MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI05

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009959	CGAT	2	8	241	248	25 %	25 %	25 %	25 %	159046677
2	NC_009959	CGGG	2	8	904	911	0 %	0 %	75 %	25 %	159046677
3	NC_009959	CGCC	2	8	1330	1337	0 %	0 %	25 %	75 %	159046678
4	NC_009959	GCAG	2	8	2682	2689	25 %	0 %	50 %	25 %	159046679
5	NC_009959	TCGA	2	8	2752	2759	25 %	25 %	25 %	25 %	159046679
6	NC_009959	GCGG	2	8	2780	2787	0 %	0 %	75 %	25 %	159046679
7	NC_009959	CCGA	2	8	4076	4083	25 %	0 %	25 %	50 %	159046680
8	NC_009959	AAGG	2	8	4157	4164	50 %	0 %	50 %	0 %	159046680
9	NC_009959	CTGC	2	8	4465	4472	0 %	25 %	25 %	50 %	159046680
10	NC_009959	CTGG	2	8	4558	4565	0 %	25 %	50 %	25 %	159046680
11	NC_009959	CCCA	2	8	4694	4701	25 %	0 %	0 %	75 %	159046680
12	NC_009959	GATG	2	8	4948	4955	25 %	25 %	50 %	0 %	159046680
13	NC_009959	AGGC	2	8	5124	5131	25 %	0 %	50 %	25 %	159046680
14	NC_009959	CGGG	2	8	5742	5749	0 %	0 %	75 %	25 %	251833004
15	NC_009959	GTCG	2	8	6863	6870	0 %	25 %	50 %	25 %	159046682
16	NC_009959	GCGG	2	8	7785	7792	0 %	0 %	75 %	25 %	159046683
17	NC_009959	CGGG	2	8	9210	9217	0 %	0 %	75 %	25 %	159046684
18	NC_009959	TGGC	2	8	9624	9631	0 %	25 %	50 %	25 %	159046684
19	NC_009959	GGCA	2	8	9905	9912	25 %	0 %	50 %	25 %	159046685
20	NC_009959	CGGT	2	8	10290	10297	0 %	25 %	50 %	25 %	159046685
21	NC_009959	CGGG	2	8	10301	10308	0 %	0 %	75 %	25 %	159046685
22	NC_009959	GTCG	2	8	10613	10620	0 %	25 %	50 %	25 %	159046685
23	NC_009959	GCCA	2	8	10937	10944	25 %	0 %	25 %	50 %	159046686
24	NC_009959	GCAG	2	8	11112	11119	25 %	0 %	50 %	25 %	159046686
25	NC_009959	CCGC	2	8	11839	11846	0 %	0 %	25 %	75 %	159046686
26	NC_009959	GGCA	2	8	12011	12018	25 %	0 %	50 %	25 %	159046686
27	NC_009959	GCGG	2	8	12449	12456	0 %	0 %	75 %	25 %	159046687
28	NC_009959	CGCC	2	8	12788	12795	0 %	0 %	25 %	75 %	159046687
29	NC_009959	GCAG	2	8	13578	13585	25 %	0 %	50 %	25 %	159046688
30	NC_009959	CGCC	2	8	13593	13600	0 %	0 %	25 %	75 %	159046688
31	NC_009959	GCCC	2	8	13911	13918	0 %	0 %	25 %	75 %	159046688
32	NC_009959	CAGC	2	8	14002	14009	25 %	0 %	25 %	50 %	159046688
33	NC_009959	CGGG	2	8	14250	14257	0 %	0 %	75 %	25 %	159046689
34	NC_009959	GCCA	2	8	15038	15045	25 %	0 %	25 %	50 %	159046689
35	NC_009959	CTGC	2	8	15132	15139	0 %	25 %	25 %	50 %	159046689
36	NC_009959	CTGG	2	8	15198	15205	0 %	25 %	50 %	25 %	159046690
37	NC_009959	CGCC	2	8	15527	15534	0 %	0 %	25 %	75 %	159046690
38	NC_009959	CCAC	2	8	15911	15918	25 %	0 %	0 %	75 %	159046690
39	NC_009959	CAGC	2	8	15945	15952	25 %	0 %	25 %	50 %	159046690
40	NC_009959	GCCC	2	8	15956	15963	0 %	0 %	25 %	75 %	159046690
41	NC_009959	CGCC	2	8	16421	16428	0 %	0 %	25 %	75 %	159046690
42	NC_009959	CCCG	2	8	16637	16644	0 %	0 %	25 %	75 %	159046690
43	NC_009959	AGCC	2	8	17163	17170	25 %	0 %	25 %	50 %	159046691
