MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	A	6	6	10636	10641	100 %	0 %	0 %	0 %	159901517
2	NC_009973	A	6	6	11307	11312	100 %	0 %	0 %	0 %	159901517
3	NC_009973	A	6	6	11620	11625	100 %	0 %	0 %	0 %	159901517
4	NC_009973	A	6	6	11833	11838	100 %	0 %	0 %	0 %	159901517
5	NC_009973	A	6	6	12037	12042	100 %	0 %	0 %	0 %	159901517
6	NC_009973	A	6	6	12288	12293	100 %	0 %	0 %	0 %	159901517
7	NC_009973	G	6	6	12375	12380	0 %	0 %	100 %	0 %	159901517
8	NC_009973	A	6	6	13621	13626	100 %	0 %	0 %	0 %	159901518
9	NC_009973	A	6	6	15171	15176	100 %	0 %	0 %	0 %	159901520
10	NC_009973	A	6	6	17405	17410	100 %	0 %	0 %	0 %	159901522
11	NC_009973	T	6	6	18133	18138	0 %	100 %	0 %	0 %	159901523
12	NC_009973	A	6	6	19389	19394	100 %	0 %	0 %	0 %	159901523
13	NC_009973	T	6	6	22340	22345	0 %	100 %	0 %	0 %	159901525
14	NC_009973	T	6	6	22670	22675	0 %	100 %	0 %	0 %	159901525
15	NC_009973	A	6	6	22988	22993	100 %	0 %	0 %	0 %	159901526
16	NC_009973	G	7	7	22994	23000	0 %	0 %	100 %	0 %	159901526
17	NC_009973	A	7	7	23047	23053	100 %	0 %	0 %	0 %	159901526
18	NC_009973	C	6	6	24254	24259	0 %	0 %	0 %	100 %	159901528
19	NC_009973	G	6	6	24533	24538	0 %	0 %	100 %	0 %	159901528
20	NC_009973	A	6	6	27185	27190	100 %	0 %	0 %	0 %	159901532
21	NC_009973	C	6	6	28793	28798	0 %	0 %	0 %	100 %	159901533
22	NC_009973	G	6	6	29798	29803	0 %	0 %	100 %	0 %	159901534
23	NC_009973	A	6	6	32154	32159	100 %	0 %	0 %	0 %	159901536
24	NC_009973	T	6	6	33725	33730	0 %	100 %	0 %	0 %	159901537
25	NC_009973	A	6	6	41980	41985	100 %	0 %	0 %	0 %	159901542
26	NC_009973	T	6	6	50003	50008	0 %	100 %	0 %	0 %	159901548
27	NC_009973	T	7	7	53519	53525	0 %	100 %	0 %	0 %	159901551
28	NC_009973	T	6	6	53860	53865	0 %	100 %	0 %	0 %	159901551
29	NC_009973	T	6	6	63510	63515	0 %	100 %	0 %	0 %	159901558
30	NC_009973	C	6	6	64218	64223	0 %	0 %	0 %	100 %	159901558
31	NC_009973	A	6	6	72385	72390	100 %	0 %	0 %	0 %	159901567
32	NC_009973	C	6	6	78144	78149	0 %	0 %	0 %	100 %	159901574
33	NC_009973	A	6	6	78576	78581	100 %	0 %	0 %	0 %	159901575
34	NC_009973	G	6	6	82332	82337	0 %	0 %	100 %	0 %	159901578
35	NC_009973	T	7	7	82883	82889	0 %	100 %	0 %	0 %	159901578
36	NC_009973	A	8	8	82989	82996	100 %	0 %	0 %	0 %	159901578
37	NC_009973	T	6	6	84458	84463	0 %	100 %	0 %	0 %	159901579
38	NC_009973	A	6	6	84892	84897	100 %	0 %	0 %	0 %	159901579
39	NC_009973	T	6	6	85913	85918	0 %	100 %	0 %	0 %	159901580
40	NC_009973	T	6	6	86286	86291	0 %	100 %	0 %	0 %	159901580
41	NC_009973	T	6	6	87472	87477	0 %	100 %	0 %	0 %	159901580
42	NC_009973	A	7	7	87577	87583	100 %	0 %	0 %	0 %	159901580
43	NC_009973	T	7	7	87594	87600	0 %	100 %	0 %	0 %	159901580
44	NC_009973	T	6	6	87730	87735	0 %	100 %	0 %	0 %	159901581
45	NC_009973	T	6	6	87828	87833	0 %	100 %	0 %	0 %	159901581
46	NC_009973	A	7	7	89205	89211	100 %	0 %	0 %	0 %	159901582
47	NC_009973	G	6	6	90074	90079	0 %	0 %	100 %	0 %	159901583
48	NC_009973	T	7	7	90084	90090	0 %	100 %	0 %	0 %	159901583
49	NC_009973	T	6	6	90748	90753	0 %	100 %	0 %	0 %	159901583
