MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI05

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009959	GC	3	6	451	456	0 %	0 %	50 %	50 %	159046677
2	NC_009959	GC	3	6	782	787	0 %	0 %	50 %	50 %	159046677
3	NC_009959	CG	3	6	948	953	0 %	0 %	50 %	50 %	159046677
4	NC_009959	GC	3	6	1525	1530	0 %	0 %	50 %	50 %	159046678
5	NC_009959	CG	3	6	1984	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
6	NC_009959	GC	3	6	3196	3201	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
7	NC_009959	GC	3	6	3210	3215	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
8	NC_009959	GC	3	6	3226	3231	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
9	NC_009959	GC	3	6	3421	3426	0 %	0 %	50 %	50 %	159046679
10	NC_009959	CG	3	6	4044	4049	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
11	NC_009959	CG	5	10	4289	4298	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
12	NC_009959	GC	3	6	4374	4379	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
13	NC_009959	GC	3	6	4965	4970	0 %	0 %	50 %	50 %	159046680
14	NC_009959	GC	3	6	6092	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	251833004
15	NC_009959	CG	3	6	7013	7018	0 %	0 %	50 %	50 %	159046682
16	NC_009959	GC	3	6	7060	7065	0 %	0 %	50 %	50 %	159046682
17	NC_009959	CG	3	6	8065	8070	0 %	0 %	50 %	50 %	159046683
18	NC_009959	GC	3	6	8485	8490	0 %	0 %	50 %	50 %	159046683
19	NC_009959	AT	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	159046684
20	NC_009959	CG	4	8	9546	9553	0 %	0 %	50 %	50 %	159046684
21	NC_009959	CG	3	6	9555	9560	0 %	0 %	50 %	50 %	159046684
22	NC_009959	CG	3	6	9699	9704	0 %	0 %	50 %	50 %	159046684
23	NC_009959	CG	3	6	9791	9796	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
24	NC_009959	CG	4	8	9816	9823	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
25	NC_009959	GC	4	8	10195	10202	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
26	NC_009959	GC	3	6	10270	10275	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
27	NC_009959	GC	3	6	10355	10360	0 %	0 %	50 %	50 %	159046685
28	NC_009959	GC	3	6	10987	10992	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
29	NC_009959	CG	3	6	11042	11047	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
30	NC_009959	CG	3	6	11379	11384	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
31	NC_009959	CG	3	6	11689	11694	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
32	NC_009959	GC	3	6	12150	12155	0 %	0 %	50 %	50 %	159046686
33	NC_009959	GC	3	6	12700	12705	0 %	0 %	50 %	50 %	159046687
34	NC_009959	CG	3	6	12894	12899	0 %	0 %	50 %	50 %	159046687
35	NC_009959	CG	3	6	13404	13409	0 %	0 %	50 %	50 %	159046688
36	NC_009959	GC	3	6	13815	13820	0 %	0 %	50 %	50 %	159046688
37	NC_009959	GC	3	6	14618	14623	0 %	0 %	50 %	50 %	159046689
38	NC_009959	CG	3	6	14863	14868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046689
39	NC_009959	CG	3	6	15427	15432	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
40	NC_009959	CG	3	6	16041	16046	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
41	NC_009959	GC	3	6	16081	16086	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
42	NC_009959	CG	3	6	16143	16148	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
43	NC_009959	GC	3	6	16186	16191	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
44	NC_009959	CG	3	6	16359	16364	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
45	NC_009959	GC	3	6	16618	16623	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
46	NC_009959	GC	3	6	16763	16768	0 %	0 %	50 %	50 %	159046690
47	NC_009959	CG	3	6	17124	17129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046691
48	NC_009959	GC	3	6	18346	18351	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
49	NC_009959	GC	3	6	18634	18639	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
50	NC_009959	GC	4	8	19138	19145	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
51	NC_009959	CG	3	6	19199	19204	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
52	NC_009959	CG	4	8	19279	19286	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
53	NC_009959	GC	3	6	19506	19511	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
54	NC_009959	GC	3	6	19544	19549	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
55	NC_009959	CG	3	6	19678	19683	0 %	0 %	50 %	50 %	159046693
56	NC_009959	CG	4	8	19971	19978	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
57	NC_009959	CG	3	6	20368	20373	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
58	NC_009959	GC	3	6	20628	20633	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
59	NC_009959	CG	4	8	21014	21021	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
60	NC_009959	GC	3	6	21284	21289	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
61	NC_009959	GC	3	6	21316	21321	0 %	0 %	50 %	50 %	159046694
62	NC_009959	GC	3	6	21958	21963	0 %	0 %	50 %	50 %	159046695
63	NC_009959	GC	3	6	22262	22267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046695
64	NC_009959	CG	4	8	22655	22662	0 %	0 %	50 %	50 %	159046696
65	NC_009959	CG	3	6	22767	22772	0 %	0 %	50 %	50 %	159046696
66	NC_009959	CG	3	6	23631	23636	0 %	0 %	50 %	50 %	159046697
67	NC_009959	CG	3	6	23806	23811	0 %	0 %	50 %	50 %	159046697
68	NC_009959	CG	3	6	24544	24549	0 %	0 %	50 %	50 %	251833005
69	NC_009959	CG	4	8	25062	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	251833005
