009973	GTG	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901515
97	NC_009973	CCG	2	6	7168	7173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
98	NC_009973	GCA	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
99	NC_009973	GAC	2	6	7196	7201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
100	NC_009973	TCG	2	6	7303	7308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
101	NC_009973	GCG	2	6	7372	7377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901515
102	NC_009973	AGC	3	9	7447	7455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
103	NC_009973	GGC	2	6	7537	7542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901515
104	NC_009973	GCC	2	6	7689	7694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
105	NC_009973	TGA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901515
106	NC_009973	GCA	2	6	7772	7777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
107	NC_009973	TCG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
108	NC_009973	CTC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901515
109	NC_009973	CAG	2	6	7863	7868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
110	NC_009973	GAT	2	6	8121	8126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901515
111	NC_009973	GCG	2	6	8149	8154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901515
112	NC_009973	CAG	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
113	NC_009973	CCA	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
114	NC_009973	TGG	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901515
115	NC_009973	CGG	2	6	8451	8456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901515
116	NC_009973	CAG	2	6	8478	8483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
117	NC_009973	TTG	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901515
118	NC_009973	GAT	2	6	8586	8591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901515
119	NC_009973	GCC	2	6	8655	8660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
120	NC_009973	CAG	2	6	8690	8695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
121	NC_009973	TCG	2	6	8713	8718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
122	NC_009973	CAT	2	6	8771	8776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901515
123	NC_009973	AGC	3	9	8848	8856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
124	NC_009973	GTC	2	6	8883	8888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
125	NC_009973	CAC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
126	NC_009973	CAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
127	NC_009973	TGC	3	9	9115	9123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
128	NC_009973	CCG	2	6	9238	9243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901516
129	NC_009973	TTC	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901516
130	NC_009973	TGT	2	6	9364	9369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901516
131	NC_009973	GCT	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901516
132	NC_009973	TCC	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901516
133	NC_009973	AGC	2	6	9480	9485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901516
134	NC_009973	GCT	2	6	9501	9506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901516
135	NC_009973	TGT	2	6	9559	9564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901516
136	NC_009973	GCT	2	6	9990	9995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901516
137	NC_009973	CGA	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901516
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139	NC_009973	TCG	2	6	10653	10658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901517
140	NC_009973	CTC	2	6	10870	10875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901517
141	NC_009973	ACC	2	6	10925	10930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901517
142	NC_009973	CAA	2	6	10936	10941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901517
143	NC_009973	CGG	2	6	11006	11011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901517
144	NC_009973	CCA	2	6	11186	11191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901517
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147	NC_009973	CAC	2	6	11392	11397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901517
148	NC_009973	CCA	2	6	11409	11414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901517
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151	NC_009973	AGG	2	6	11687	11692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901517
152	NC_009973	GAC	2	6	11730	11735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901517
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154	NC_009973	GAC	2	6	11779	11784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901517
155	NC_009973	GCA	2	6	11886	11891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901517
156	NC_009973	CAA	2	6	11997	12002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901517
157	NC_009973	AAT	2	6	12022	12027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901517
158	NC_009973	GCA	2	6	12122	12127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901517
159	NC_009973	GAG	2	6	12139	12144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901517
160	NC_009973	GGT	2	6	12163	12168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901517
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162	NC_009973	TCA	2	6	13104	13109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901518
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164	NC_009973	CGT	2	6	13139	13144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901518
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172	NC_009973	TTC	2	6	13978	13983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901519
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239	NC_009973	TCG	2	6	19901	19906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901523
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241	NC_009973	GAT	2	6	20092	20097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901523
242	NC_009973	GGT	2	6	20106	20111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901523
243	NC_009973	ATC	2	6	20236	20241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901523
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245	NC_009973	TAG	2	6	20368	20373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901523
246	NC_009973	CAC	2	6	20968	20973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901524
247	NC_009973	CTA	2	6	20983	20988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901524
248	NC_009973	AGC	2	6	21086	21091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901524
249	NC_009973	CGA	2	6	21249	21254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901524
250	NC_009973	TGC	2	6	21331	21336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901524
251	NC_009973	TCA	2	6	21432	21437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901524
252	NC_009973	CCG	2	6	21451	21456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901524
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254	NC_009973	GCC	2	6	21572	21577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901524
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