50	NC_009973	C	8	8	91588	91595	0 %	0 %	0 %	100 %	159901584
51	NC_009973	A	6	6	93381	93386	100 %	0 %	0 %	0 %	159901586
52	NC_009973	T	6	6	93552	93557	0 %	100 %	0 %	0 %	159901586
53	NC_009973	T	7	7	94213	94219	0 %	100 %	0 %	0 %	159901586
54	NC_009973	T	6	6	94317	94322	0 %	100 %	0 %	0 %	159901586
55	NC_009973	A	6	6	94857	94862	100 %	0 %	0 %	0 %	159901587
56	NC_009973	T	6	6	96636	96641	0 %	100 %	0 %	0 %	159901589
57	NC_009973	T	6	6	97777	97782	0 %	100 %	0 %	0 %	159901589
58	NC_009973	A	6	6	98278	98283	100 %	0 %	0 %	0 %	159901589
59	NC_009973	A	6	6	98501	98506	100 %	0 %	0 %	0 %	159901589
60	NC_009973	T	6	6	100018	100023	0 %	100 %	0 %	0 %	159901591
61	NC_009973	T	6	6	101218	101223	0 %	100 %	0 %	0 %	159901593
62	NC_009973	A	7	7	110639	110645	100 %	0 %	0 %	0 %	159901595
63	NC_009973	A	6	6	111294	111299	100 %	0 %	0 %	0 %	159901596
64	NC_009973	A	7	7	111589	111595	100 %	0 %	0 %	0 %	159901596
65	NC_009973	T	6	6	112170	112175	0 %	100 %	0 %	0 %	159901597
66	NC_009973	A	8	8	115187	115194	100 %	0 %	0 %	0 %	159901599
67	NC_009973	A	7	7	115864	115870	100 %	0 %	0 %	0 %	159901599
68	NC_009973	A	6	6	116415	116420	100 %	0 %	0 %	0 %	159901600
69	NC_009973	A	8	8	118389	118396	100 %	0 %	0 %	0 %	159901601
70	NC_009973	G	6	6	122182	122187	0 %	0 %	100 %	0 %	159901604
71	NC_009973	T	6	6	123020	123025	0 %	100 %	0 %	0 %	159901606
72	NC_009973	A	7	7	123169	123175	100 %	0 %	0 %	0 %	159901606
73	NC_009973	A	6	6	123677	123682	100 %	0 %	0 %	0 %	159901607
74	NC_009973	A	6	6	123913	123918	100 %	0 %	0 %	0 %	159901607
75	NC_009973	C	7	7	123931	123937	0 %	0 %	0 %	100 %	159901607
76	NC_009973	C	6	6	124252	124257	0 %	0 %	0 %	100 %	159901607
77	NC_009973	G	6	6	127994	127999	0 %	0 %	100 %	0 %	159901609
78	NC_009973	G	6	6	136735	136740	0 %	0 %	100 %	0 %	159901613
79	NC_009973	T	7	7	138752	138758	0 %	100 %	0 %	0 %	159901615
80	NC_009973	T	7	7	139306	139312	0 %	100 %	0 %	0 %	159901616
81	NC_009973	C	6	6	140015	140020	0 %	0 %	0 %	100 %	159901616
82	NC_009973	A	6	6	143264	143269	100 %	0 %	0 %	0 %	159901617
83	NC_009973	A	7	7	149819	149825	100 %	0 %	0 %	0 %	159901621
84	NC_009973	G	6	6	151735	151740	0 %	0 %	100 %	0 %	159901623
85	NC_009973	C	6	6	158285	158290	0 %	0 %	0 %	100 %	159901628
86	NC_009973	G	6	6	160448	160453	0 %	0 %	100 %	0 %	159901629
87	NC_009973	A	6	6	162723	162728	100 %	0 %	0 %	0 %	159901632
88	NC_009973	G	6	6	167919	167924	0 %	0 %	100 %	0 %	159901633
89	NC_009973	T	6	6	170196	170201	0 %	100 %	0 %	0 %	159901634
90	NC_009973	G	6	6	173647	173652	0 %	0 %	100 %	0 %	159901636
91	NC_009973	A	7	7	181822	181828	100 %	0 %	0 %	0 %	159901640
92	NC_009973	A	8	8	183656	183663	100 %	0 %	0 %	0 %	159901643
93	NC_009973	A	7	7	183752	183758	100 %	0 %	0 %	0 %	159901643
94	NC_009973	C	6	6	184094	184099	0 %	0 %	0 %	100 %	159901643
95	NC_009973	T	6	6	185370	185375	0 %	100 %	0 %	0 %	159901643
96	NC_009973	A	7	7	190715	190721	100 %	0 %	0 %	0 %	159901649
97	NC_009973	A	6	6	190942	190947	100 %	0 %	0 %	0 %	159901649
98	NC_009973	A	7	7	190955	190961	100 %	0 %	0 %	0 %	159901649
