MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	CG	3	6	1244	1249	0 %	0 %	50 %	50 %	159901511
2	NC_009973	AC	3	6	2447	2452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009973	CG	3	6	5037	5042	0 %	0 %	50 %	50 %	159901515
4	NC_009973	GA	3	6	6091	6096	50 %	0 %	50 %	0 %	159901515
5	NC_009973	GC	3	6	10490	10495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009973	AC	3	6	12132	12137	50 %	0 %	0 %	50 %	159901517
7	NC_009973	TC	3	6	13001	13006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009973	CA	3	6	13064	13069	50 %	0 %	0 %	50 %	159901518
9	NC_009973	TG	3	6	14639	14644	0 %	50 %	50 %	0 %	159901519
10	NC_009973	AG	3	6	16740	16745	50 %	0 %	50 %	0 %	159901521
11	NC_009973	CA	3	6	20743	20748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009973	CA	4	8	21344	21351	50 %	0 %	0 %	50 %	159901524
13	NC_009973	CA	3	6	21595	21600	50 %	0 %	0 %	50 %	159901524
14	NC_009973	TA	3	6	22878	22883	50 %	50 %	0 %	0 %	159901526
15	NC_009973	GA	3	6	23172	23177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009973	CA	3	6	25049	25054	50 %	0 %	0 %	50 %	159901529
17	NC_009973	AG	3	6	25259	25264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009973	AT	4	8	25306	25313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009973	AT	3	6	25338	25343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009973	GT	3	6	25735	25740	0 %	50 %	50 %	0 %	159901530
21	NC_009973	TC	3	6	27576	27581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009973	AG	3	6	27632	27637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009973	GT	3	6	27710	27715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009973	CT	3	6	27989	27994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009973	GA	3	6	28201	28206	50 %	0 %	50 %	0 %	159901533
26	NC_009973	TC	3	6	28494	28499	0 %	50 %	0 %	50 %	159901533
27	NC_009973	AC	3	6	28572	28577	50 %	0 %	0 %	50 %	159901533
28	NC_009973	GT	3	6	28813	28818	0 %	50 %	50 %	0 %	159901533
29	NC_009973	AT	3	6	28885	28890	50 %	50 %	0 %	0 %	159901533
30	NC_009973	GT	3	6	29822	29827	0 %	50 %	50 %	0 %	159901534
31	NC_009973	CA	3	6	30066	30071	50 %	0 %	0 %	50 %	159901534
32	NC_009973	GT	3	6	32716	32721	0 %	50 %	50 %	0 %	159901536
33	NC_009973	GC	3	6	34147	34152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009973	CG	3	6	35056	35061	0 %	0 %	50 %	50 %	159901538
35	NC_009973	CA	3	6	35102	35107	50 %	0 %	0 %	50 %	159901538
36	NC_009973	GT	3	6	36952	36957	0 %	50 %	50 %	0 %	159901539
37	NC_009973	TC	3	6	37174	37179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009973	CG	3	6	39141	39146	0 %	0 %	50 %	50 %	159901541
39	NC_009973	CA	3	6	39382	39387	50 %	0 %	0 %	50 %	159901541
40	NC_009973	TC	3	6	39790	39795	0 %	50 %	0 %	50 %	159901541
41	NC_009973	TC	3	6	40248	40253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009973	GT	3	6	41170	41175	0 %	50 %	50 %	0 %	159901542
43	NC_009973	AG	3	6	41411	41416	50 %	0 %	50 %	0 %	159901542
44	NC_009973	TG	3	6	42211	42216	0 %	50 %	50 %	0 %	159901542
45	NC_009973	CG	3	6	42220	42225	0 %	0 %	50 %	50 %	159901542
46	NC_009973	CG	3	6	43748	43753	0 %	0 %	50 %	50 %	159901542
47	NC_009973	GA	3	6	44081	44086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009973	AC	3	6	45050	45055	50 %	0 %	0 %	50 %	159901544
49	NC_009973	GT	3	6	46799	46804	0 %	50 %	50 %	0 %	159901545
50	NC_009973	GT	3	6	47988	47993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009973	CG	3	6	48097	48102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009973	CG	3	6	48764	48769	0 %	0 %	50 %	50 %	159901547
53	NC_009973	TG	3	6	52281	52286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009973	AT	6	12	52768	52779	50 %	50 %	0 %	0 %	159901549
55	NC_009973	CG	3	6	54190	54195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009973	CG	3	6	54724	54729	0 %	0 %	50 %	50 %	159901553
57	NC_009973	GC	3	6	54957	54962	0 %	0 %	50 %	50 %	159901553
58	NC_009973	AG	3	6	55355	55360	50 %	0 %	50 %	0 %	159901553
59	NC_009973	TG	3	6	56356	56361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009973	TG	3	6	56458	56463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009973	CG	3	6	57580	57585	0 %	0 %	50 %	50 %	159901554
62	NC_009973	CT	3	6	58105	58110	0 %	50 %	0 %	50 %	159901555
63	NC_009973	TG	3	6	58322	58327	0 %	50 %	50 %	0 %	159901555
64	NC_009973	GT	3	6	58601	58606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009973	CA	3	6	58755	58760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009973	AT	3	6	58929	58934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009973	GA	3	6	60527	60532	50 %	0 %	50 %	0 %	159901557
68	NC_009973	CG	3	6	60622	60627	0 %	0 %	50 %	50 %	159901557
69	NC_009973	CG	3	6	63822	63827	0 %	0 %	50 %	50 %	159901558
70	NC_009973	TG	3	6	66080	66085	0 %	50 %	50 %	0 %	159901559
71	NC_009973	GT	3	6	66453	66458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009973	CG	3	6	67217	67222	0 %	0 %	50 %	50 %	159901560
73	NC_009973	GT	3	6	67404	67409	0 %	50 %	50 %	0 %	159901560
74	NC_009973	CG	3	6	67790	67795	0 %	0 %	50 %	50 %	159901560
75	NC_009973	CG	3	6	67821	67826	0 %	0 %	50 %	50 %	159901560
76	NC_009973	TG	3	6	67894	67899	0 %	50 %	50 %	0 %	159901560