70	NC_009959	GC	3	6	25070	25075	0 %	0 %	50 %	50 %	251833005
71	NC_009959	CG	3	6	25683	25688	0 %	0 %	50 %	50 %	159046699
72	NC_009959	CG	4	8	25882	25889	0 %	0 %	50 %	50 %	159046699
73	NC_009959	CG	3	6	26035	26040	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
74	NC_009959	CG	3	6	26538	26543	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
75	NC_009959	GC	3	6	26618	26623	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
76	NC_009959	GC	3	6	26997	27002	0 %	0 %	50 %	50 %	159046700
77	NC_009959	GC	3	6	27594	27599	0 %	0 %	50 %	50 %	159046701
78	NC_009959	GC	3	6	27970	27975	0 %	0 %	50 %	50 %	159046701
79	NC_009959	CG	3	6	28051	28056	0 %	0 %	50 %	50 %	159046701
80	NC_009959	GC	4	8	28629	28636	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
81	NC_009959	CG	3	6	28733	28738	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
82	NC_009959	CG	3	6	28843	28848	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
83	NC_009959	GC	3	6	28863	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
84	NC_009959	CG	4	8	28919	28926	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
85	NC_009959	TC	3	6	28968	28973	0 %	50 %	0 %	50 %	159046703
86	NC_009959	CG	4	8	29048	29055	0 %	0 %	50 %	50 %	159046703
87	NC_009959	CG	3	6	29597	29602	0 %	0 %	50 %	50 %	159046705
88	NC_009959	CG	3	6	29910	29915	0 %	0 %	50 %	50 %	159046705
89	NC_009959	GC	3	6	30412	30417	0 %	0 %	50 %	50 %	159046705
90	NC_009959	CG	3	6	30777	30782	0 %	0 %	50 %	50 %	159046706
91	NC_009959	CG	4	8	31831	31838	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
92	NC_009959	CG	3	6	31860	31865	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
93	NC_009959	CG	3	6	31886	31891	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
94	NC_009959	GC	4	8	31927	31934	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
95	NC_009959	GC	4	8	32181	32188	0 %	0 %	50 %	50 %	159046708
96	NC_009959	GC	3	6	32680	32685	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
97	NC_009959	CG	3	6	32788	32793	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
98	NC_009959	CG	3	6	32975	32980	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
99	NC_009959	GC	3	6	33117	33122	0 %	0 %	50 %	50 %	159046709
100	NC_009959	CG	3	6	33389	33394	0 %	0 %	50 %	50 %	159046710
101	NC_009959	GC	3	6	33433	33438	0 %	0 %	50 %	50 %	159046710
102	NC_009959	CG	3	6	34217	34222	0 %	0 %	50 %	50 %	159046711
103	NC_009959	CG	3	6	34341	34346	0 %	0 %	50 %	50 %	159046711
104	NC_009959	CG	3	6	35053	35058	0 %	0 %	50 %	50 %	159046712
105	NC_009959	CG	3	6	35410	35415	0 %	0 %	50 %	50 %	159046712
106	NC_009959	CG	3	6	35428	35433	0 %	0 %	50 %	50 %	159046712
107	NC_009959	CG	3	6	36065	36070	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
108	NC_009959	GC	3	6	36157	36162	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
109	NC_009959	GC	3	6	36344	36349	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
110	NC_009959	CG	3	6	36492	36497	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
111	NC_009959	GC	4	8	37100	37107	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
112	NC_009959	GC	3	6	37367	37372	0 %	0 %	50 %	50 %	159046714
113	NC_009959	CG	3	6	38262	38267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046714
114	NC_009959	CG	3	6	38496	38501	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
115	NC_009959	GC	3	6	38577	38582	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
116	NC_009959	GC	4	8	38742	38749	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
117	NC_009959	CG	3	6	39224	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
118	NC_009959	GC	3	6	39480	39485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
119	NC_009959	CG	3	6	39620	39625	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
120	NC_009959	GC	3	6	40845	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
121	NC_009959	GC	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
122	NC_009959	GC	4	8	41337	41344	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
123	NC_009959	GC	3	6	42020	42025	0 %	0 %	50 %	50 %	159046718
124	NC_009959	GC	3	6	42244	42249	0 %	0 %	50 %	50 %	159046718
125	NC_009959	GC	3	6	42584	42589	0 %	0 %	50 %	50 %	159046718
126	NC_009959	CG	3	6	42789	42794	0 %	0 %	50 %	50 %	159046718
127	NC_009959	GC	3	6	43069	43074	0 %	0 %	50 %	50 %	159046718
128	NC_009959	CG	4	8	43785	43792	0 %	0 %	50 %	50 %	159046719
129	NC_009959	GC	3	6	44077	44082	0 %	0 %	50 %	50 %	159046720
130	NC_009959	CG	3	6	44101	44106	0 %	0 %	50 %	50 %	159046720
131	NC_009959	GC	3	6	44824	44829	0 %	0 %	50 %	50 %	159046720
132	NC_009959	GC	3	6	45106	45111	0 %	0 %	50 %	50 %	159046721
133	NC_009959	GC	3	6	45207	45212	0 %	0 %	50 %	50 %	159046721
134	NC_009959	CG	3	6	46134	46139	0 %	0 %	50 %	50 %	159046722
135	NC_009959	GC	3	6	46960	46965	0 %	0 %	50 %	50 %	159046723
136	NC_009959	CG	3	6	47300	47305	0 %	0 %	50 %	50 %	159046723
137	NC_009959	CG	4	8	47402	47409	0 %	0 %	50 %	50 %	159046723
138	NC_009959	GC	3	6	47697	47702	0 %	0 %	50 %	50 %	159046724
139	NC_009959	CG	3	6	47957	47962	0 %	0 %	50 %	50 %	159046724
140	NC_009959	GC	3	6	49404	49409	0 %	0 %	50 %	50 %	159046725
141	NC_009959	CG	3	6	49512	49517	0 %	0 %	50 %	50 %	159046725
142	NC_009959	CG	3	6	49721	49726	0 %	0 %	50 %	50 %	159046725
143	NC_009959	GC	3	6	50424	50429	0 %	0 %	50 %	50 %	159046725
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.