99	NC_009973	A	6	6	191196	191201	100 %	0 %	0 %	0 %	159901650
100	NC_009973	T	7	7	191403	191409	0 %	100 %	0 %	0 %	159901650
101	NC_009973	A	6	6	191441	191446	100 %	0 %	0 %	0 %	159901650
102	NC_009973	A	6	6	191498	191503	100 %	0 %	0 %	0 %	159901650
103	NC_009973	A	10	10	192229	192238	100 %	0 %	0 %	0 %	159901650
104	NC_009973	A	7	7	194861	194867	100 %	0 %	0 %	0 %	159901652
105	NC_009973	A	6	6	194894	194899	100 %	0 %	0 %	0 %	159901652
106	NC_009973	T	6	6	195050	195055	0 %	100 %	0 %	0 %	159901652
107	NC_009973	G	7	7	196125	196131	0 %	0 %	100 %	0 %	159901653
108	NC_009973	C	6	6	198033	198038	0 %	0 %	0 %	100 %	159901655
109	NC_009973	A	6	6	199245	199250	100 %	0 %	0 %	0 %	159901655
110	NC_009973	A	6	6	200793	200798	100 %	0 %	0 %	0 %	159901655
111	NC_009973	A	6	6	201978	201983	100 %	0 %	0 %	0 %	159901655
112	NC_009973	C	6	6	205802	205807	0 %	0 %	0 %	100 %	159901656
113	NC_009973	G	6	6	210130	210135	0 %	0 %	100 %	0 %	159901656
114	NC_009973	T	7	7	211862	211868	0 %	100 %	0 %	0 %	159901657
115	NC_009973	C	7	7	216581	216587	0 %	0 %	0 %	100 %	159901659
116	NC_009973	T	7	7	217051	217057	0 %	100 %	0 %	0 %	159901659
117	NC_009973	A	8	8	217818	217825	100 %	0 %	0 %	0 %	159901660
118	NC_009973	A	8	8	218883	218890	100 %	0 %	0 %	0 %	159901660
119	NC_009973	A	6	6	220306	220311	100 %	0 %	0 %	0 %	159901661
120	NC_009973	A	6	6	221323	221328	100 %	0 %	0 %	0 %	159901662
121	NC_009973	G	6	6	221504	221509	0 %	0 %	100 %	0 %	159901662
122	NC_009973	G	6	6	223114	223119	0 %	0 %	100 %	0 %	159901663
123	NC_009973	A	6	6	226104	226109	100 %	0 %	0 %	0 %	159901664
124	NC_009973	C	6	6	227142	227147	0 %	0 %	0 %	100 %	159901664
125	NC_009973	C	6	6	227679	227684	0 %	0 %	0 %	100 %	159901664
126	NC_009973	C	6	6	227687	227692	0 %	0 %	0 %	100 %	159901664
127	NC_009973	A	7	7	233304	233310	100 %	0 %	0 %	0 %	159901669
128	NC_009973	T	7	7	234406	234412	0 %	100 %	0 %	0 %	159901671
129	NC_009973	T	7	7	234509	234515	0 %	100 %	0 %	0 %	159901671
130	NC_009973	C	6	6	237539	237544	0 %	0 %	0 %	100 %	159901673
131	NC_009973	A	7	7	239473	239479	100 %	0 %	0 %	0 %	159901674
132	NC_009973	A	6	6	239831	239836	100 %	0 %	0 %	0 %	159901674
133	NC_009973	G	7	7	241126	241132	0 %	0 %	100 %	0 %	159901675
134	NC_009973	T	6	6	241963	241968	0 %	100 %	0 %	0 %	159901676
135	NC_009973	A	6	6	242850	242855	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
136	NC_009973	A	6	6	242980	242985	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
137	NC_009973	T	7	7	242989	242995	0 %	100 %	0 %	0 %	159901676
138	NC_009973	A	6	6	243079	243084	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
139	NC_009973	C	6	6	243661	243666	0 %	0 %	0 %	100 %	159901676
140	NC_009973	A	6	6	244885	244890	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
141	NC_009973	C	6	6	245117	245122	0 %	0 %	0 %	100 %	159901676
142	NC_009973	T	7	7	247074	247080	0 %	100 %	0 %	0 %	159901678
143	NC_009973	A	6	6	253705	253710	100 %	0 %	0 %	0 %	159901681
144	NC_009973	T	6	6	254245	254250	0 %	100 %	0 %	0 %	159901682
