MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI05

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009959	GC	3	6	451	456	0 %	0 %	50 %	50 %	159046677
2	NC_009959	GC	3	6	782	787	0 %	0 %	50 %	50 %	159046677
3	NC_009959	CG	3	6	948	953	0 %	0 %	50 %	50 %	159046677
4	NC_009959	GC	3	6	1525	1530	0 %	0 %	50 %	50 %	159046678
5	NC_009959	CG	3	6	1984	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
6	NC_009959	GC	3	6	3196	3201	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
7	NC_009959	GC	3	6	3210	3215	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
8	NC_009959	GC	3	6	3226	3231	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
9	NC_009959	GC	3	6	3421	3426	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
10	NC_009959	GC	4	8	3713	3720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009959	CG	3	6	4044	4049	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
12	NC_009959	CG	5	10	4289	4298	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
13	NC_009959	GC	3	6	4374	4379	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
14	NC_009959	GC	3	6	4965	4970	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
15	NC_009959	GC	3	6	6092	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	251833004
16	NC_009959	CG	3	6	7013	7018	0 %	0 %	50 %	50 %	159046682
17	NC_009959	GC	3	6	7060	7065	0 %	0 %	50 %	50 %	159046682
18	NC_009959	CG	3	6	8065	8070	0 %	0 %	50 %	50 %	159046683
19	NC_009959	GC	3	6	8485	8490	0 %	0 %	50 %	50 %	159046683
20	NC_009959	AT	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	159046684
21	NC_009959	CG	4	8	9546	9553	0 %	0 %	50 %	50 %	159046684
22	NC_009959	CG	3	6	9555	9560	0 %	0 %	50 %	50 %	159046684
23	NC_009959	CG	3	6	9699	9704	0 %	0 %	50 %	50 %	159046684
24	NC_009959	CG	3	6	9791	9796	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
25	NC_009959	CG	4	8	9816	9823	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
26	NC_009959	GC	4	8	10195	10202	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
27	NC_009959	GC	3	6	10270	10275	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
28	NC_009959	GC	3	6	10355	10360	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
29	NC_009959	GC	3	6	10987	10992	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
30	NC_009959	CG	3	6	11042	11047	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
31	NC_009959	CG	3	6	11379	11384	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
32	NC_009959	CG	3	6	11689	11694	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
33	NC_009959	GC	3	6	12150	12155	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
34	NC_009959	GC	3	6	12700	12705	0 %	0 %	50 %	50 %	159046687
35	NC_009959	CG	3	6	12894	12899	0 %	0 %	50 %	50 %	159046687
36	NC_009959	CG	3	6	13404	13409	0 %	0 %	50 %	50 %	159046688
37	NC_009959	GC	3	6	13815	13820	0 %	0 %	50 %	50 %	159046688
38	NC_009959	GC	3	6	14618	14623	0 %	0 %	50 %	50 %	159046689
39	NC_009959	CG	3	6	14863	14868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046689
40	NC_009959	CG	3	6	15427	15432	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
41	NC_009959	CG	3	6	16041	16046	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
42	NC_009959	GC	3	6	16081	16086	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
43	NC_009959	CG	3	6	16143	16148	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
44	NC_009959	GC	3	6	16186	16191	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
45	NC_009959	CG	3	6	16359	16364	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
46	NC_009959	GC	3	6	16618	16623	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
47	NC_009959	GC	3	6	16763	16768	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
48	NC_009959	CG	3	6	17124	17129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046691
49	NC_009959	GC	3	6	18224	18229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009959	GC	3	6	18346	18351	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
51	NC_009959	GC	3	6	18634	18639	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
52	NC_009959	GC	4	8	19138	19145	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
53	NC_009959	CG	3	6	19199	19204	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
54	NC_009959	CG	4	8	19279	19286	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
55	NC_009959	GC	3	6	19506	19511	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
56	NC_009959	GC	3	6	19544	19549	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
57	NC_009959	CG	3	6	19678	19683	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
58	NC_009959	CG	4	8	19971	19978	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
59	NC_009959	CG	3	6	20368	20373	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
60	NC_009959	GC	3	6	20628	20633	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
61	NC_009959	CG	4	8	21014	21021	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
62	NC_009959	GC	3	6	21284	21289	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
63	NC_009959	GC	3	6	21316	21321	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
64	NC_009959	GC	3	6	21360	21365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009959	GC	3	6	21958	21963	0 %	0 %	50 %	50 %	159046695
66	NC_009959	GC	3	6	22262	22267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046695
67	NC_009959	CG	3	6	22302	22307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009959	TC	3	6	22378	22383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009959	CA	3	6	22411	22416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009959	GA	3	6	22418	22423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009959	CG	4	8	22655	22662	0 %	0 %	50 %	50 %	159046696
