MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 4079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009972	GCTCA	2	10	871	880	20 %	20 %	20 %	40 %	159896534
2	NC_009972	CGATT	2	10	1766	1775	20 %	40 %	20 %	20 %	159896535
3	NC_009972	TCGTT	2	10	1844	1853	0 %	60 %	20 %	20 %	159896535
4	NC_009972	TAAAC	2	10	2355	2364	60 %	20 %	0 %	20 %	159896535
5	NC_009972	GATAG	2	10	3175	3184	40 %	20 %	40 %	0 %	159896535
6	NC_009972	CAATC	2	10	4291	4300	40 %	20 %	0 %	40 %	159896536
7	NC_009972	TAGGC	2	10	4406	4415	20 %	20 %	40 %	20 %	159896536
8	NC_009972	GCAAC	2	10	5091	5100	40 %	0 %	20 %	40 %	159896537
9	NC_009972	GATTT	2	10	8225	8234	20 %	60 %	20 %	0 %	159896539
10	NC_009972	TGGGC	2	10	9657	9666	0 %	20 %	60 %	20 %	159896540
11	NC_009972	CAGTT	2	10	13083	13092	20 %	40 %	20 %	20 %	159896545
12	NC_009972	CATTC	2	10	16319	16328	20 %	40 %	0 %	40 %	159896547
13	NC_009972	CCAAT	2	10	17837	17846	40 %	20 %	0 %	40 %	159896547
14	NC_009972	TCGAG	2	10	18375	18384	20 %	20 %	40 %	20 %	159896548
15	NC_009972	TGGGT	2	10	19827	19836	0 %	40 %	60 %	0 %	159896549
16	NC_009972	TGGTT	2	10	23749	23758	0 %	60 %	40 %	0 %	159896552
17	NC_009972	GCATT	2	10	25561	25570	20 %	40 %	20 %	20 %	159896554
18	NC_009972	AACGA	2	10	26598	26607	60 %	0 %	20 %	20 %	159896555
19	NC_009972	CTTGG	2	10	27512	27521	0 %	40 %	40 %	20 %	159896555
20	NC_009972	GTACG	2	10	27559	27568	20 %	20 %	40 %	20 %	159896555
21	NC_009972	CTTGG	2	10	28352	28361	0 %	40 %	40 %	20 %	159896555
22	NC_009972	TTGGC	2	10	29425	29434	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
23	NC_009972	TGGCT	2	10	30350	30359	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
24	NC_009972	ACCGC	2	10	34117	34126	20 %	0 %	20 %	60 %	159896560
25	NC_009972	ATTGA	2	10	38544	38553	40 %	40 %	20 %	0 %	159896563
26	NC_009972	CGGTT	2	10	39411	39420	0 %	40 %	40 %	20 %	159896564
27	NC_009972	TTGGT	2	10	39725	39734	0 %	60 %	40 %	0 %	159896564
28	NC_009972	AGCGT	2	10	40483	40492	20 %	20 %	40 %	20 %	159896565
29	NC_009972	AGCCG	2	10	42594	42603	20 %	0 %	40 %	40 %	159896566
30	NC_009972	CTCCA	2	10	46283	46292	20 %	20 %	0 %	60 %	159896570
31	NC_009972	TGGCT	2	10	46619	46628	0 %	40 %	40 %	20 %	159896570
32	NC_009972	AGCCT	2	10	49705	49714	20 %	20 %	20 %	40 %	159896573
33	NC_009972	AGATG	2	10	52577	52586	40 %	20 %	40 %	0 %	159896575
34	NC_009972	CAAAC	2	10	54101	54110	60 %	0 %	0 %	40 %	159896577
35	NC_009972	TTTAT	2	10	58125	58134	20 %	80 %	0 %	0 %	159896578
36	NC_009972	AGCCA	2	10	58140	58149	40 %	0 %	20 %	40 %	159896578
37	NC_009972	TTCCC	2	10	59861	59870	0 %	40 %	0 %	60 %	159896578
38	NC_009972	CTTGG	2	10	66693	66702	0 %	40 %	40 %	20 %	159896584
39	NC_009972	TCGGC	2	10	69106	69115	0 %	20 %	40 %	40 %	159896586
40	NC_009972	TAATT	2	10	69155	69164	40 %	60 %	0 %	0 %	159896586
41	NC_009972	TTGGC	2	10	70574	70583	0 %	40 %	40 %	20 %	159896587
42	NC_009972	TTAAT	2	10	70796	70805	40 %	60 %	0 %	0 %	159896588
43	NC_009972	CAACG	2	10	71629	71638	40 %	0 %	20 %	40 %	159896589
44	NC_009972	TTACA	2	10	74779	74788	40 %	40 %	0 %	20 %	159896592
45	NC_009972	AACGC	2	10	79620	79629	40 %	0 %	20 %	40 %	159896595