77	NC_009973	AC	3	6	68088	68093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009973	TG	3	6	69890	69895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009973	GT	3	6	70420	70425	0 %	50 %	50 %	0 %	159901565
80	NC_009973	CG	3	6	70567	70572	0 %	0 %	50 %	50 %	159901565
81	NC_009973	CA	3	6	70895	70900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009973	GT	3	6	70938	70943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009973	CG	3	6	73296	73301	0 %	0 %	50 %	50 %	159901568
84	NC_009973	CA	3	6	73309	73314	50 %	0 %	0 %	50 %	159901568
85	NC_009973	TG	3	6	74127	74132	0 %	50 %	50 %	0 %	159901569
86	NC_009973	CA	3	6	77292	77297	50 %	0 %	0 %	50 %	159901573
87	NC_009973	CG	3	6	78015	78020	0 %	0 %	50 %	50 %	159901574
88	NC_009973	CA	3	6	81154	81159	50 %	0 %	0 %	50 %	159901576
89	NC_009973	CA	3	6	81559	81564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009973	AC	3	6	81593	81598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009973	GC	3	6	82425	82430	0 %	0 %	50 %	50 %	159901578
92	NC_009973	CA	3	6	84179	84184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009973	AT	3	6	84421	84426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009973	AT	3	6	84437	84442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009973	AT	3	6	84811	84816	50 %	50 %	0 %	0 %	159901579
96	NC_009973	AT	3	6	84983	84988	50 %	50 %	0 %	0 %	159901579
97	NC_009973	AT	3	6	86199	86204	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
98	NC_009973	AT	3	6	86262	86267	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
99	NC_009973	AT	3	6	86359	86364	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
100	NC_009973	TA	3	6	86503	86508	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
101	NC_009973	AT	3	6	86595	86600	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
102	NC_009973	TA	3	6	86644	86649	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
103	NC_009973	TA	3	6	86682	86687	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
104	NC_009973	AT	3	6	86711	86716	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
105	NC_009973	AT	3	6	86775	86780	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
106	NC_009973	AT	5	10	87030	87039	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
107	NC_009973	TA	4	8	87480	87487	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
108	NC_009973	AT	3	6	87780	87785	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
109	NC_009973	AT	5	10	87789	87798	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
110	NC_009973	AT	3	6	87915	87920	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
111	NC_009973	AT	3	6	87945	87950	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
112	NC_009973	TA	3	6	88151	88156	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
113	NC_009973	CA	3	6	89493	89498	50 %	0 %	0 %	50 %	159901582
114	NC_009973	GA	3	6	90182	90187	50 %	0 %	50 %	0 %	159901583
115	NC_009973	AT	3	6	90594	90599	50 %	50 %	0 %	0 %	159901583
116	NC_009973	TA	3	6	90669	90674	50 %	50 %	0 %	0 %	159901583
117	NC_009973	CA	3	6	91358	91363	50 %	0 %	0 %	50 %	159901584
118	NC_009973	CG	3	6	91524	91529	0 %	0 %	50 %	50 %	159901584
119	NC_009973	TG	3	6	92961	92966	0 %	50 %	50 %	0 %	159901585
120	NC_009973	CT	3	6	93595	93600	0 %	50 %	0 %	50 %	159901586
121	NC_009973	AC	3	6	100815	100820	50 %	0 %	0 %	50 %	159901591
122	NC_009973	AG	3	6	101892	101897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009973	CT	3	6	106423	106428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009973	AC	3	6	106786	106791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009973	AC	3	6	106930	106935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009973	CT	3	6	109260	109265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009973	CA	3	6	111947	111952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009973	AC	3	6	112023	112028	50 %	0 %	0 %	50 %	159901597
129	NC_009973	TC	3	6	112394	112399	0 %	50 %	0 %	50 %	159901597
130	NC_009973	GT	3	6	112861	112866	0 %	50 %	50 %	0 %	159901597
131	NC_009973	AC	3	6	113184	113189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009973	GT	3	6	113251	113256	0 %	50 %	50 %	0 %	159901598
133	NC_009973	CG	3	6	113260	113265	0 %	0 %	50 %	50 %	159901598
134	NC_009973	AT	3	6	113678	113683	50 %	50 %	0 %	0 %	159901598
135	NC_009973	CG	3	6	113805	113810	0 %	0 %	50 %	50 %	159901598
136	NC_009973	CA	3	6	113829	113834	50 %	0 %	0 %	50 %	159901598
137	NC_009973	AT	3	6	114515	114520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009973	TG	3	6	117955	117960	0 %	50 %	50 %	0 %	159901601
139	NC_009973	CG	3	6	119829	119834	0 %	0 %	50 %	50 %	159901602
140	NC_009973	GT	3	6	122857	122862	0 %	50 %	50 %	0 %	159901605
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142	NC_009973	AG	3	6	125865	125870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009973	TC	4	8	128574	128581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009973	CA	3	6	132351	132356	50 %	0 %	0 %	50 %	159901612
145	NC_009973	CG	3	6	132517	132522	0 %	0 %	50 %	50 %	159901612
146	NC_009973	GC	3	6	133314	133319	0 %	0 %	50 %	50 %	159901612
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.