72	NC_009959	CG	3	6	22767	22772	0 %	0 %	50 %	50 %	159046696
73	NC_009959	GC	3	6	23400	23405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009959	CG	3	6	23631	23636	0 %	0 %	50 %	50 %	159046697
75	NC_009959	CG	3	6	23806	23811	0 %	0 %	50 %	50 %	159046697
76	NC_009959	GC	5	10	24031	24040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009959	CG	3	6	24544	24549	0 %	0 %	50 %	50 %	251833005
78	NC_009959	CG	4	8	25062	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	251833005
79	NC_009959	GC	3	6	25070	25075	0 %	0 %	50 %	50 %	251833005
80	NC_009959	GC	3	6	25122	25127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009959	CG	3	6	25163	25168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009959	CG	3	6	25186	25191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009959	CG	3	6	25683	25688	0 %	0 %	50 %	50 %	159046699
84	NC_009959	CG	4	8	25882	25889	0 %	0 %	50 %	50 %	159046699
85	NC_009959	GC	3	6	25983	25988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009959	CG	3	6	26035	26040	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
87	NC_009959	CG	3	6	26538	26543	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
88	NC_009959	GC	3	6	26618	26623	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
89	NC_009959	GC	3	6	26997	27002	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
90	NC_009959	TC	3	6	27339	27344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009959	GC	4	8	27400	27407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009959	CG	3	6	27416	27421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009959	GC	3	6	27594	27599	0 %	0 %	50 %	50 %	159046701
94	NC_009959	GC	3	6	27970	27975	0 %	0 %	50 %	50 %	159046701
95	NC_009959	CG	3	6	28051	28056	0 %	0 %	50 %	50 %	159046701
96	NC_009959	GC	4	8	28629	28636	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
97	NC_009959	CG	3	6	28733	28738	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
98	NC_009959	CG	3	6	28843	28848	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
99	NC_009959	GC	3	6	28863	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
100	NC_009959	CG	4	8	28919	28926	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
101	NC_009959	TC	3	6	28968	28973	0 %	50 %	0 %	50 %	159046703
102	NC_009959	CG	4	8	29048	29055	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
103	NC_009959	TC	3	6	29139	29144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009959	GC	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009959	CG	3	6	29263	29268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009959	CG	3	6	29597	29602	0 %	0 %	50 %	50 %	159046705
107	NC_009959	CG	3	6	29910	29915	0 %	0 %	50 %	50 %	159046705
108	NC_009959	GC	3	6	30412	30417	0 %	0 %	50 %	50 %	159046705
109	NC_009959	CG	3	6	30777	30782	0 %	0 %	50 %	50 %	159046706
110	NC_009959	CG	3	6	30973	30978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009959	GC	3	6	31013	31018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009959	CG	4	8	31028	31035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009959	CG	4	8	31831	31838	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
114	NC_009959	CG	3	6	31860	31865	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
115	NC_009959	CG	3	6	31886	31891	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
116	NC_009959	GC	4	8	31927	31934	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
117	NC_009959	GC	4	8	32181	32188	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
118	NC_009959	CA	3	6	32297	32302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009959	GC	3	6	32680	32685	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
120	NC_009959	CG	3	6	32788	32793	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
121	NC_009959	CG	3	6	32975	32980	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
122	NC_009959	GC	3	6	33117	33122	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
123	NC_009959	CG	3	6	33389	33394	0 %	0 %	50 %	50 %	159046710
124	NC_009959	GC	3	6	33433	33438	0 %	0 %	50 %	50 %	159046710
125	NC_009959	CG	3	6	34217	34222	0 %	0 %	50 %	50 %	159046711
126	NC_009959	CG	3	6	34341	34346	0 %	0 %	50 %	50 %	159046711
127	NC_009959	CG	3	6	35053	35058	0 %	0 %	50 %	50 %	159046712
128	NC_009959	CG	3	6	35410	35415	0 %	0 %	50 %	50 %	159046712
129	NC_009959	CG	3	6	35428	35433	0 %	0 %	50 %	50 %	159046712
130	NC_009959	GC	3	6	35808	35813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009959	CG	3	6	36065	36070	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
132	NC_009959	GC	3	6	36157	36162	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
133	NC_009959	GC	3	6	36344	36349	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
134	NC_009959	CG	3	6	36492	36497	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
135	NC_009959	GC	4	8	37100	37107	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
136	NC_009959	CA	3	6	37268	37273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009959	GC	3	6	37367	37372	0 %	0 %	50 %	50 %	159046714
138	NC_009959	CG	3	6	38262	38267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046714
139	NC_009959	CG	3	6	38496	38501	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
140	NC_009959	GC	3	6	38577	38582	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
141	NC_009959	GC	4	8	38742	38749	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
142	NC_009959	CG	3	6	39224	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
143	NC_009959	GC	3	6	39480	39485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
144	NC_009959	CG	3	6	39620	39625	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
145	NC_009959	GC	3	6	40845	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.