46	NC_009972	ATCAA	2	10	81001	81010	60 %	20 %	0 %	20 %	159896596
47	NC_009972	CTTGG	2	10	83895	83904	0 %	40 %	40 %	20 %	159896597
48	NC_009972	TGGCT	2	10	84545	84554	0 %	40 %	40 %	20 %	159896598
49	NC_009972	TTGGC	2	10	84566	84575	0 %	40 %	40 %	20 %	159896598
50	NC_009972	CTTGG	2	10	84789	84798	0 %	40 %	40 %	20 %	159896598
51	NC_009972	GCCGC	2	10	85329	85338	0 %	0 %	40 %	60 %	159896598
52	NC_009972	TGGCG	2	10	85670	85679	0 %	20 %	60 %	20 %	159896598
53	NC_009972	TGGCT	2	10	87729	87738	0 %	40 %	40 %	20 %	159896601
54	NC_009972	GGCCA	2	10	90371	90380	20 %	0 %	40 %	40 %	159896602
55	NC_009972	TTGGC	2	10	90596	90605	0 %	40 %	40 %	20 %	159896602
56	NC_009972	TGGCG	2	10	91242	91251	0 %	20 %	60 %	20 %	159896603
57	NC_009972	GCAAT	2	10	92171	92180	40 %	20 %	20 %	20 %	159896603
58	NC_009972	CAAGC	2	10	95411	95420	40 %	0 %	20 %	40 %	159896606
59	NC_009972	CCAAA	2	10	97788	97797	60 %	0 %	0 %	40 %	159896608
60	NC_009972	GCGAT	2	10	99610	99619	20 %	20 %	40 %	20 %	159896609
61	NC_009972	GGTAG	2	10	102661	102670	20 %	20 %	60 %	0 %	159896612
62	NC_009972	AATTT	2	10	102905	102914	40 %	60 %	0 %	0 %	159896612
63	NC_009972	TGCCG	2	10	103516	103525	0 %	20 %	40 %	40 %	159896612
64	NC_009972	CGACC	2	10	103575	103584	20 %	0 %	20 %	60 %	159896612
65	NC_009972	CCGAG	2	10	110528	110537	20 %	0 %	40 %	40 %	159896617
66	NC_009972	AAAAC	2	10	112020	112029	80 %	0 %	0 %	20 %	159896619
67	NC_009972	GCAAC	2	10	117926	117935	40 %	0 %	20 %	40 %	159896623
68	NC_009972	GGCTC	2	10	119334	119343	0 %	20 %	40 %	40 %	159896625
69	NC_009972	ATCGC	2	10	125399	125408	20 %	20 %	20 %	40 %	159896630
70	NC_009972	CGGCG	2	10	125817	125826	0 %	0 %	60 %	40 %	159896630
71	NC_009972	GCTAA	2	10	128089	128098	40 %	20 %	20 %	20 %	159896632
72	NC_009972	AGGCT	2	10	132747	132756	20 %	20 %	40 %	20 %	159896636
73	NC_009972	CGCCA	2	10	133876	133885	20 %	0 %	20 %	60 %	159896636
74	NC_009972	CAATA	2	10	134723	134732	60 %	20 %	0 %	20 %	159896636
75	NC_009972	CCCAA	2	10	135404	135413	40 %	0 %	0 %	60 %	159896636
76	NC_009972	GCCAA	2	10	135812	135821	40 %	0 %	20 %	40 %	159896636
77	NC_009972	TGGCT	2	10	137368	137377	0 %	40 %	40 %	20 %	159896637
78	NC_009972	TTGCC	2	10	138534	138543	0 %	40 %	20 %	40 %	159896638
79	NC_009972	ACTAA	2	10	142778	142787	60 %	20 %	0 %	20 %	159896642
80	NC_009972	GCATA	2	10	143372	143381	40 %	20 %	20 %	20 %	159896642
81	NC_009972	AGTTG	2	10	145111	145120	20 %	40 %	40 %	0 %	159896645
82	NC_009972	AGCTC	2	10	146410	146419	20 %	20 %	20 %	40 %	159896646
83	NC_009972	AGAGT	2	10	146691	146700	40 %	20 %	40 %	0 %	159896646
84	NC_009972	GGCGC	2	10	158766	158775	0 %	0 %	60 %	40 %	159896658
85	NC_009972	ATGGA	2	10	159133	159142	40 %	20 %	40 %	0 %	159896659
86	NC_009972	GCAGC	2	10	162834	162843	20 %	0 %	40 %	40 %	159896665
87	NC_009972	CACGG	2	10	165066	165075	20 %	0 %	40 %	40 %	159896666
88	NC_009972	TAGCC	2	10	168309	168318	20 %	20 %	20 %	40 %	159896669
89	NC_009972	ATTTT	2	10	168798	168807	20 %	80 %	0 %	0 %	159896669
90	NC_009972	ATTGG	2	10	175605	175614	20 %	40 %	40 %	0 %	159896676