44	NC_009959	CGCC	2	8	17197	17204	0 %	0 %	25 %	75 %	159046691
45	NC_009959	CGGG	2	8	18480	18487	0 %	0 %	75 %	25 %	159046693
46	NC_009959	CTGG	2	8	18817	18824	0 %	25 %	50 %	25 %	159046693
47	NC_009959	GCAG	2	8	18943	18950	25 %	0 %	50 %	25 %	159046693
48	NC_009959	CTGG	2	8	19405	19412	0 %	25 %	50 %	25 %	159046693
49	NC_009959	TGGG	2	8	19571	19578	0 %	25 %	75 %	0 %	159046693
50	NC_009959	GGCG	2	8	19726	19733	0 %	0 %	75 %	25 %	159046693
51	NC_009959	CCCG	2	8	20731	20738	0 %	0 %	25 %	75 %	159046694
52	NC_009959	GCAG	2	8	20974	20981	25 %	0 %	50 %	25 %	159046694
53	NC_009959	GCGG	2	8	23001	23008	0 %	0 %	75 %	25 %	159046696
54	NC_009959	GGCT	2	8	23139	23146	0 %	25 %	50 %	25 %	159046696
55	NC_009959	GCTC	2	8	24588	24595	0 %	25 %	25 %	50 %	251833005
56	NC_009959	GCCA	2	8	24659	24666	25 %	0 %	25 %	50 %	251833005
57	NC_009959	CCGC	2	8	25699	25706	0 %	0 %	25 %	75 %	159046699
58	NC_009959	GCCC	2	8	25842	25849	0 %	0 %	25 %	75 %	159046699
59	NC_009959	TTTC	2	8	26267	26274	0 %	75 %	0 %	25 %	159046700
60	NC_009959	GCAT	2	8	26473	26480	25 %	25 %	25 %	25 %	159046700
61	NC_009959	GAGG	2	8	27066	27073	25 %	0 %	75 %	0 %	159046700
62	NC_009959	CGGG	2	8	27856	27863	0 %	0 %	75 %	25 %	159046701
63	NC_009959	CGTC	2	8	27950	27957	0 %	25 %	25 %	50 %	159046701
64	NC_009959	GGCG	2	8	28674	28681	0 %	0 %	75 %	25 %	159046703
65	NC_009959	TGGC	2	8	29853	29860	0 %	25 %	50 %	25 %	159046705
66	NC_009959	CATC	2	8	30322	30329	25 %	25 %	0 %	50 %	159046705
67	NC_009959	CCCG	2	8	31632	31639	0 %	0 %	25 %	75 %	159046708
68	NC_009959	CGGG	2	8	32756	32763	0 %	0 %	75 %	25 %	159046709
69	NC_009959	CTCG	2	8	32782	32789	0 %	25 %	25 %	50 %	159046709
70	NC_009959	AGCG	2	8	35271	35278	25 %	0 %	50 %	25 %	159046712
71	NC_009959	CGGG	2	8	35677	35684	0 %	0 %	75 %	25 %	159046712
72	NC_009959	CCGC	2	8	36455	36462	0 %	0 %	25 %	75 %	159046713
73	NC_009959	GCGG	2	8	36577	36584	0 %	0 %	75 %	25 %	159046713
74	NC_009959	CCGA	2	8	36766	36773	25 %	0 %	25 %	50 %	159046713
75	NC_009959	GAAG	2	8	37092	37099	50 %	0 %	50 %	0 %	159046713
76	NC_009959	GTCG	2	8	37395	37402	0 %	25 %	50 %	25 %	159046714
77	NC_009959	CTCG	2	8	38133	38140	0 %	25 %	25 %	50 %	159046714
78	NC_009959	ACCG	2	8	38400	38407	25 %	0 %	25 %	50 %	159046715
79	NC_009959	CCGC	2	8	38443	38450	0 %	0 %	25 %	75 %	159046715
80	NC_009959	GCCC	2	8	38717	38724	0 %	0 %	25 %	75 %	159046715
81	NC_009959	GTCG	2	8	39055	39062	0 %	25 %	50 %	25 %	159046716
82	NC_009959	GGCG	2	8	39169	39176	0 %	0 %	75 %	25 %	159046716
83	NC_009959	GCTC	2	8	39237	39244	0 %	25 %	25 %	50 %	159046716
84	NC_009959	GGGC	2	8	39247	39254	0 %	0 %	75 %	25 %	159046716
85	NC_009959	CTGG	2	8	39547	39554	0 %	25 %	50 %	25 %	159046716
86	NC_009959	GGGC	2	8	40440	40447	0 %	0 %	75 %	25 %	159046717
87	NC_009959	GCCC	2	8	40578	40585	0 %	0 %	25 %	75 %	159046717
88	NC_009959	CCCG	2	8	41140	41147	0 %	0 %	25 %	75 %	159046717
