MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 19775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009972	CAAC	2	8	430	437	50 %	0 %	0 %	50 %	159896534
2	NC_009972	CAAA	2	8	859	866	75 %	0 %	0 %	25 %	159896534
3	NC_009972	CGCC	2	8	884	891	0 %	0 %	25 %	75 %	159896534
4	NC_009972	CATG	2	8	1390	1397	25 %	25 %	25 %	25 %	159896534
5	NC_009972	AGCC	2	8	2554	2561	25 %	0 %	25 %	50 %	159896535
6	NC_009972	AGCC	2	8	2597	2604	25 %	0 %	25 %	50 %	159896535
7	NC_009972	TTAC	2	8	2703	2710	25 %	50 %	0 %	25 %	159896535
8	NC_009972	ATAG	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	159896535
9	NC_009972	TCAT	2	8	3575	3582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009972	CGAC	2	8	3636	3643	25 %	0 %	25 %	50 %	159896536
11	NC_009972	ATCG	2	8	3671	3678	25 %	25 %	25 %	25 %	159896536
12	NC_009972	ACCA	2	8	4011	4018	50 %	0 %	0 %	50 %	159896536
13	NC_009972	TTGG	2	8	4122	4129	0 %	50 %	50 %	0 %	159896536
14	NC_009972	CAAG	2	8	4174	4181	50 %	0 %	25 %	25 %	159896536
15	NC_009972	GCCC	2	8	4695	4702	0 %	0 %	25 %	75 %	159896537
16	NC_009972	TTCA	2	8	4726	4733	25 %	50 %	0 %	25 %	159896537
17	NC_009972	AACC	2	8	5034	5041	50 %	0 %	0 %	50 %	159896537
18	NC_009972	GCAT	2	8	5450	5457	25 %	25 %	25 %	25 %	159896537
19	NC_009972	GAAT	2	8	6196	6203	50 %	25 %	25 %	0 %	159896538
20	NC_009972	AAAC	2	8	7313	7320	75 %	0 %	0 %	25 %	159896538
21	NC_009972	CAAG	2	8	7520	7527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009972	GCAA	2	8	7851	7858	50 %	0 %	25 %	25 %	159896539
23	NC_009972	AATT	2	8	8969	8976	50 %	50 %	0 %	0 %	159896540
24	NC_009972	CAGC	2	8	9096	9103	25 %	0 %	25 %	50 %	159896540
25	NC_009972	GTTG	2	8	9537	9544	0 %	50 %	50 %	0 %	159896540
26	NC_009972	GCCA	2	8	10341	10348	25 %	0 %	25 %	50 %	159896541
27	NC_009972	ATGG	2	8	11148	11155	25 %	25 %	50 %	0 %	159896543
28	NC_009972	GCCA	2	8	11163	11170	25 %	0 %	25 %	50 %	159896543
29	NC_009972	AAAT	2	8	12015	12022	75 %	25 %	0 %	0 %	159896544
30	NC_009972	TGGC	2	8	13212	13219	0 %	25 %	50 %	25 %	159896545
31	NC_009972	GTTG	2	8	13724	13731	0 %	50 %	50 %	0 %	159896545
32	NC_009972	ATCG	2	8	14027	14034	25 %	25 %	25 %	25 %	159896545
33	NC_009972	ATTG	2	8	14043	14050	25 %	50 %	25 %	0 %	159896545
34	NC_009972	ACCA	2	8	14510	14517	50 %	0 %	0 %	50 %	159896545
35	NC_009972	TGGT	2	8	15382	15389	0 %	50 %	50 %	0 %	159896546
36	NC_009972	TGGG	2	8	16303	16310	0 %	25 %	75 %	0 %	159896547
37	NC_009972	ATGG	2	8	17122	17129	25 %	25 %	50 %	0 %	159896547
38	NC_009972	TCAA	2	8	17447	17454	50 %	25 %	0 %	25 %	159896547
39	NC_009972	GATC	2	8	17511	17518	25 %	25 %	25 %	25 %	159896547
40	NC_009972	ACCA	2	8	17549	17556	50 %	0 %	0 %	50 %	159896547
41	NC_009972	TGCG	2	8	18086	18093	0 %	25 %	50 %	25 %	159896547
42	NC_009972	CTAC	2	8	18812	18819	25 %	25 %	0 %	50 %	159896548
43	NC_009972	CGAA	2	8	19281	19288	50 %	0 %	25 %	25 %	159896548
44	NC_009972	AATG	2	8	19682	19689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009972	TTTC	2	8	19718	19725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009972	GCCA	2	8	20090	20097	25 %	0 %	25 %	50 %	159896549
47	NC_009972	ATGA	2	8	21072	21079	50 %	25 %	25 %	0 %	159896550
