MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI04

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009958	GCGGT	2	10	914	923	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009958	TGGAA	2	10	1085	1094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009958	GGCAT	2	10	1426	1435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009958	CGCAG	2	10	2945	2954	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009958	TATTT	2	10	3040	3049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009958	CGGGT	2	10	6753	6762	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009958	AGGGC	2	10	11543	11552	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009958	GTCTG	2	10	12034	12043	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009958	ATTCA	2	10	12092	12101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009958	TGCGC	2	10	13842	13851	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009958	GCAGC	2	10	16221	16230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009958	GATGC	2	10	23653	23662	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009958	TCCCC	2	10	28385	28394	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_009958	CCGTG	2	10	29020	29029	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009958	GCAGG	2	10	29800	29809	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009958	GGTCG	2	10	37547	37556	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009958	GCACG	2	10	38416	38425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009958	TTGGA	2	10	39164	39173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009958	GTTGC	2	10	45324	45333	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009958	TATAA	2	10	46394	46403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009958	GGGTC	2	10	52349	52358	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009958	CGCAG	2	10	56726	56735	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009958	CGCAG	2	10	65620	65629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009958	TGGGG	2	10	70666	70675	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009958	GCGCC	2	10	81883	81892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009958	TGCGG	2	10	84256	84265	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009958	TCCGG	2	10	84276	84285	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009958	CAGAT	2	10	85515	85524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.