89	NC_009959	CCGA	2	8	42349	42356	25 %	0 %	25 %	50 %	159046718
90	NC_009959	CGAG	2	8	42416	42423	25 %	0 %	50 %	25 %	159046718
91	NC_009959	CCCG	2	8	42567	42574	0 %	0 %	25 %	75 %	159046718
92	NC_009959	CAGC	2	8	45071	45078	25 %	0 %	25 %	50 %	159046721
93	NC_009959	CGGG	2	8	45223	45230	0 %	0 %	75 %	25 %	159046721
94	NC_009959	CGAC	2	8	45544	45551	25 %	0 %	25 %	50 %	159046721
95	NC_009959	TGGG	2	8	48406	48413	0 %	25 %	75 %	0 %	159046725
96	NC_009959	CCGC	2	8	48641	48648	0 %	0 %	25 %	75 %	159046725
97	NC_009959	CCGC	2	8	48656	48663	0 %	0 %	25 %	75 %	159046725
98	NC_009959	AGGC	2	8	50665	50672	25 %	0 %	50 %	25 %	159046726
99	NC_009959	CTGG	2	8	51443	51450	0 %	25 %	50 %	25 %	159046726
100	NC_009959	GCCT	2	8	54117	54124	0 %	25 %	25 %	50 %	159046729
101	NC_009959	GCCG	2	8	54628	54635	0 %	0 %	50 %	50 %	159046730
102	NC_009959	GGTC	2	8	57788	57795	0 %	25 %	50 %	25 %	159046732
103	NC_009959	ATGG	2	8	57888	57895	25 %	25 %	50 %	0 %	159046732
104	NC_009959	GGCG	2	8	58655	58662	0 %	0 %	75 %	25 %	159046734
105	NC_009959	GCGG	2	8	59509	59516	0 %	0 %	75 %	25 %	159046735
106	NC_009959	CGGC	2	8	59908	59915	0 %	0 %	50 %	50 %	159046735
107	NC_009959	CGCC	2	8	60170	60177	0 %	0 %	25 %	75 %	159046736
108	NC_009959	GCGG	2	8	60496	60503	0 %	0 %	75 %	25 %	159046736
109	NC_009959	GTGG	2	8	60672	60679	0 %	25 %	75 %	0 %	159046736
110	NC_009959	GCGG	2	8	61299	61306	0 %	0 %	75 %	25 %	159046736
111	NC_009959	GCGG	2	8	62650	62657	0 %	0 %	75 %	25 %	159046737
112	NC_009959	GCTC	2	8	63270	63277	0 %	25 %	25 %	50 %	159046738
113	NC_009959	GCGG	2	8	64114	64121	0 %	0 %	75 %	25 %	159046739
114	NC_009959	CGGT	2	8	64189	64196	0 %	25 %	50 %	25 %	159046739
115	NC_009959	TCGT	2	8	64550	64557	0 %	50 %	25 %	25 %	159046739
116	NC_009959	GCGG	2	8	64792	64799	0 %	0 %	75 %	25 %	159046739
117	NC_009959	CGCC	2	8	65149	65156	0 %	0 %	25 %	75 %	159046740
118	NC_009959	CGCC	2	8	65565	65572	0 %	0 %	25 %	75 %	159046740
119	NC_009959	GGCG	2	8	66469	66476	0 %	0 %	75 %	25 %	159046741
120	NC_009959	TGGG	2	8	67442	67449	0 %	25 %	75 %	0 %	159046742
121	NC_009959	GGGC	2	8	69363	69370	0 %	0 %	75 %	25 %	159046744
122	NC_009959	CGGG	2	8	69632	69639	0 %	0 %	75 %	25 %	159046744
123	NC_009959	CCTG	2	8	70361	70368	0 %	25 %	25 %	50 %	159046745
124	NC_009959	TGCC	2	8	70411	70418	0 %	25 %	25 %	50 %	159046745
125	NC_009959	CGAT	2	8	70907	70914	25 %	25 %	25 %	25 %	159046746
126	NC_009959	GGCA	2	8	70935	70942	25 %	0 %	50 %	25 %	159046746
127	NC_009959	CGGC	2	8	71187	71194	0 %	0 %	50 %	50 %	159046747
128	NC_009959	CTGG	2	8	71581	71588	0 %	25 %	50 %	25 %	159046748
129	NC_009959	CTGG	2	8	71986	71993	0 %	25 %	50 %	25 %	251833006
130	NC_009959	ACCT	2	8	72074	72081	25 %	25 %	0 %	50 %	251833006
131	NC_009959	TGGC	2	8	72232	72239	0 %	25 %	50 %	25 %	251833006

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.