MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI04

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009958	GT	3	6	2143	2148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009958	TG	3	6	2701	2706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009958	AC	3	6	2773	2778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009958	TC	3	6	3066	3071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009958	GC	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	159046607
6	NC_009958	TC	3	6	6384	6389	0 %	50 %	0 %	50 %	159046607
7	NC_009958	AG	3	6	6455	6460	50 %	0 %	50 %	0 %	159046607
8	NC_009958	GC	3	6	7372	7377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009958	CG	4	8	7503	7510	0 %	0 %	50 %	50 %	159046608
10	NC_009958	AG	3	6	8365	8370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009958	GT	3	6	8407	8412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009958	GC	3	6	8590	8595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009958	GC	3	6	8922	8927	0 %	0 %	50 %	50 %	159046609
14	NC_009958	GC	3	6	9040	9045	0 %	0 %	50 %	50 %	159046609
15	NC_009958	CG	4	8	10176	10183	0 %	0 %	50 %	50 %	159046610
16	NC_009958	GC	4	8	10214	10221	0 %	0 %	50 %	50 %	159046610
17	NC_009958	CG	3	6	10308	10313	0 %	0 %	50 %	50 %	159046610
18	NC_009958	CA	3	6	10341	10346	50 %	0 %	0 %	50 %	159046610
19	NC_009958	GC	3	6	12512	12517	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
20	NC_009958	CG	3	6	12653	12658	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
21	NC_009958	GC	3	6	12764	12769	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
22	NC_009958	CA	3	6	13121	13126	50 %	0 %	0 %	50 %	159046613
23	NC_009958	CG	3	6	13147	13152	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
24	NC_009958	TA	3	6	13783	13788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009958	GC	3	6	14112	14117	0 %	0 %	50 %	50 %	159046614
26	NC_009958	CG	4	8	14170	14177	0 %	0 %	50 %	50 %	159046614
27	NC_009958	CG	3	6	15354	15359	0 %	0 %	50 %	50 %	159046614
28	NC_009958	TG	3	6	16206	16211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009958	TC	3	6	17283	17288	0 %	50 %	0 %	50 %	159046616
30	NC_009958	CA	4	8	17497	17504	50 %	0 %	0 %	50 %	159046616
31	NC_009958	CG	3	6	17967	17972	0 %	0 %	50 %	50 %	159046616
32	NC_009958	CG	3	6	18191	18196	0 %	0 %	50 %	50 %	159046616
33	NC_009958	CA	3	6	18268	18273	50 %	0 %	0 %	50 %	159046616
34	NC_009958	AT	3	6	19361	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009958	GC	3	6	19480	19485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046618
36	NC_009958	CG	3	6	19514	19519	0 %	0 %	50 %	50 %	159046618
37	NC_009958	GC	3	6	19798	19803	0 %	0 %	50 %	50 %	159046618
38	NC_009958	CG	3	6	20154	20159	0 %	0 %	50 %	50 %	159046619
39	NC_009958	CG	3	6	21288	21293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009958	GC	3	6	21419	21424	0 %	0 %	50 %	50 %	159046623
41	NC_009958	AG	3	6	21778	21783	50 %	0 %	50 %	0 %	159046623
42	NC_009958	GC	3	6	22350	22355	0 %	0 %	50 %	50 %	159046624
43	NC_009958	CA	4	8	22589	22596	50 %	0 %	0 %	50 %	159046625
44	NC_009958	GC	3	6	23218	23223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009958	TC	3	6	23600	23605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009958	AC	3	6	24584	24589	50 %	0 %	0 %	50 %	159046626
47	NC_009958	CG	3	6	24912	24917	0 %	0 %	50 %	50 %	159046626
48	NC_009958	CG	3	6	25101	25106	0 %	0 %	50 %	50 %	159046626
49	NC_009958	CG	3	6	25264	25269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009958	TG	4	8	25297	25304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009958	GA	3	6	25367	25372	50 %	0 %	50 %	0 %	159046627
52	NC_009958	TG	3	6	25913	25918	0 %	50 %	50 %	0 %	159046628
53	NC_009958	GC	3	6	26043	26048	0 %	0 %	50 %	50 %	159046628
54	NC_009958	TG	3	6	26244	26249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009958	TG	3	6	26282	26287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009958	GC	3	6	26852	26857	0 %	0 %	50 %	50 %	159046629
57	NC_009958	GC	3	6	27297	27302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009958	CA	3	6	27659	27664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009958	CG	3	6	27965	27970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009958	CG	3	6	29199	29204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009958	GC	3	6	29946	29951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009958	CG	3	6	30164	30169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009958	CT	3	6	30388	30393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009958	TC	3	6	30468	30473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009958	GC	3	6	31084	31089	0 %	0 %	50 %	50 %	159046631
66	NC_009958	CT	3	6	31202	31207	0 %	50 %	0 %	50 %	159046631
67	NC_009958	CG	3	6	31389	31394	0 %	0 %	50 %	50 %	159046631
68	NC_009958	GT	3	6	31687	31692	0 %	50 %	50 %	0 %	159046631
69	NC_009958	CG	3	6	34057	34062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009958	GC	4	8	34639	34646	0 %	0 %	50 %	50 %	159046634
71	NC_009958	CT	3	6	35106	35111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009958	AT	3	6	35259	35264	50 %	50 %	0 %	0 %	159046635
73	NC_009958	CG	3	6	35794	35799	0 %	0 %	50 %	50 %	159046635
74	NC_009958	TC	3	6	36173	36178	0 %	50 %	0 %	50 %	159046635
75	NC_009958	TC	3	6	36316	36321	0 %	50 %	0 %	50 %	159046635
76	NC_009958	CG	3	6	36715	36720	0 %	0 %	50 %	50 %	159046636