48	NC_009972	ACAA	2	8	21763	21770	75 %	0 %	0 %	25 %	159896550
49	NC_009972	TCAA	2	8	22197	22204	50 %	25 %	0 %	25 %	159896551
50	NC_009972	TATG	2	8	22258	22265	25 %	50 %	25 %	0 %	159896551
51	NC_009972	CTAG	2	8	22610	22617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009972	AAGA	2	8	22651	22658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009972	AATC	2	8	22971	22978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009972	CATG	2	8	23491	23498	25 %	25 %	25 %	25 %	159896552
55	NC_009972	TCGT	2	8	23614	23621	0 %	50 %	25 %	25 %	159896552
56	NC_009972	TGCC	2	8	23719	23726	0 %	25 %	25 %	50 %	159896552
57	NC_009972	ATGG	2	8	23977	23984	25 %	25 %	50 %	0 %	159896552
58	NC_009972	CCAA	2	8	24246	24253	50 %	0 %	0 %	50 %	159896552
59	NC_009972	AATA	2	8	24946	24953	75 %	25 %	0 %	0 %	159896554
60	NC_009972	CCGC	2	8	25712	25719	0 %	0 %	25 %	75 %	159896554
61	NC_009972	TGGC	2	8	26506	26513	0 %	25 %	50 %	25 %	159896555
62	NC_009972	AGCC	2	8	27191	27198	25 %	0 %	25 %	50 %	159896555
63	NC_009972	AATC	2	8	27655	27662	50 %	25 %	0 %	25 %	159896555
64	NC_009972	TTGT	2	8	28428	28435	0 %	75 %	25 %	0 %	159896555
65	NC_009972	CAAA	2	8	28745	28752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009972	AGCA	2	8	29497	29504	50 %	0 %	25 %	25 %	159896556
67	NC_009972	GCCA	2	8	30861	30868	25 %	0 %	25 %	50 %	159896556
68	NC_009972	GGCG	2	8	31491	31498	0 %	0 %	75 %	25 %	159896557
69	NC_009972	GCTA	2	8	32147	32154	25 %	25 %	25 %	25 %	159896557
70	NC_009972	CAAT	2	8	32276	32283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009972	CTGA	2	8	32800	32807	25 %	25 %	25 %	25 %	159896558
72	NC_009972	TCGA	2	8	32899	32906	25 %	25 %	25 %	25 %	159896558
73	NC_009972	CAAA	2	8	33414	33421	75 %	0 %	0 %	25 %	159896559
74	NC_009972	AATC	2	8	33899	33906	50 %	25 %	0 %	25 %	159896560
75	NC_009972	CAGC	2	8	33936	33943	25 %	0 %	25 %	50 %	159896560
76	NC_009972	AGCC	2	8	34937	34944	25 %	0 %	25 %	50 %	159896561
77	NC_009972	CCAA	2	8	35179	35186	50 %	0 %	0 %	50 %	159896561
78	NC_009972	ATGA	2	8	35317	35324	50 %	25 %	25 %	0 %	159896561
79	NC_009972	AATA	2	8	35717	35724	75 %	25 %	0 %	0 %	159896561
80	NC_009972	CTGC	2	8	36005	36012	0 %	25 %	25 %	50 %	159896561
81	NC_009972	AGCC	2	8	36062	36069	25 %	0 %	25 %	50 %	159896561
82	NC_009972	AGCC	2	8	36074	36081	25 %	0 %	25 %	50 %	159896561
83	NC_009972	CATC	2	8	36143	36150	25 %	25 %	0 %	50 %	159896561
84	NC_009972	TGCC	2	8	36203	36210	0 %	25 %	25 %	50 %	159896561
85	NC_009972	CAAG	2	8	36404	36411	50 %	0 %	25 %	25 %	159896561
86	NC_009972	AAGC	2	8	36525	36532	50 %	0 %	25 %	25 %	159896561
87	NC_009972	TGCG	2	8	36676	36683	0 %	25 %	50 %	25 %	159896561
88	NC_009972	CCCG	2	8	36803	36810	0 %	0 %	25 %	75 %	159896561
89	NC_009972	TGGT	2	8	37080	37087	0 %	50 %	50 %	0 %	159896562
90	NC_009972	TTGC	2	8	37213	37220	0 %	50 %	25 %	25 %	159896562
91	NC_009972	GCGT	2	8	37560	37567	0 %	25 %	50 %	25 %	159896562
92	NC_009972	TTGA	2	8	38307	38314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009972	GTTT	2	8	38365	38372	0 %	75 %	25 %	0 %	159896563
94	NC_009972	GTTC	2	8	38751	38758	0 %	50 %	25 %	25 %	159896563
