MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 4870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009972	GCTCA	2	10	871	880	20 %	20 %	20 %	40 %	159896534
2	NC_009972	CGATT	2	10	1766	1775	20 %	40 %	20 %	20 %	159896535
3	NC_009972	TCGTT	2	10	1844	1853	0 %	60 %	20 %	20 %	159896535
4	NC_009972	TAAAC	2	10	2355	2364	60 %	20 %	0 %	20 %	159896535
5	NC_009972	GATAG	2	10	3175	3184	40 %	20 %	40 %	0 %	159896535
6	NC_009972	TTAGC	2	10	3464	3473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009972	CAATC	2	10	4291	4300	40 %	20 %	0 %	40 %	159896536
8	NC_009972	TAGGC	2	10	4406	4415	20 %	20 %	40 %	20 %	159896536
9	NC_009972	GCAAC	2	10	5091	5100	40 %	0 %	20 %	40 %	159896537
10	NC_009972	GATTT	2	10	8225	8234	20 %	60 %	20 %	0 %	159896539
11	NC_009972	TGGGC	2	10	9657	9666	0 %	20 %	60 %	20 %	159896540
12	NC_009972	CAGTT	2	10	13083	13092	20 %	40 %	20 %	20 %	159896545
13	NC_009972	AGCCA	2	10	14722	14731	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009972	CATTC	2	10	16319	16328	20 %	40 %	0 %	40 %	159896547
15	NC_009972	CCAAT	2	10	17837	17846	40 %	20 %	0 %	40 %	159896547
16	NC_009972	TCGAG	2	10	18375	18384	20 %	20 %	40 %	20 %	159896548
17	NC_009972	TGGGT	2	10	19827	19836	0 %	40 %	60 %	0 %	159896549
18	NC_009972	TGGTT	2	10	23749	23758	0 %	60 %	40 %	0 %	159896552
19	NC_009972	GCATT	2	10	25561	25570	20 %	40 %	20 %	20 %	159896554
20	NC_009972	CAGCG	2	10	26050	26059	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009972	TGTGG	2	10	26143	26152	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009972	AACGA	2	10	26598	26607	60 %	0 %	20 %	20 %	159896555
23	NC_009972	CTTGG	2	10	27512	27521	0 %	40 %	40 %	20 %	159896555
24	NC_009972	GTACG	2	10	27559	27568	20 %	20 %	40 %	20 %	159896555
25	NC_009972	CTTGG	2	10	28352	28361	0 %	40 %	40 %	20 %	159896555
26	NC_009972	CTCGC	2	10	28680	28689	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009972	TTGGC	2	10	29425	29434	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
28	NC_009972	TGGCT	2	10	30350	30359	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
29	NC_009972	ACCGC	2	10	34117	34126	20 %	0 %	20 %	60 %	159896560
30	NC_009972	ATTGA	2	10	38544	38553	40 %	40 %	20 %	0 %	159896563
31	NC_009972	CGGTT	2	10	39411	39420	0 %	40 %	40 %	20 %	159896564
32	NC_009972	TTGGT	2	10	39725	39734	0 %	60 %	40 %	0 %	159896564
33	NC_009972	CGAGG	2	10	39906	39915	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009972	CTTGG	2	10	40104	40113	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009972	AGCGT	2	10	40483	40492	20 %	20 %	40 %	20 %	159896565
36	NC_009972	AGCCG	2	10	42594	42603	20 %	0 %	40 %	40 %	159896566
37	NC_009972	AATGC	2	10	43652	43661	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009972	CTCCA	2	10	46283	46292	20 %	20 %	0 %	60 %	159896570
39	NC_009972	TGGCT	2	10	46619	46628	0 %	40 %	40 %	20 %	159896570
40	NC_009972	TCTAT	2	10	48822	48831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009972	CAACC	2	10	49053	49062	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_009972	AGCCT	2	10	49705	49714	20 %	20 %	20 %	40 %	159896573
43	NC_009972	AGATG	2	10	52577	52586	40 %	20 %	40 %	0 %	159896575
44	NC_009972	CAAAC	2	10	54101	54110	60 %	0 %	0 %	40 %	159896577
45	NC_009972	TTTAT	2	10	58125	58134	20 %	80 %	0 %	0 %	159896578