77	NC_009958	GC	3	6	36731	36736	0 %	0 %	50 %	50 %	159046636
78	NC_009958	GC	3	6	37479	37484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009958	CG	3	6	37644	37649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009958	GC	3	6	37702	37707	0 %	0 %	50 %	50 %	159046637
81	NC_009958	CG	3	6	38120	38125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009958	AC	3	6	39050	39055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009958	CG	3	6	39464	39469	0 %	0 %	50 %	50 %	159046638
84	NC_009958	GC	3	6	39549	39554	0 %	0 %	50 %	50 %	159046638
85	NC_009958	GC	3	6	39698	39703	0 %	0 %	50 %	50 %	159046638
86	NC_009958	CG	3	6	39856	39861	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
87	NC_009958	GC	3	6	40096	40101	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
88	NC_009958	GC	3	6	40116	40121	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
89	NC_009958	GC	3	6	40449	40454	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
90	NC_009958	CG	3	6	40673	40678	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
91	NC_009958	GC	3	6	40875	40880	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
92	NC_009958	GC	3	6	41676	41681	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
93	NC_009958	GC	3	6	43261	43266	0 %	0 %	50 %	50 %	159046640
94	NC_009958	CG	3	6	43629	43634	0 %	0 %	50 %	50 %	159046640
95	NC_009958	GC	3	6	43699	43704	0 %	0 %	50 %	50 %	159046640
96	NC_009958	CT	3	6	44721	44726	0 %	50 %	0 %	50 %	159046640
97	NC_009958	TC	3	6	45491	45496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009958	CT	3	6	45571	45576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009958	GA	3	6	45985	45990	50 %	0 %	50 %	0 %	159046642
100	NC_009958	GC	3	6	46233	46238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009958	CG	4	8	46322	46329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009958	GC	3	6	47305	47310	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
103	NC_009958	GC	3	6	47475	47480	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
104	NC_009958	CG	3	6	47844	47849	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
105	NC_009958	CG	3	6	47965	47970	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
106	NC_009958	CG	3	6	48071	48076	0 %	0 %	50 %	50 %	159046645
107	NC_009958	CG	4	8	48405	48412	0 %	0 %	50 %	50 %	159046645
108	NC_009958	CG	3	6	48522	48527	0 %	0 %	50 %	50 %	159046645
109	NC_009958	GC	3	6	48977	48982	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
110	NC_009958	GC	3	6	49244	49249	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
111	NC_009958	CG	4	8	49505	49512	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
112	NC_009958	CG	3	6	49640	49645	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
113	NC_009958	GC	3	6	49938	49943	0 %	0 %	50 %	50 %	159046647
114	NC_009958	GC	3	6	50048	50053	0 %	0 %	50 %	50 %	159046647
115	NC_009958	GC	3	6	50302	50307	0 %	0 %	50 %	50 %	159046647
116	NC_009958	GC	3	6	51039	51044	0 %	0 %	50 %	50 %	159046648
117	NC_009958	CG	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	159046648
118	NC_009958	CG	3	6	52201	52206	0 %	0 %	50 %	50 %	159046649
119	NC_009958	CG	3	6	52605	52610	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
120	NC_009958	GC	3	6	53384	53389	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
121	NC_009958	GC	3	6	53432	53437	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
122	NC_009958	GC	3	6	53587	53592	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
123	NC_009958	GC	3	6	53882	53887	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
124	NC_009958	GC	3	6	54298	54303	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
125	NC_009958	CG	3	6	54559	54564	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
126	NC_009958	GT	3	6	55924	55929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009958	TG	3	6	56482	56487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009958	AC	3	6	56554	56559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009958	GT	3	6	56993	56998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009958	GC	3	6	58275	58280	0 %	0 %	50 %	50 %	159046652
131	NC_009958	CG	3	6	58927	58932	0 %	0 %	50 %	50 %	159046652
132	NC_009958	CG	3	6	59276	59281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009958	GC	3	6	60849	60854	0 %	0 %	50 %	50 %	159046654
134	NC_009958	GC	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	159046654
135	NC_009958	AG	3	6	61050	61055	50 %	0 %	50 %	0 %	159046654
136	NC_009958	GT	3	6	61203	61208	0 %	50 %	50 %	0 %	159046654
137	NC_009958	CG	3	6	61526	61531	0 %	0 %	50 %	50 %	159046654
138	NC_009958	GC	3	6	62119	62124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009958	GC	3	6	62502	62507	0 %	0 %	50 %	50 %	159046655
140	NC_009958	GT	3	6	64818	64823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009958	TG	3	6	65376	65381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009958	AC	3	6	65448	65453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009958	GA	3	6	65739	65744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009958	GC	3	6	65982	65987	0 %	0 %	50 %	50 %	159046656
145	NC_009958	CG	3	6	66514	66519	0 %	0 %	50 %	50 %	159046657
146	NC_009958	AC	3	6	66749	66754	50 %	0 %	0 %	50 %	159046658
147	NC_009958	CG	3	6	66767	66772	0 %	0 %	50 %	50 %	159046658
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.