MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI04

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009958	TTTC	2	8	830	837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009958	CACG	2	8	1136	1143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009958	CCAT	2	8	1809	1816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009958	GCCA	2	8	1885	1892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009958	CGCA	2	8	1941	1948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009958	CAGT	2	8	2303	2310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009958	TTTC	2	8	6544	6551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009958	CCTG	2	8	6624	6631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009958	CCGG	2	8	7184	7191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009958	CGGT	2	8	7845	7852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009958	AATC	2	8	8088	8095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009958	CTTC	2	8	8705	8712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009958	GCAG	2	8	11527	11534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009958	CAAC	2	8	13549	13556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009958	CTGG	2	8	13831	13838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009958	CAGG	2	8	15807	15814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009958	TTGA	2	8	19380	19387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009958	CAGC	2	8	21324	21331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009958	CGAC	2	8	23701	23708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009958	CAGG	2	8	24158	24165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009958	TACA	2	8	26231	26238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009958	AAGC	2	8	26446	26453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009958	CTGG	2	8	27314	27321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009958	GCCT	2	8	27622	27629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009958	GGCA	2	8	28194	28201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009958	CACG	2	8	28403	28410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009958	AGGT	2	8	28444	28451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009958	TCGC	2	8	28753	28760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009958	CGAC	2	8	28882	28889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009958	CGAG	2	8	29437	29444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009958	CCAG	2	8	29536	29543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009958	AGCG	2	8	29963	29970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009958	AGCT	2	8	31847	31854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009958	GTTG	2	8	31899	31906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009958	GATC	2	8	32741	32748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009958	ACCA	2	8	34086	34093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009958	GCAA	2	8	35095	35102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009958	TGCC	2	8	39021	39028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009958	GACC	2	8	45410	45417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009958	GGAC	2	8	45557	45564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009958	CTGT	2	8	46277	46284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009958	GCGT	2	8	50618	50625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009958	GGAA	2	8	52363	52370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009958	CAGT	2	8	56084	56091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009958	ATCC	2	8	56767	56774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009958	CTCG	2	8	56975	56982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009958	ATCA	2	8	59804	59811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009958	CCGC	2	8	59902	59909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_009958	GCTG	2	8	62070	62077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009958	CAGT	2	8	64978	64985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009958	CTGT	2	8	79655	79662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009958	CAAT	2	8	84368	84375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009958	TGTC	2	8	85591	85598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009958	GCGT	2	8	86139	86146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009958	CTTC	2	8	86184	86191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.