95	NC_009972	TAAA	2	8	38792	38799	75 %	25 %	0 %	0 %	159896563
96	NC_009972	GATG	2	8	39096	39103	25 %	25 %	50 %	0 %	159896564
97	NC_009972	TTAT	2	8	39136	39143	25 %	75 %	0 %	0 %	159896564
98	NC_009972	CCAA	2	8	39162	39169	50 %	0 %	0 %	50 %	159896564
99	NC_009972	CCCG	2	8	39898	39905	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_009972	CTCG	2	8	39940	39947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009972	TTGC	2	8	41419	41426	0 %	50 %	25 %	25 %	159896565
102	NC_009972	CATC	2	8	41670	41677	25 %	25 %	0 %	50 %	159896565
103	NC_009972	TCAC	2	8	42583	42590	25 %	25 %	0 %	50 %	159896566
104	NC_009972	ATCA	2	8	42940	42947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009972	ATGG	2	8	43335	43342	25 %	25 %	50 %	0 %	159896567
106	NC_009972	CAAC	2	8	44338	44345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009972	TGGC	2	8	44505	44512	0 %	25 %	50 %	25 %	159896569
108	NC_009972	CAAT	2	8	44863	44870	50 %	25 %	0 %	25 %	159896569
109	NC_009972	GTTG	2	8	45592	45599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009972	AGCT	2	8	45959	45966	25 %	25 %	25 %	25 %	159896570
111	NC_009972	GCAA	2	8	46213	46220	50 %	0 %	25 %	25 %	159896570
112	NC_009972	AACC	2	8	46486	46493	50 %	0 %	0 %	50 %	159896570
113	NC_009972	GCTC	2	8	46563	46570	0 %	25 %	25 %	50 %	159896570
114	NC_009972	TGTT	3	12	46757	46768	0 %	75 %	25 %	0 %	159896570
115	NC_009972	TGGC	2	8	46799	46806	0 %	25 %	50 %	25 %	159896570
116	NC_009972	ACCA	2	8	47025	47032	50 %	0 %	0 %	50 %	159896570
117	NC_009972	CCGC	2	8	47464	47471	0 %	0 %	25 %	75 %	159896570
118	NC_009972	GTTT	2	8	47643	47650	0 %	75 %	25 %	0 %	159896571
119	NC_009972	AGTG	2	8	47822	47829	25 %	25 %	50 %	0 %	159896571
120	NC_009972	TGAA	2	8	47992	47999	50 %	25 %	25 %	0 %	159896571
121	NC_009972	TCGT	2	8	48056	48063	0 %	50 %	25 %	25 %	159896571
122	NC_009972	AATG	2	8	49002	49009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009972	TGGT	2	8	49254	49261	0 %	50 %	50 %	0 %	159896572
124	NC_009972	GGGC	2	8	49282	49289	0 %	0 %	75 %	25 %	159896572
125	NC_009972	AACT	2	8	49297	49304	50 %	25 %	0 %	25 %	159896572
126	NC_009972	GGGC	2	8	49317	49324	0 %	0 %	75 %	25 %	159896572
127	NC_009972	TGGA	2	8	49948	49955	25 %	25 %	50 %	0 %	159896573
128	NC_009972	CAAC	2	8	50152	50159	50 %	0 %	0 %	50 %	159896573
129	NC_009972	TTCG	2	8	50233	50240	0 %	50 %	25 %	25 %	159896573
130	NC_009972	TGGC	2	8	50860	50867	0 %	25 %	50 %	25 %	159896573
131	NC_009972	ATCC	2	8	50896	50903	25 %	25 %	0 %	50 %	159896573
132	NC_009972	GATC	2	8	50924	50931	25 %	25 %	25 %	25 %	159896573
133	NC_009972	AATT	2	8	51388	51395	50 %	50 %	0 %	0 %	159896574
134	NC_009972	TTGC	2	8	51746	51753	0 %	50 %	25 %	25 %	159896575
135	NC_009972	GCTC	2	8	51986	51993	0 %	25 %	25 %	50 %	159896575
136	NC_009972	CCGC	2	8	52008	52015	0 %	0 %	25 %	75 %	159896575
137	NC_009972	GCCC	2	8	53027	53034	0 %	0 %	25 %	75 %	159896576
138	NC_009972	TGAT	2	8	53667	53674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009972	CCCA	2	8	53771	53778	25 %	0 %	0 %	75 %	159896577
140	NC_009972	CCGA	2	8	54389	54396	25 %	0 %	25 %	50 %	159896577
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