91	NC_009972	TGGCT	2	10	177301	177310	0 %	40 %	40 %	20 %	159896679
92	NC_009972	TTTGA	2	10	177383	177392	20 %	60 %	20 %	0 %	159896679
93	NC_009972	TTGAG	2	10	180127	180136	20 %	40 %	40 %	0 %	159896681
94	NC_009972	ATCGC	2	10	180431	180440	20 %	20 %	20 %	40 %	159896681
95	NC_009972	GGTTG	2	10	180641	180650	0 %	40 %	60 %	0 %	159896682
96	NC_009972	ACTTA	2	10	181540	181549	40 %	40 %	0 %	20 %	159896683
97	NC_009972	CATGC	2	10	184974	184983	20 %	20 %	20 %	40 %	159896687
98	NC_009972	TGGGA	2	10	186720	186729	20 %	20 %	60 %	0 %	159896688
99	NC_009972	ATTTT	2	10	186746	186755	20 %	80 %	0 %	0 %	159896688
100	NC_009972	GGCAC	2	10	187761	187770	20 %	0 %	40 %	40 %	159896689
101	NC_009972	GAATT	2	10	188229	188238	40 %	40 %	20 %	0 %	159896690
102	NC_009972	TGGCT	2	10	190283	190292	0 %	40 %	40 %	20 %	159896693
103	NC_009972	ATCAA	2	10	190298	190307	60 %	20 %	0 %	20 %	159896693
104	NC_009972	AATTT	2	10	190578	190587	40 %	60 %	0 %	0 %	159896694
105	NC_009972	GGATG	2	10	192301	192310	20 %	20 %	60 %	0 %	159896694
106	NC_009972	TGGCT	2	10	193266	193275	0 %	40 %	40 %	20 %	159896694
107	NC_009972	GCAGC	2	10	194081	194090	20 %	0 %	40 %	40 %	159896694
108	NC_009972	GTAGC	2	10	194631	194640	20 %	20 %	40 %	20 %	159896694
109	NC_009972	AGCCT	2	10	195607	195616	20 %	20 %	20 %	40 %	159896695
110	NC_009972	CTTGC	2	10	196959	196968	0 %	40 %	20 %	40 %	159896696
111	NC_009972	TCGGC	2	10	199010	199019	0 %	20 %	40 %	40 %	159896700
112	NC_009972	CCAAG	2	10	199347	199356	40 %	0 %	20 %	40 %	159896700
113	NC_009972	CAATT	2	10	201245	201254	40 %	40 %	0 %	20 %	159896703
114	NC_009972	GCATT	2	10	201282	201291	20 %	40 %	20 %	20 %	159896703
115	NC_009972	GTTTG	2	10	208292	208301	0 %	60 %	40 %	0 %	159896711
116	NC_009972	TCGAT	2	10	209947	209956	20 %	40 %	20 %	20 %	159896713
117	NC_009972	TTTTG	2	10	210251	210260	0 %	80 %	20 %	0 %	159896714
118	NC_009972	GCTCG	2	10	212608	212617	0 %	20 %	40 %	40 %	159896716
119	NC_009972	TTGCC	2	10	216633	216642	0 %	40 %	20 %	40 %	159896721
120	NC_009972	GCGCA	2	10	216830	216839	20 %	0 %	40 %	40 %	159896721
121	NC_009972	TGCCT	2	10	218413	218422	0 %	40 %	20 %	40 %	159896723
122	NC_009972	GCATG	2	10	223244	223253	20 %	20 %	40 %	20 %	159896725
123	NC_009972	ATGGT	2	10	223356	223365	20 %	40 %	40 %	0 %	159896725
124	NC_009972	TGGCT	2	10	224755	224764	0 %	40 %	40 %	20 %	159896725
125	NC_009972	CTTGG	2	10	225578	225587	0 %	40 %	40 %	20 %	159896726
126	NC_009972	TGGCT	2	10	226505	226514	0 %	40 %	40 %	20 %	159896726
127	NC_009972	TTTGG	2	10	227348	227357	0 %	60 %	40 %	0 %	159896727
128	NC_009972	CTGAG	2	10	228763	228772	20 %	20 %	40 %	20 %	159896728
129	NC_009972	GCTTG	2	10	228890	228899	0 %	40 %	40 %	20 %	159896728
130	NC_009972	CCAAG	2	10	229530	229539	40 %	0 %	20 %	40 %	159896728
131	NC_009972	ATGGC	2	10	230093	230102	20 %	20 %	40 %	20 %	159896728
132	NC_009972	ACGGC	2	10	238296	238305	20 %	0 %	40 %	40 %	159896736
133	NC_009972	CGTCA	2	10	240489	240498	20 %	20 %	20 %	40 %	159896738
134	NC_009972	GGCAA	2	10	240643	240652	40 %	0 %	40 %	20 %	159896738
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