46	NC_009972	AGCCA	2	10	58140	58149	40 %	0 %	20 %	40 %	159896578
47	NC_009972	TTCCC	2	10	59861	59870	0 %	40 %	0 %	60 %	159896578
48	NC_009972	CTTGG	2	10	66693	66702	0 %	40 %	40 %	20 %	159896584
49	NC_009972	TGCGC	2	10	66888	66897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009972	TCGGC	2	10	69106	69115	0 %	20 %	40 %	40 %	159896586
51	NC_009972	TAATT	2	10	69155	69164	40 %	60 %	0 %	0 %	159896586
52	NC_009972	CCCAA	2	10	69391	69400	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_009972	CCAAC	2	10	69449	69458	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_009972	TTGGC	2	10	70574	70583	0 %	40 %	40 %	20 %	159896587
55	NC_009972	TTAAT	2	10	70796	70805	40 %	60 %	0 %	0 %	159896588
56	NC_009972	CAACG	2	10	71629	71638	40 %	0 %	20 %	40 %	159896589
57	NC_009972	TTACA	2	10	74779	74788	40 %	40 %	0 %	20 %	159896592
58	NC_009972	CGCAG	2	10	78472	78481	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009972	AACGC	2	10	79620	79629	40 %	0 %	20 %	40 %	159896595
60	NC_009972	TTGAG	2	10	80190	80199	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009972	AGCAG	2	10	80206	80215	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009972	ATCAA	2	10	81001	81010	60 %	20 %	0 %	20 %	159896596
63	NC_009972	CTTGG	2	10	83895	83904	0 %	40 %	40 %	20 %	159896597
64	NC_009972	TGGCT	2	10	84545	84554	0 %	40 %	40 %	20 %	159896598
65	NC_009972	TTGGC	2	10	84566	84575	0 %	40 %	40 %	20 %	159896598
66	NC_009972	CTTGG	2	10	84789	84798	0 %	40 %	40 %	20 %	159896598
67	NC_009972	GCCGC	2	10	85329	85338	0 %	0 %	40 %	60 %	159896598
68	NC_009972	TGGCG	2	10	85670	85679	0 %	20 %	60 %	20 %	159896598
69	NC_009972	TGGCT	2	10	87729	87738	0 %	40 %	40 %	20 %	159896601
70	NC_009972	TTTGC	2	10	87880	87889	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009972	TTTCG	2	10	87949	87958	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009972	GGCCA	2	10	90371	90380	20 %	0 %	40 %	40 %	159896602
73	NC_009972	TTGGC	2	10	90596	90605	0 %	40 %	40 %	20 %	159896602
74	NC_009972	TGGCG	2	10	91242	91251	0 %	20 %	60 %	20 %	159896603
75	NC_009972	GCAAT	2	10	92171	92180	40 %	20 %	20 %	20 %	159896603
76	NC_009972	CAAGC	2	10	95411	95420	40 %	0 %	20 %	40 %	159896606
77	NC_009972	CCAAA	2	10	97788	97797	60 %	0 %	0 %	40 %	159896608
78	NC_009972	GCGAT	2	10	99610	99619	20 %	20 %	40 %	20 %	159896609
79	NC_009972	GGTAG	2	10	102661	102670	20 %	20 %	60 %	0 %	159896612
80	NC_009972	AATTT	2	10	102905	102914	40 %	60 %	0 %	0 %	159896612
81	NC_009972	TGCCG	2	10	103516	103525	0 %	20 %	40 %	40 %	159896612
82	NC_009972	CGACC	2	10	103575	103584	20 %	0 %	20 %	60 %	159896612
83	NC_009972	CCGAG	2	10	110528	110537	20 %	0 %	40 %	40 %	159896617
84	NC_009972	AAAAC	2	10	112020	112029	80 %	0 %	0 %	20 %	159896619
85	NC_009972	CTCGC	2	10	113255	113264	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_009972	GCAAC	2	10	117926	117935	40 %	0 %	20 %	40 %	159896623
87	NC_009972	GGCTC	2	10	119334	119343	0 %	20 %	40 %	40 %	159896625
88	NC_009972	ATCGC	2	10	125399	125408	20 %	20 %	20 %	40 %	159896630
89	NC_009972	CGGCG	2	10	125817	125826	0 %	0 %	60 %	40 %	159896630
90	NC_009972	GCTAA	2	10	128089	128098	40 %	20 %	20 %	20 %	159896632
91	NC_009972	CTCGC	2	10	132225	132234	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_009972	AGGCT	2	10	132747	132756	20 %	20 %	40 %	20 %	159896636