145	NC_009973	C	6	6	256386	256391	0 %	0 %	0 %	100 %	159901684
146	NC_009973	A	6	6	261091	261096	100 %	0 %	0 %	0 %	159901689
147	NC_009973	T	6	6	265427	265432	0 %	100 %	0 %	0 %	159901692
148	NC_009973	A	6	6	266484	266489	100 %	0 %	0 %	0 %	159901693
149	NC_009973	T	6	6	274623	274628	0 %	100 %	0 %	0 %	159901698
150	NC_009973	G	6	6	278282	278287	0 %	0 %	100 %	0 %	159901702
151	NC_009973	T	6	6	279314	279319	0 %	100 %	0 %	0 %	159901703
152	NC_009973	G	6	6	279765	279770	0 %	0 %	100 %	0 %	159901703
153	NC_009973	C	6	6	283444	283449	0 %	0 %	0 %	100 %	159901705
154	NC_009973	T	6	6	284049	284054	0 %	100 %	0 %	0 %	159901706
155	NC_009973	A	6	6	290451	290456	100 %	0 %	0 %	0 %	159901710
156	NC_009973	C	6	6	291251	291256	0 %	0 %	0 %	100 %	159901711
157	NC_009973	A	6	6	292084	292089	100 %	0 %	0 %	0 %	159901712
158	NC_009973	A	6	6	293424	293429	100 %	0 %	0 %	0 %	159901713
159	NC_009973	A	6	6	299338	299343	100 %	0 %	0 %	0 %	159901717
160	NC_009973	A	6	6	299474	299479	100 %	0 %	0 %	0 %	159901717
161	NC_009973	A	7	7	299918	299924	100 %	0 %	0 %	0 %	159901718
162	NC_009973	A	6	6	303311	303316	100 %	0 %	0 %	0 %	159901719
163	NC_009973	G	6	6	305153	305158	0 %	0 %	100 %	0 %	159901719
164	NC_009973	A	7	7	306902	306908	100 %	0 %	0 %	0 %	159901721
165	NC_009973	T	6	6	308117	308122	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
166	NC_009973	T	6	6	308151	308156	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
167	NC_009973	T	6	6	308435	308440	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
168	NC_009973	T	6	6	308682	308687	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
169	NC_009973	T	6	6	309080	309085	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
170	NC_009973	A	6	6	309281	309286	100 %	0 %	0 %	0 %	159901724
171	NC_009973	T	6	6	309334	309339	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
172	NC_009973	T	6	6	309583	309588	0 %	100 %	0 %	0 %	159901724
173	NC_009973	A	6	6	315637	315642	100 %	0 %	0 %	0 %	159901726
174	NC_009973	A	6	6	316044	316049	100 %	0 %	0 %	0 %	159901726
175	NC_009973	A	6	6	316259	316264	100 %	0 %	0 %	0 %	159901726
176	NC_009973	T	6	6	317160	317165	0 %	100 %	0 %	0 %	159901726
177	NC_009973	A	6	6	319834	319839	100 %	0 %	0 %	0 %	159901728
178	NC_009973	A	6	6	321527	321532	100 %	0 %	0 %	0 %	159901729
179	NC_009973	A	6	6	323049	323054	100 %	0 %	0 %	0 %	159901731
180	NC_009973	C	6	6	329496	329501	0 %	0 %	0 %	100 %	159901735
181	NC_009973	G	7	7	331011	331017	0 %	0 %	100 %	0 %	159901736
182	NC_009973	T	6	6	331309	331314	0 %	100 %	0 %	0 %	159901736
183	NC_009973	C	6	6	333143	333148	0 %	0 %	0 %	100 %	159901736
184	NC_009973	A	7	7	336045	336051	100 %	0 %	0 %	0 %	159901738
185	NC_009973	G	6	6	336297	336302	0 %	0 %	100 %	0 %	159901738
186	NC_009973	A	7	7	336622	336628	100 %	0 %	0 %	0 %	159901739
187	NC_009973	C	6	6	337508	337513	0 %	0 %	0 %	100 %	159901740
188	NC_009973	C	6	6	338535	338540	0 %	0 %	0 %	100 %	159901741

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.