93	NC_009972	CGCCA	2	10	133876	133885	20 %	0 %	20 %	60 %	159896636
94	NC_009972	CAATA	2	10	134723	134732	60 %	20 %	0 %	20 %	159896636
95	NC_009972	CCCAA	2	10	135404	135413	40 %	0 %	0 %	60 %	159896636
96	NC_009972	GCCAA	2	10	135812	135821	40 %	0 %	20 %	40 %	159896636
97	NC_009972	TGGCT	2	10	137368	137377	0 %	40 %	40 %	20 %	159896637
98	NC_009972	TTGCC	2	10	138534	138543	0 %	40 %	20 %	40 %	159896638
99	NC_009972	ACTAA	2	10	142778	142787	60 %	20 %	0 %	20 %	159896642
100	NC_009972	GCATA	2	10	143372	143381	40 %	20 %	20 %	20 %	159896642
101	NC_009972	TTCAA	2	10	144875	144884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009972	AGTTG	2	10	145111	145120	20 %	40 %	40 %	0 %	159896645
103	NC_009972	AGCTC	2	10	146410	146419	20 %	20 %	20 %	40 %	159896646
104	NC_009972	AGAGT	2	10	146691	146700	40 %	20 %	40 %	0 %	159896646
105	NC_009972	AATTC	2	10	149548	149557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009972	TTAAA	2	10	155641	155650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009972	GGCGC	2	10	158766	158775	0 %	0 %	60 %	40 %	159896658
108	NC_009972	ATGGA	2	10	159133	159142	40 %	20 %	40 %	0 %	159896659
109	NC_009972	GCAGC	2	10	162834	162843	20 %	0 %	40 %	40 %	159896665
110	NC_009972	AGTTA	2	10	164239	164248	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009972	CACGG	2	10	165066	165075	20 %	0 %	40 %	40 %	159896666
112	NC_009972	ATGGT	2	10	165969	165978	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009972	TAGCC	2	10	168309	168318	20 %	20 %	20 %	40 %	159896669
114	NC_009972	ATTTT	2	10	168798	168807	20 %	80 %	0 %	0 %	159896669
115	NC_009972	GCATA	2	10	171343	171352	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009972	ATTGG	2	10	175605	175614	20 %	40 %	40 %	0 %	159896676
117	NC_009972	CTCGC	2	10	176180	176189	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_009972	TGAAT	2	10	176247	176256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009972	TGGCT	2	10	177301	177310	0 %	40 %	40 %	20 %	159896679
120	NC_009972	TTTGA	2	10	177383	177392	20 %	60 %	20 %	0 %	159896679
121	NC_009972	TTGAG	2	10	180127	180136	20 %	40 %	40 %	0 %	159896681
122	NC_009972	ATCGC	2	10	180431	180440	20 %	20 %	20 %	40 %	159896681
123	NC_009972	GGTTG	2	10	180641	180650	0 %	40 %	60 %	0 %	159896682
124	NC_009972	ACTTA	2	10	181540	181549	40 %	40 %	0 %	20 %	159896683
125	NC_009972	CCGCC	2	10	184677	184686	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_009972	CATGC	2	10	184974	184983	20 %	20 %	20 %	40 %	159896687
127	NC_009972	GGGCT	2	10	186202	186211	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009972	TGGGA	2	10	186720	186729	20 %	20 %	60 %	0 %	159896688
129	NC_009972	ATTTT	2	10	186746	186755	20 %	80 %	0 %	0 %	159896688
130	NC_009972	GGCAC	2	10	187761	187770	20 %	0 %	40 %	40 %	159896689
131	NC_009972	GAATT	2	10	188229	188238	40 %	40 %	20 %	0 %	159896690
132	NC_009972	TGGCT	2	10	190283	190292	0 %	40 %	40 %	20 %	159896693
133	NC_009972	ATCAA	2	10	190298	190307	60 %	20 %	0 %	20 %	159896693
134	NC_009972	AATTT	2	10	190578	190587	40 %	60 %	0 %	0 %	159896694
135	NC_009972	GGATG	2	10	192301	192310	20 %	20 %	60 %	0 %	159896694
136	NC_009972	TGGCT	2	10	193266	193275	0 %	40 %	40 %	20 %	159896694
137	NC_009972	GCAGC	2	10	194081	194090	20 %	0 %	40 %	40 %	159896694
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